1、你说的论文是否在你申请专利时已公开？ 如果公开了，就会破坏你的专利的新颖性。2、初步审查不进行新颖性的审查，仅仅审查形式问题和一些其它问题，一般都会通过。3、实质审查需要审查的问题比较多，除了新颖性、创造性、实用性，还需要审查是否公开充分，是否清楚的限定权利要求等等。4、专利公开后，不会被国知局撤销，会一直处于公开状态。但申请人可以撤回专利，撤回专利并不会影响专利的公开状态，只代表申请人放弃了获得专利权的权利。
论文发表了吗？在专利申请前发表会影响新颖性说明书可以参照论文内容，权利要求书最好不要，以免缩小保护范围
第一，应确定对方发明专利的有效性，也就是说，是否已经授权，是否处于有效状态；否则不侵权第二，专利侵权是针对以商业目的的产品侵权，你的论文应被认为是商业产品，因此不侵权第三，你提到，“基本上是一样的”，也就是说，不完全一样，因此也不会发生著作权侵权
如果论文已经发表，则属于现有技术，发表的内容会影响专利的新颖性，不利于授权。可在专利申请文件中着重描述那些论文中没有直接公开的内容。
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饕餮江江
