允许。两位作者合发是完全没有问题的，职称论文很多情况下都可以是数人共同发表的，一些发表国外高水平学术论文的作者人数甚至高达十几人二十几人。我们国家的事业单位很多，科研院所，高等院校，检测机构等等，都是事业单位。这些单位，每天都在发大量的科技论文。他们中的一些人，本职工作就是搞科研，写论文。所以，只要不涉及国家机密，事业单位是完全可以发论文的。
论文两人同为一作，即论文共同第一作者。报考博士，有已经发表的论文，会带来更多的机会。而对论文的要求，会因报考的学校而异。若有明确规定，不认可共同一作，则两人同为一作是有影响的。而没有这方面规定，则论文两人同为一作，就会被认可，只是相对于独立第一作者而言，认可度更低一些。
看你论文是否署名是2人,如果是,可以要求2个证书.但若是奖杯,通常只有一只.
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