小小亦儿
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如下：
1、根据学术论文内容选择合适的期刊
文不对题的卷子肯定是没分的。投稿也一样，你的东西和杂志社要的东西风马牛不相及，分分钟就给你拒稿了。因此投稿前务必要结合自己的论文内容，选择合适对口的期刊。
举个简单的例子，如果你研究的是肠道，而你把论文投稿到了一个心血管领域的杂志，不用多说，一投过去，就会被人家拒绝。
因此，投稿前，建议多查找google, 梅斯医学等网站，确定我们自己所在领域的相关期刊，挑选几个合适的，放在自己的备选投稿杂志中，再做斟酌。
2、按期刊要求准备相应的投稿材料
投稿材料的构成多种多样，主体上包括一封给主编的信件（cover letter）, 论文的所有文件（包括文字稿，相关图片视频表格等任何支持我们文章的东西），资助的基金信息等。
细节上，每个杂志社会有一些区别，建议大家投稿前多阅读杂志官网投稿界面上的作者须知（author guidelines），细致地了解杂志社对你的稿件包括总体框架，文字格式，图片清晰度，文件大小等的要求，这些都会有细致的描述。
3、上传所有投稿材料文件
在根据期刊要求准备好所有材料之后，我们就可以到投稿网站注册一个个人账户，登录（submission site），开始提交稿件（submit new manuscript）。
投稿系统会要求你依次上传相关文件，填些所有作者信息，填些基金信息等，最后生成一个pdf格式的预览件，这时候我们可以查看整个pdf文件上有没有漏填了一些东西或者一些填些错误，如果存在，可以返回重新编辑。
当检查无误后，就可以确认提交（approve）。此时投稿就结束了，这时候的稿件状态就会显示（Manuscript Submitted）。
4、等待审稿结果及相关处理
投稿之后，会有以下流程，当然不同期刊，不完全相同。
过了三到四天，稿件会先到主编手里，这时候显示With Editor，如果主编认可你的文章，那么就会分配给副编辑（associate editor），状态就会显示Under Review。
审稿的时间根据不同杂志有2周到几个月不等，这时候associate editor就会把文章另外发送至两到三个审稿人，这就叫送外审。
过了漫长的等待期，状态变为Required Review Completed，这时候表明审稿已经结束了，associate editor已经整理审稿人的意见并给出自己的意见发送回editor了。
最后，你的稿件又重新回到了editor手中，这时候状态就会显示Decision in Process，editor会根据返回的审稿意见，召集编辑们讨论，最终确定结果。
返回的可能结果：
Accept 直接返回接收的可能性一般很小，往往都会有一些意见。
minor revision 传说中的小修。
major revision 传说中的大修。
这两种情况，需要根据返回的修稿意见逐条核对，该补实验的补实验，该改文章的改文章，从而达到审稿人的要求。返回杂志社时，会重新送到审稿人手中，再进行一轮审稿。
reject 拒稿。原因包括东西不符合我们的要求，稿件的质量欠佳等等。这时候你就要退而求其次，选择备选杂志中的其他要求降低的杂志进行再次投稿。
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一篇学术论文投稿的所有流程是：
第一：写论文
第二：论文排版，由于论文投稿前，很多期刊都要求按照期刊规定论文模板格式对论文进 行调整，以便审稿专家观看，所以需要去所投期刊官网上面去下载论文格式模板(一般期刊都会有提供word版本的格式模板)，下载后，严格按照要求调整好格式。第三：登录所投期刊官网，然后去注册一个账号用于投稿
第四：用账号登录期刊官网，进入投稿系统入口(一般期刊网上会有相应提示)，按照投稿 系统流程一步一步弄即可(最好是用IE浏览器来投稿，兼容性比较强)
第五：上传稿件，一般投稿系统流程中的最后一步就是上次word版本的稿件，这个时候一定要再次看看被上传的word是否是自己论文的最终版，不要传错了
第六：收到邮件回复，表示杂志社已经收到稿件，部分杂志社会同时要求交纳审稿费，并给出 审稿费汇款地址，需要去邮局汇款审稿费(汇款时一定要写上文章编号)
第七：等待录用即可。SCI源刊无疑是最权威的，这里要说明的是，已经没有SCI会议论文这个说法了，因为SCI数据库已经不再接受会议论文。只接受期刊论文。
EI源刊也是属于比较权威的文章，但是EI源刊是允许有中文稿件存在的，如果是投国内的EI源刊，那么其录用难度与国外一般的SCI难度其实相当了。当然EI源刊中也有水刊，EI公司以前是每年更新一次EI目录，现在是每个月更新一次，所以现在如果投比较水的EI源刊，有一定风险。
中文核心算是比较权威的国内期刊论文，现在是每3年更新一次。但是中文核心中，有些期刊可能既是中文核心，又是EI源刊，这种期刊一般录用难度都很大。
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