学院学科在长期的建设中,凝练形成了“水产品高值化加工与利用”、“南海生物活性物质研究与开发”、“水产食品安全与质量控制”、“特色农产品精深加工”4个稳定和特色鲜明的研究方向,研究范畴覆盖了食品科学与工程学科所涵盖的二级学科全部领域。这些研究方向积极开展创新性研究,多项科研成果获省级以上科学技术奖,部分研究成果达到国内领先水平。承担了一大批科研项目,取得了多项科研成果。根据“广东海洋大学食品科技学院”官网资料 ,五年里,承担国家自然基金、国家支撑计划、国家863计划等各类课题共125项,在研到帐经费1641.74万元。发表论文383篇,其中SCI、EI收录45篇;出版学术专著6部;获国家级、省部级等各级科学技术奖17项次,其中,章超桦教授主研的(第二完成人)“大宗低值蛋白资源生产富含呈味肽的呈味基料及调味品共性关键技术”项目于2010年1月获国家科学技术进步奖二等奖,这是海大成立以来,首次获得国家级奖励。申报国家发明专利64项,其中授权5项;有一批科研成果转化为企业生产技术,已实施成果转化4项(“多酶法生产鱼贝类海鲜调味料新工艺”、“金枪鱼鱼头综合利用”、“亚热带水果深加工技术及其产业化”、“金花茶系列新产品”),取得了显著的经济效益和社会效益,为华南地区水产品和农产品加工业的健康发展提供了技术支撑。