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CRISPR （Clustered Regularly Interspersed Short Palindromic Repeats）是细菌用来抵御病毒侵袭/躲避哺乳动物免疫反应的基因系统。科学家们利用RNA引导Cas9核酸酶可在多种细胞（包括iPS）的特定的基因组位点上进行切割，修饰。 Rudolf Jaenisch 研究组将Cas9与Te1和Tet2特异的sgRNA共注射到小鼠的受精卵中，成功得到双基因敲除的纯合子小鼠，效率高达80%。 他们将Cas9/sgRNA 与带突变序列的引物共注射，能准确在小鼠两个基因引入所要的点突变。在ES细胞中他们更是成功的一次敲除了五个基因。与ZFN/TALEN相比，CRISPR/Cas更易于操作，效率更高，更容易得到纯合子突变体，而且可以在不同的位点同时引入多个突变。但该系统是否有脱靶效应尚需进一步的研究。 传统的转基因和基因打靶技术，由于技术稳定成熟，可以对小鼠和大鼠的基因组序列进行各种修饰，仍将是模式动物的构建的主要技术。 核酸酶ZFN/TALEN 尤其是CRISPR/Cas技术如果能解决脱靶效应的话，有可能会广泛应用于小鼠，大鼠及其他模式动物的制备和研究中，成为传统的转基因和基因打靶技术的重要补充。
Crispr是一套正在改变世界的分子剪刀。这是一种切割DNA的酶，科学家们在2012年发现，他们可以将其用于廉价、有效的基因编辑：只需在CRISPR分子上标记一点RNA（一种粘在DNA上的基因物质的薄片）来引导它，而且它可以切割并“重写”持用者想要瞄准的任何DNA片段。
研究人员多年来一直在与CRISPR合作，对付艾滋病毒，从实验人类胚胎细胞中删除遗传疾病，提高跨物种器官移植的可能性。一些科学家甚至认真地讨论在CRISPR的帮助下复活这只早已灭绝的猛犸象。
，但直到现在，科学家们还没有直接观察到CRISPR的活动。他们知道这是有效的，因为如果CRISPR被用于某些细胞，这些细胞会产生DNA，并进行编辑。但是因为分子参与的规模很小，所以在行动中直接观察它们是非常困难的。科学家们刚刚用CRISPR做了10件了不起的事情：
但是“困难”并不意味着不可能。在11月10日发表在《自然通讯》杂志上的一篇论文中，由金泽大学的Shibata Mikihiro和东京大学的Hiroshi Nishimasu领导的一个研究小组对CRISPR的运行进行了可视化观察，Nishimasu在Twitter上分享了一个GIF，它显示了近乎实时的动作展开。
分析这里发生的事情有点困难，但是研究人员添加的箭头提供了帮助。那些长长的咖啡棕色线条？这些是DNA链。太阳黄的斑点？这就是CRISPR-Cas9酶，简称CRISPR，以及它的引导RNA。紫色箭头指向CRISPR咬入的链上的点，灰色箭头指示的第二段DNA在CRISPR吞下后分离。整个过程在GIF中加速，大约需要30秒。
研究人员使用一种称为原子力显微镜的技术拍摄了视频。在佐治亚理工学院纳米研究小组的一篇博客文章中，没有参与这篇新论文的研究员文杰·迈解释说，原子力显微镜涉及到一个课题，一个接一个地，非常快地，用一根非常锋利的针头，记录针头遇到的力。它允许研究人员建立粗糙但非常尖锐的纳米级图像和视频的影响区域。
这段视频揭示了第一次直接观察CRISPR行为，正如研究人员长期以来怀疑的那样。《大西洋月刊》昨天（11月13日）报道说，当研究人员在蒙大拿州Big Sky的一次会议上展示他们的视频时，全场都是经验丰富的CRISPR用户，他们喘不过气来。
是关于生命科学的原创文章。
到底该不该对人类胚胎进行基因编辑近日广州医科大学范勇团队发表论文，宣布他们用基因编辑技术制造出一个能对艾滋病毒免疫的人类胚胎。艾滋病毒要人体内存活、繁衍，需要跟人体免疫细胞表面上的一种蛋白质结合，进入免疫细胞。有极少数人这个蛋白质的基因发生了突变，艾滋病毒没法进入免疫细胞，这些人天生就对艾滋病毒免疫。范勇团队用一种称为CRISPR/Cas9的基因编辑技术对人类胚胎细胞里头的基因组进行改造，人为让该蛋白质基因发生突变，理论上这样产生的胚胎细胞将会对艾滋病毒具有免疫力。这是史上第二例用这种基因编辑技术改造人类胚胎细胞。第一例也是中国科学家完成的。那是在去年，中山大学生物学副教授黄军就团队用该技术修改了人类胚胎细胞中与β型地中海贫血症有关的基因。发表这两篇论文的学术期刊都没有什么影响力，然而它们都在国际上引起了广泛的关注，称得上是一年来中国生物医学领域在国际上最著名的成果，比国内那些动不动就号称有望获得诺贝尔奖的成果著名多了。然而它们之所以著名，并非因为它们有多高的学术价值。它们的意义只是证明了CRISPR/Cas9这种基因编辑技术可以用来改造人类胚胎细胞。但是这是我们预料中的。这种基因编辑技术是近年来生物医学研究的一大热门，此前已被其他实验室用于修改其他动物细胞的基因，包括猴子胚胎细胞的基因，人类胚胎细胞的基因也能被改造一点也不意外。它们之所以引起关注，就在于竟然“敢于”也改造人类胚胎细胞的基因，这在国外、特别是在西方国家，是一个很有争议的、甚至可以说是禁忌的课题。在黄军就团队的论文发表后，国际上甚至还专门开了一次会议，讨论基因编辑技术涉及的伦理问题，要求暂停用它来改造人类胚胎，禁止用于辅助生殖。
前期文章：
在将CRISPR脱靶效应时，我们在文末提到CRISPR编辑效率与P53状态之间的关系，同时Cas9稳定表达可能会对细胞造成影响，从而增加CRISPR-Cas9的应用风险。不禁会有疑问：为何要将CRISPR与P53联系在一起？
我们首先要了解DNA损伤与P53之间的关系，如下图：
由上图可见：
左上角： 电离辐射（IR）等引起的 DNA双链断裂（DSB） ，可经由ATM信号从而激活P53；
右上角： UV等引起的 DNA单链断裂或损伤 ，可经由ATR信号，激活P53。
可见几乎任何一种DNA损伤都会导向至P53反应。而我们不止一次强调， CRISPR-Cas9的上半部分是引起DNA双链断裂（DSB），之后通过不同的修复方式达到精准基因编辑（HDR，MMEJ）或移码突变（NHEJ） 。于是， CRISPR作为一种可造成DNA”损伤“的技术，该技术的应用不可避免的引起P53反应。
但，P53反应和CRISPR技术应用隐患有何关系？
接着，我们可以简单来看看P53在生命体中到底有何作用。
抑癌基因： TP53（tumor suppressor protein）可以说只知名程度最高的抑癌基因之一（甚至可以说是第一）。在大部分肿瘤中都可检测到TP53突变，同时肿瘤细胞又常常表现出基因组紊乱的现象。因此，人们推测TP53的突变与肿瘤发生有关。随后有大量的动物实验和临床研究表明，TP53在体细胞突变引起的肿瘤中高度突变，同时germline TP53突变的病人也常会罹患一种甚至多种肿瘤疾病。
基因卫士 ：TP53作为DNA损伤的反应机制，在 正常情况下P53蛋白由于MDM2的泛素化从而被快速降解 ，因此属于不稳定状态。而 当DNA损伤出现时 ，MDM2被磷酸化从而失去泛素化P53的功能， P53的表达迅速增加 。而P53作为一种转录因子，迅速调控下游的各项指标。当 DNA损伤较轻时，P53会介导细胞周期阻滞 ，从而给予细胞DNA修复的机会，经过修复后的细胞可再次进入细胞周期。而 当DNA损伤十分严重无法修饰时，P53会将引导细胞走向凋亡 ，从而避免不良DNA损伤传递给子代。因而，TP53因其维持基因组稳定性的作用，达到抑癌的效果。
其他： P53的内容十分繁多，如P53在肿瘤中的变化 大多是错义突变而非缺 失，突变的部分 大多在DNA binding domain ，导致P53功能缺失的突变我们叫 “loss of function, LOF” 。而有一部分P53突变会产生突变体，该突变体不仅抑制剩余的野生型的P53的功能，同时自身还拥有新的功能，此时我们称之为 “gain of function, GOF” ，这时候的P53突变体可被称为oncogene。此外，如P53不仅仅在肿瘤细胞中有突变，其实在正常体细胞中也常检测到突变，有前两年有一篇文章详细介绍了这部分内容，并提出紫外线等是P53突变的主要原因之一，所以小伙伴们，防晒搞起来噻！
综上所述，P53作为一个维持人体基因组稳定性的重要基因，如果CRISPR技术打断了TP53的功能，那么其后果将相当严重 。
第一篇文章发便于2018年七月份的 Nature Medicine ，从标题上很明显看出内容为，P53可抑制CRISPR-Caas9在人多功能干细胞上的应用。
（1) 构建Cas9稳定表达的人多功能干细胞（human pluripotent stem cell，hPSC）
如下图所示，作者将一个双Tet-On 3G的Cas9及其筛选标记元件插入到AAVS1位点，改系统可控制Cas9表达的时间。同时sgRNA投放方式为慢病毒稳转。
(2) 瞬转Cas9-ribonucleoproteins (RNPs)
当作者提高基因编辑效率后，发现有不少人多功能干细胞在基因编辑后死亡，这就引起了作者的好奇：缘何死亡，机制为何？ 因此他们设计了以下实验并最终找到了原因。
在以往研究中，由于基因编辑效率很低，因此没有观测到CRISPR明显的细胞毒性。而当作者将编辑效率增加至80%以上以后，观测到了明显的细胞毒性现象。如下图所示， （e） 在图e中，通过四环素诱导Cas9表达，并结合sgRNA 对MAPT基因进行编辑 。 MAPT基因并不是人多能干细胞生存所必须的基因 ，换言之， 敲除该基因不应该对细胞的生存造成影响 。而结果却显示， 对MAPT基因编辑的同时，细胞团块缩小，证明有大量细胞死亡 。 （h） 在图h中，一样观测到了类似的现象。当然还有很多其他证据支持，最终文章的结论为，CRISPR-Cas9基因编辑会导致hPSC细胞的死亡。 那么CRISPR-Cas9基因编辑导致细胞死亡的原因到底为何？
为了验证CRISPR-Cas9诱导人多功能干细胞（hPSC）与Cas9诱导的DSB之间的 no bias 关系，而非特定基因编辑导致的死亡。作者对hPSC进行 CRISPR文库筛选 ，通过查看CRISPR文库内的sgRNA分布变化查看CRISPR-Cas9与hPSC死亡的关系。
注意：下图中出现的ddCas9是Cas9的一种变体，当没有Shield1的时候，ddCas9蛋白降解，无法行使其功能，只有在Shield1存在时ddCas9才能稳定行使功能。
如下图c-d所示： （ 1）在没有基因编辑发生的H1，iCas9+Dox组中 ，无论是target到目的基因的sgRNA还是没有target gene的sgRNA， 在12天的筛选之后都没有出现sgRNA分布的差异 。 （2）当外加Dox诱导Cas9表达，或者外加Shield1诱导ddCas9稳定之后 ，CRISPR-Cas9基因编辑的发生导致了有target的sgRNA分布出现了差异，证明有 一部分targeting sgRNA转染细胞已经在基因编辑过程中死亡。同时non-targeting sgRNA比例的增加，反向证实了一部分targeting sgRNA转染细胞的消失。以上结果证明了全基因组性的基因编辑导致细胞死亡，其原因可能是Cas9导致的基因毒性，而非特定的基因缺失导致的死亡。
而图e结果表示 ，这种对于CRISPR-Cas9毒性的敏感性主要表现在干细胞中，而常见的工具细胞和肿瘤细胞并没有这种现象。
以上结果虽证实了CRISPR-Cas9编辑过程造成hPSC死亡的因果关系， 但没办法把P53牵扯进来 。思路很简单，就把前面做的 MAPT gene editing的细胞送RNA-seq，看一下差异基因（左图a） 。差异基因自然有许多，但 P21作为P53的下游赫然在列，而且变化倍数非常大 。当然为了排除MAPT基因的影响， 还对其他基因编辑细胞进行了P21表达鉴定(右图d-g) ，进一步证实P21的变化，而P53作为P21的直接上游，应也是参与了这个过程。
上述所有结果都只是证明了 P53与CRISPR-Cas9诱导的hPSC死亡相关 ，但还是不能证明P53是hPSC在CRISPR-Cas9基因编辑过程中死亡的原因。因此作者构建了一个P53 mutant pool，这个pool中有一半以下是P53WT的细胞，一半以上是P53 mutant的细胞。 可以看到左图（c）中显示：（1）在control pool中激活CRISPR-Cas9基因编辑，细胞的融合度不断下降，证明有细胞死亡 ；（2）而在P53 mutant pool中，CRISPR-Cas9的激活，虽相对未激活组（P53 mutant pool -Dox），其融合度有所下降，但融合度相对 control+Dox组有所上调。我们分析可知， 融合度下降的原因在于P53WT细胞的死亡，而融合度上升则在于P53 mutant细胞的死亡抵抗 。 右图（e）中通过外加P53DD抑制野生型P53功能，细胞团块得到生长。
以上结果均表明，在P53功能失活之后，CRISPR-Cas9介导的死亡被抑制，因此证明了P53是CRISPR-Cas9介导hPSC死亡的原因。
作者切入点看起来很简单，但却也很巧妙。 CRISPR-Cas9作为诱导DSB的因素，常理来说一定会诱导P53的激活 ，而P53激活则会介导下游相关功能的体现（细胞周期阻滞、细胞衰老甚至死亡），这是一个很清晰明了的思路，但我们很多人都没有想过。且据我们经验， 人多功能干细胞常规的P53-P21表达水平非常低，WB和免疫荧光几乎无法检测到 。但 该类细胞对外界刺激非常敏感 ，如人胚胎干细胞只需要给予1-2 Gy的X光即可造成死亡。而成纤维细胞、间充质干细胞或者肿瘤细胞，给予10-30 Gy X光还无动于衷。由此可见，人多功能干细胞对DSB激活P53更为敏感，更易死亡。正是因为这种敏感的机制，才能使得人多功能干细胞的基因组一直比别的细胞更为稳定。虽然人多功能干细胞更为敏感，但不代表这种机制在其他常见细胞中不会发生。
由于P53 WT细胞可应对CRISPR-Cas9诱导的DSB，更易死亡，而P53 mutant细胞可以抵抗.。因此CRISPR-Cas9则成为了一个P53 mutant细胞的筛选因子，长此以往，细胞群落中P53 mutant的比例越来越高，其风险不言而喻。
这篇文章我在19年初就已读过，以为文章解读会写得比较容易，但当提笔写的时候发现有很多细节当时根本没有注意。 比如这篇文章纯熟的运用了CRISPR技术的多种手 段，从 普通敲除到inducible knockout ，而且它的 inducible还有多种方式（Cas9的诱导表达，Cas9的诱导稳定以及Cas9的诱导失活） ；从 单个基因的验证到全基因组的文库筛选 。因此我觉得这篇文章不仅仅是阐明CRISPR技术的应用风险一篇重要文章，同时也是我们全面学习CIRSPR技术的良好案例。文章非常棒， 值得回到原文好好细读。
本来这次推文还想解读两篇文献，考虑到篇幅只能将另一篇文献放在下一篇文章中了。写的时候还担心写简单了不够深入、写复杂了太过枯燥，内容是一展再展又一删再删。希望经过整修之后，内容不那么枯燥，还能有所帮助，感谢阅读并期回馈交流~
功能基因组学方法可以克服阻碍癌症药物开发的局限性，如缺乏确定可靠的靶点以及临床疗效差强人意。在这里，我们对来自30种癌症类型的324个人类癌细胞系进行了基因组规模的CRISPR-Cas9筛选，并开发了一个数据驱动框架，以优先选择癌症治疗方案。我们将细胞适应度效应与基因组生物标志物和药物开发的靶标易用性结合起来，系统地优先考虑已定义的组织和基因型中的新靶标。我们证实了我们最有希望的依赖之一，沃纳综合性ATP依赖解旋酶（Werner syndrome ATP-dependent helicase），作为多个癌症类型与微卫星不稳定的一个关键靶标。我们的分析提供了癌症依赖关系的资源，生成了一个框架来优先考虑癌症药物靶标，并提出了具体的新靶标。本研究中描述的原理可以为药物开发的初始阶段提供信息，为新的、多样化和更有效的癌症药物靶标组合做出贡献
患者肿瘤的分子特征影响临床反应，可用于指导治疗促进更有效的治疗和降低毒性。然而，大多数患者并没有得益于这种靶向治疗，部分原因是对候选靶点的了解有限。在癌症药物的开发中，缺乏疗效是由于90%的损耗率造成的，而且用于新靶点的分子药物依旧有限。有效识别和优先考虑肿瘤靶点的无偏策略可以扩大靶点的范围，提高成功率，并加快新癌症疗法的开发。
利用sgRNA文库的CRISPR-Cas9筛选已被用于研究基因功能及其在细胞适应性中的作用。基于crispr - cas9的基因组编辑具有很高的特异性，可以生成空等位基因，从而改变外显表型。在这里，我们提出了324个癌细胞系的基因组规模的CRISPR-Cas9适应度筛选和一项综合分析，使候选癌症治疗靶点的优先化成为可能(图1a),我们通过识别沃纳综合征ATP依赖解旋酶(WRN)作为微卫星不稳定性(MSI)肿瘤的靶点来说明这一点。
为了全面分类肿瘤细胞适配性( 全文的适应性都是这个意思：为细胞生长或生存所需的基因 )，我们对339个癌细胞系进行了941个CRISPR-Cas9适应度筛选，目标基因为18009个。遵循严格的质量控制,最终的分析包括324细胞系来自30个不同的癌症类型,在19个不同的组织。
这些细胞系是高度基因组注释细胞系的细胞模型集合的一部分，广泛代表患者肿瘤的分子特征，包括常见的癌症（如肺癌，结肠癌和乳腺癌）和特定未满足临床需求的癌症（ 如肺癌和胰腺癌）。对来自这324个细胞系的筛选数据的分析表明，在分类必需和非必需基因时具有高灵敏度，特异性和精确性，并且结果不受实验因素的偏倚。
在 特定分子或组织学环境中细胞适应性所需的基因 （这个就是文中说的背景依赖性核心基因）可能编码有利的药物靶标，因为在健康组织中诱导毒性作用的可能性降低。 相反，大多数测试细胞系常见或在癌症类型中常见的适合度基因（分别称为泛癌或癌症类型特异性核心适应性基因）可能参与细胞的基本过程并具有更大毒性。 因此，重要的是区分特定背景的适应性基因和核心适应性基因。
我们在每个细胞系中鉴定了1,459个适合度基因。 总共有41％（n = 7,470）的所有靶基因在一种或多种细胞系中诱导了适应性效应，并且这些基因的大多数（83％）在不到50％的测试细胞系中诱导了依赖性(图1b)。 为了识别核心适应性基因，我们开发了一种统计方法，即 自适应最优模型（ADaM） ，以自适应地确定基因被分类为核心适合度基因所需的最小数量的依赖细胞系(图1c)。 被定义为13种癌症类型中至少12种（也是适应性确定的）的核心适应性的基因被归类为泛癌核心适应性基因。 这产生了866个癌症类型特异性和 553 个泛癌症核心适应性基因。
在使用ADaM鉴定的泛癌核心适应性基因中，399先前被定义为必需基因，125是参与必需细胞过程的基因。其余132（24％）个基因是新发现的，并且在细胞管家基因和途径中也显着富集。与先前鉴定的参考核心适合度基因组相比。我们的泛癌核心适应度基因组显示更多基因过程中涉及的基因（中位数= 67％，相对于之前发表的基因组分别为28％和51％），而背景依赖性基因具有相似的假设发现率（FDRs）（取自先前的研究）。血癌细胞系具有最独特的核心适应性基因谱（31个独有的核心适应度基因）。癌症类型特异性核心适应性基因通常在匹配的健康组织中高度表达，与其在基本细胞过程中预测的作用一致，并表明如果用作靶标它们显示出潜在的毒性。值得注意的是， 五种基因在单一癌症类型中是核心适应性，并且在匹配的正常组织中基础水平低或不表达，这表明它们可以在这些组织中诱导癌细胞特异性依赖性。
总的来说，使用统计学方法，我们改进和扩展了我们对人类核心适应性基因的现有知识，并鉴定了具有高毒性可能性的基因，因此代表了不太有利的治疗靶点。 此外，由于拥有大规模的数据集，我们现在可以定义背景依赖适应性基因（每个癌症类型的中位数n = 2,813个基因）,其中许多具有与核心适应度基因相似或更强的失去适应性效应。
为了从我们的特定背景特定适应度基因列表中提名有希望的治疗目标，我们开发了一个计算框架，它整合了多种证据，为每个基因分配了一个目标优先级分数，范围0-100，并生成了候选的候选列表对于个体癌症类型或泛癌症候选者。为了排除由于潜在毒性而可能是不良靶标的基因，核心适合度基因被评为“0”。对于每个基因，70％的优先级得分来自CRISPR-Cas9实验证据，并根据适应度效应大小，适应性缺陷的显著性，目标基因表达，目标突变状态和其他证据，对依赖细胞系进行均值评估。其余30％的优先级分数是基于与靶标依赖性相关的遗传生物标记物的证据以及靶标在患者肿瘤中被体细胞改变的频率。对于生物标志物分析，我们进行了方差分析（ANOVA）（图2）以测试适合度基因与484种癌症驱动事件（151种单核苷酸变体和333种拷贝数变异体）或MSI之间的关联，在每种癌症类型中都有足够的大样本（n≥10细胞系）。我们基于针对具有批准或临床前癌症化合物的目标计算的得分（扩展数据图5c和补充表5）得出优先级评分阈值（分别为泛癌和癌症类型特异性分析的 55和41 ）。
我们共确定了628个独特的优先目标，包括92个泛癌和617个癌症类型特定目标。 在癌症类型中，优先目标的数量变化大约三倍，中位数为88个目标。 大多数癌症类型的优先目标（n = 457,74％）仅在一种（56％）或两种（18％）癌症类型中被识别，强调了它们的背景特异性。 在癌症类型特异性分析中也发现了最优先的泛癌靶点（88％）。 仅在泛癌症分析中确定的11个优先目标通常包括在来自多种癌症类型（例如，CREBBP和JUP）的一小部分细胞系中发生的依赖性或在有限数量的癌症类型中发生的依赖性。 可用细胞系阻止进行癌症类型特异性分析（例如，黑素瘤中的SOX10）。
在628个优先目标中，120个（19％）与使用具有高显着性和大效应大小（定义为A类靶标）的ANOVA鉴定的至少一种生物标志物相关，因此这些蛋白质对于药物开发特别有利。 例如，PIK3CA是乳腺癌，食道癌，结肠直肠癌和卵巢癌中的A类靶标; PI3K抑制剂正在临床开发用于PIK3CA13突变的癌症。 使用渐进不那么严格的显着性阈值扩展了目标，其中至少一个生物标志物关联由ANOVA确定，其被定义为B类（n = 61,10％），其次是C类（n = 117,19％）目标，一些 在多种癌症类型中鉴定出来的。 总之，这些结果强调了数据驱动的定量框架通过组合来自多种细胞系的CRISPR-Cas9筛选数据和相关基因组特征来确定靶标优先级的潜力。
在目前的药物开发策略的基础上，目标在药物干预的适用性方面各不相同，这为目标选择提供了依据。 使用目标易处理性评估来开发小分子和抗体，我们以前将每个基因分配到10个易处理桶中的1个（1表示最高的易处理性）。 我们将628个优先目标与其可控性交叉引用，并将它们分为三个易处理组。
可追踪性组1（桶1-3）包括临床或临床前开发中批准的抗癌药物或化合物的靶标，并包括40个独特的优先目标，例如乳腺癌中的ERBB2，ERBB3，CDK4，AKT1，ESR1，TYMS和PIK3CB以及PIK3CA。 ，IGF1R，MTOR和ATR在结直肠癌中的表达。在这40个优先目标中，20个具有至少一种针对癌症类型开发的药物，其中靶标被确定为优先，而其余20个靶标具有已经用于或开发用于治疗其他癌症类型的药物，提供重新利用这些药物的机会。第1组中的三分之一优先目标具有A类生物标志物，表明它们是非常理想的目标。一个例子是CSNK2A1，它由结直肠癌细胞系中高度显着的适合度基因CSNK2A1编码，扩增含有FLT3和WASF3的染色体片段（P = 6.65×10-6，玻璃△> 2.9）并被靶向silmasertib。具有标记的第1组中的其他优先目标显示ERBB2扩增时存在ERBB2或ERBB3依赖性，ASXL扩增食管癌细胞系中CDK2依赖性，PIK3CA突变存在时PIK3CA依赖性和PTEN乳腺癌细胞系中PIK3CB依赖性突变。
可追踪性组2（桶4-7）在临床开发中包含277个没有药物的优先目标，但有证据支持目标易处理性。其中，18％具有A类生物标志物，包括KRAS依赖于KRAS突变细胞系，USP7依赖于APC野生型结肠直肠细胞系，KMT2D依赖于乳腺癌细胞系，扩增含有PPM1D和CLTC的染色体片段和MYI扩增的骨和胃癌细胞系中的TRIAP1依赖性。值得注意的是，我们观察到具有MSI和泛癌的结肠直肠和卵巢细胞系中的A类生物标记物依赖于WRN。在第2组中与生物标志物无关的优先目标中，GPX4是多种癌症类型的靶标。对GPX4抑制的敏感性与上皮 - 间充质转变相关，并且我们观察到与GPX4依赖性细胞系中的上皮 - 间质转化相关的标志物的差异表达。这表明我们的目标优先级方案的未来改进如何能够捕获与扩展的分子特征集相关的优先目标，包括基因表达，染色质修饰和分化状态。
最后，第3组（第8-10栏）包括311个优先目标，这些目标没有任何支持或缺乏可以告知可行性的信息; 该组显着富含转录因子。 具有A类生物标志物的组3中的优先目标的实例包括乳腺癌中的FOXA1和GATA3，血液学和淋巴癌中的MYB，卵巢癌中的STX5和神经母细胞瘤细胞系中的PFDN5。
易处理性组1中的优先目标富含蛋白激酶，突出了针对这类目标的药物开发的主要焦点，与第2组和第3组相比，其包括功能更多的多样化靶组。 第2组中的目标最有可能通过常规方式新颖且易于处理，因此代表了药物开发的良好候选者。 较新的治疗方式，如蛋白水解 - 靶向嵌合体，可能会增加适合药物干预的蛋白质的范围，以包括第3组中的目标。总体而言，我们的框架提供了数据驱动的优先治疗目标列表，这些目标将是 癌症药物的发展。
为了证实我们的目标优先级策略，我们研究了WRN解旋酶作为MSI癌症的有希望的靶标。 WRN是五种RecQ家族DNA解旋酶之一，是唯一一种同时具有解旋酶和外切核酸酶结构域，并且在DNA修复，复制，转录和端粒维持中具有不同的作用。 MSI表型是由于MMR途径基因的沉默或失活导致的DNA错配修复（MMR）受损引起的。 MSI与高突变负荷相关，发生在20多种肿瘤类型中，常见于结肠癌，卵巢癌，子宫内膜癌和胃癌（3-28％）。
WRN的依赖性与泛癌ANOVA中的MSI以及结肠癌和卵巢癌细胞系的分析密切相关。 大多数MSI的子宫内膜和胃癌细胞系依赖于WRN; 然而，由于样本量小，与MSI的关联不显着（对于胃）或未进行测试。 MSI在许多其他肿瘤类型中是罕见的（<1％），例如肾，黑素瘤和前列腺癌，并且大多数（测试的5个中的4个）来自这些组织的MSI细胞系不依赖于WRN。 其他经过测试的RecQ家族成员（BLM，RECQL和RECQL5）与MSI细胞系中的适应性基因无关。 对MMR途径基因的非同义突变，启动子甲基化和纯合缺失的集中分析证实了WRN依赖性与MLH1启动子的高甲基化或MSH6突变之间的显着关联; 以及表观遗传调节因子MLL2（也称为KMT2D）的突变。
为了进一步验证WRN，我们进行了基于CRISPR的共竞争测定，其中比较了WRN敲除与野生型细胞的相对适应度。与来自结肠癌，卵巢癌，子宫内膜癌和胃癌的六种MSI细胞系中的野生型细胞相比，使用四种单独sgRNA的WRN敲除降低了WRN敲除的适应性。相比之下，来自这四种组织的所有微卫星稳定细胞系没有差异。一致地，WRN在克隆形成测定中对MSI细胞具有选择性的基础。值得注意的是，WRN敲除对细胞适应性具有有效影响，其效应大小与核心适应度基因相似。此外，我们从系统RNA干扰筛选中挖掘数据并确认MSI癌细胞系中的WRN依赖性，并证实通过RNA干扰的WRN下调强烈地损害了MSI HCT116细胞中的生长，从而在正交实验系统中提供了验证。尽管MMR缺乏与WRN依赖性之间存在很强的相关性，但在微卫星稳定的SW620细胞系中敲除MLH1并未诱导WRN依赖性;相反，HCT116细胞与含有MLH1和/或MSH3的染色体互补（以恢复其表达和纠正MMR缺陷） - 并不能恢复WRN敲除的效果。
为了确定适应性损失效应是否对WRN具有选择性并确定药物靶向的潜在策略，我们使用野生型或亚型Wrn的亚型（对我们使用的WRN sgRNA具有抗性）进行功能性拯救实验 ）外切核酸酶（E78A）或解旋酶（R799C或T1052G）结构域中的突变会损害蛋白质功能。 野生型或核酸外切酶缺陷型Wrn的表达拯救了MSN细胞中WRN的敲除，而解旋酶缺陷型Wrn的表达导致无（R799C）或弱（T1052G）拯救。 因此， WRN的解旋酶活性是必需的，并且是可用于治疗靶向的重要结构域。
为了评估MSI细胞对WRN消耗的体内敏感性，我们在HCT116细胞中开发了多西环素诱导型WRN sgRNA系统。 在小鼠中皮下移植表达WRN sgRNA的HCT116细胞后，用强力霉素治疗导致已建立肿瘤的显着生长抑制和增殖细胞数量的减少。 这些发现证实WRN是维持MSI结肠直肠癌细胞体内生长所必需的。
参考文献： Behan F M, Iorio F, Picco G, et al. Prioritization of cancer therapeutic targets using CRISPR–Cas9 screens[J]. Nature, 2019, 568(7753): 511.
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如果以个人名义和身份发表,个人出;如果以单位名义和身份发表,单位出.
自己出，单位一般是不会帮出的。
电子游戏。她仅是暴力凶杀吗？不是。她仅是孩子学习路上的拦路虎，绊脚石吗？不是。她仅是家长以至全社会心头的一把锋利的双仞剑吗？也不是。那她应是什么呢？她应是跨世纪跨时代的高科技高尖端的产品。从一定意义上说，她可以有助于我们激发大脑的潜能，甚至可以让我们在这个领域里“打遍天下无敌手！“从而找到自信，成就一番事业。 我们常说“什么东西不能一棒子打死。“这句话说得非常好，我们对电子游戏想必也不能一棒子打死吧！的确，她是妨碍孩子学习，她是有着暴力凶杀，可哪位家长又真正统计过其中的好与坏，利与弊呢？我认为还是利大于弊吧！对于这个刚刚诞生几十年的新生产物，我们决不可以将其扼杀于摇篮之中。电子游戏中有很多好的内容，比如，CCTV-5就曾为广大游戏玩家开办过＜电子竞技世界＞节目，里面都是有助于提高我们的游戏水平的，得到了社会各界的喜爱．再比如FIFA这款游戏，听听它的来头吧：其与国际足联同名，其中国区的比赛现已得到文化部，国家广播广电总局的批准，由央视向人们宣传．上述例子不胜枚举，对于这个新生产物，当你真正了解她时，你又怎忍心将其＂一棒子打死＂呢？ 我们常说＂三百六十行，行行出状元．＂电子游戏可以培养软件开发人才，电子竞技高手，传播推广人才．这些人一旦发明一些高科技的游戏，还可向国内外宣传推广．从而丰富了人民的文化生活，甚至创造了外汇，直接支援了经济建设．就拿陈迪来说吧，他可是游戏中的高手，是FIFA中国区的总冠军，在国际FIFA领域里也是赫赫有名，有时他还客串一把＜电子竞技世界＞的主持．如今真是小有名气，是电子游戏造就了他！ 我们也常说＂电子游戏是锋利的双仞剑．＂既然她是锋利的双仞剑，那我们何不用用其击败敌人，反到吓唬自己呢？
游戏的内容是我们自己选择的，同时，这场游戏到底是一个简简单单的没有障碍的游戏，还是一场足以让我们把命运赌上的冒险之旅，同样也是我们自己选择的！这场游戏有着许许多多的分支，有着许许多多的场景，每一个场景里都会有一个或者几个大大小小的敌人，生活中的我们也处在游戏中，所以作为一个游戏者我们要严阵以待，因为一次错误的选择会决定我们的一生！我们像是绿林好汉，勇敢的走在路上，不断的应对着前方的危险，然而，我们不曾退缩，我们用自己的能力为自己开辟了一条新的大路。我们不曾骄傲，因为我们知道，如果生命之神没有收回成命，如果她还没有让我们去找她，那么我们来到人间的使命就没有完成，我们还有太多的事要面对，要学习，所以，我们不能掉以轻心，否则我们会把自己送上一条想后悔却不能的“悔路”！在这场游戏中，不会有常胜将军，也不会有常败将军。在这无数的场景中，我们终有成功的一次！这场游戏的规则是可以更改的。或许在其他的游戏中，有一个终点，可是在这款需要用一生去经营的游戏里，没有一个终点，因为，我们脚下的路随时是我们生命的终点。终点是什么？没有人知道，或许它是虚有的，只因为它没有一个真正的位置；也或许它是一个简单明了的事，却因为我们的一个失误成为了我们的终点。这场游戏里不是没有“反悔”一说，有！但是，反悔的事情是什么，才是能不能反悔的关键。你的一个小小的错误，这场游戏会给你一个反悔的机会，虽然你会因为这个错误付出一些计划之外的代价，但是你一定可以继续走下去！记住：当你发现自己走错了路时，你一定要赶快反悔，只有这样，你才能坚持到最后！否则，就算你的反悔成功，你也会受到惩罚！如果你受了惩罚，也要相信：只要你还能动，就不要倒下，走一步是一步，因为没有终点，所以，请你告诉自己，再走一步就会成功！
网络游戏在现在的学生家长们眼中无疑是洪水猛兽，学生们往往为其绚丽的画面、奇趣的剧情、和那在现实生活中无法获得的“江湖情谊”而沉溺其中。为了帮助孩子戒掉网瘾，家长们无所不用其极，那些所谓的药物治疗法、电击治疗法听起来就让人毛骨悚然。更有家长联合起来抵制网游公司出台系列游戏，认为此类游戏毫无现实意义，浪费金钱浪费时间，如果不像虎门硝烟那般把引诱人上瘾的源头付之一炬，中国的未来似乎会因为这网络游戏而再无光明……但显然，家长们这种忧患意识似乎只有在中国才如此剧烈，电脑与电子游戏的起源地——美国，却往往没有这样的问题。依我看原因有二。一是中国对电子娱乐产业向来不给予足够重视。要知道1994年暴雪娱乐就出台了风靡全球的《魔兽争霸》，而那时中国才于该年四月连入Internet。因此毋庸置疑，美国的电子娱乐产品一经引入中国市场，迅速填充了这个空白产业，在那画面精致、剧情丰满的网络游戏面前，年轻人们甚至没有一个过渡的过程，就马上沉迷于那他们不曾想象的奇妙世界也不足为奇。他们不曾系统地学习过计算机编程，并不知道那绚烂画面后是编程们精心编写的繁琐数据、源代码，他们同样不曾了解网游背后其实是一个巨大的利益市场，每年那些人民币玩家带动的网络消费甚至抵得上一个小国一年的财政收入。二是一直被谈论的代沟问题。我们出生于一个举着“个性解放”标牌的时代，时代政策给我们了更多接触外界的机会，和向往外界的心态。但我们的父母，更多的习惯于“红色的土地、红色的爱好”。标签着资本主义的腐朽事物的网络游戏无疑就是些魑魅魍魉，由此不难理解那些对游戏怀有偏见的想法。所以是时候为网络游戏平冤了，那些被人们怀有偏见的归于下九流爱好的“漫画、网游”可以变得很高雅，同样也能成为谋生的手段。美剧《生活大爆炸》中那些年轻的博士们，闲暇的娱乐活动就是打诸如WOW光晕的网络游戏，经营游戏周边的商店老板更被看做跟cool，对他们游戏无对错之分，可以很自然地被问及你的爱好，“哦，WOWⅢ。”这个回答并不会比那些“阅读、歌剧”“低端”，让人轻视。现在网络游戏或可称为“电子竞技”——以竞技类电子游戏为基础，以计算机和网络为道具，在“人－人”之间进行的对抗性娱乐活动。并且随着游戏对经济、社会不断加强的影响，电子竞技正式成为体育竞技的一种。今天电子竞技运动已被中国国家体育总局列为第99个正式体育运动项目。由此我们更能发现这样一个现实，游戏产业的规模化、产业化、大众化，是不可避免的趋势。我们能做的就是去适应这样一个变化的世界，愈加便捷的交通方式，愈加快捷的生活步调，都是我们在批判，同时也在适应的世界变化。我们又凭何把电子网游排除在这些务必适应的变化之外呢？未来网络空间完全可以作为人类有限现实生存面积的补充，基于数字的网络世界更有着无限发展。游戏本无对错，重要的是游戏心态
这位题主您好，我总感觉您说的就是外挂吧，一般腾讯是决不允许外挂的，轻则掉分重则封号，您还是不要想这种作弊的事了
个人发表版权是属于个人的。不过最好申明下版权。以防别人盗用论文
版权指的就是论文的法定负责人，一篇sci论文有通讯作者也有第一作者、第二作者等，通讯作者是负责整篇文章的设计、费用等内容，在论文发表过程中起到很关键的作用。而且在国际上是比较认可通讯作者的，很显然sci论文的受益人就是通讯作者，所以一般情况下，通讯作者就是sci论文的负责人。
通讯作者一般指整个课题的负责人，承担课题的经费，设计，文章的书写等，版权自然也就是属于通讯作者的。第一作者是对整篇文章撰写起到很大的作用，一般说来通讯作者与第一作者其实就是一个人，所以论文的大部分内容以及费用都是通讯作者承担的，所以自然版权属于通讯作者。
SCI文章发表的七步流程解析
第一，先完成你所要发表的文章。
SCI文章其实没有想象中那样的难写，只要熟悉你自己的专业，选择与专业相符的主题内容；在写作过程中避免与其他的文章内容有较高的重复度；使用你自己较为熟悉的语言；要舍得投入足够的耐心和精力还有时间；文章完成以后一定要请专业人士替你审阅。
第二，投稿。
你的文章投到哪一本杂志上是有很大的学问的。如果你的时间充足，可以先投到高于你的目标杂志的杂志上。投到那些比你目标中杂志还要高的杂志上，即使被退稿你也不会有损失，有可能会收到他们给你的非常有用的意见。
第三，选择合适的审稿人。
你推荐的审稿人要有一定的学问，一定要是专业人士，但你推荐的审稿人不能是太忙的或者是太厉害的，因为他们一般都不会去理睬一般的杂志发出来的邀请。
第四，关于撤稿。
你没必要去担心杂志编辑会不高兴，一般撤稿的原因有三种：材料不可靠，结果重复，设计的问题。
第五，怎么样回答审稿人。
做研究写文章确实很辛苦，发表文章更加不容易。可是审稿人也辛苦也不容易，他们认真阅读你的文章，给出很好的建议而你不接受他所给的建议，换谁都会不高兴。这时候你应该保持冷静，静下心来好好分析一下他给你建议，找到问题的关键点。
第六，文章被接受后该注意的事项。
你的文章被接受以后，就会以印刷编辑的校样形式寄回给你，校样不可以有大幅度的改动。校稿主要是查看作者名字有没有写错，图表上的数据有没有错的地方，查看完之后需尽快将校样寄还给印刷编辑。
第七，文章被发表后的注意事项。
文章发表之后，一般是不会撤稿的。一个稿子同时投到几个不同的杂志会引发诚信的问题，所以在发表之前要慎重的考虑。
论文是属于知识产权的，论文作者对论文享有著作权。论文著作权实行自愿登记，论文不论是否登记，作者或其他著作权人依法取得的著作权不受影响。我国实行作品自愿登记制度的在于维护作者或其他著作权人和作品使用者的合法权益，有助于解决因著作权归属造成的著作权纠纷，并为解决著作权纠纷提供初步证据。一、我国《著作权法》明确规定了不予保护的对象。本法不适用于：（一）法律、法规，国家机关的决议、决定、命令和其他具有立法、行政、司法性质的文件，及其官方正式译文；（二）单纯事实消息；（三）历法、通用数表、通用表格和公式。二、我国《著作权法》规定的合理使用情形有：（1）为个人学习、研究或者欣赏，使用他人已经发表的作品；（2）为介绍、评论某一作品或者说明某一问题，在作品中适当引用他人已经发表的作品；（3）为报道新闻，在报纸、期刊、广播电台、电视台等媒体中不可避免地再现或者引用已经发表的作品；（4）报纸、期刊、广播电台、电视台等媒体刊登或者播放其他报纸、期刊、广播电台、电视台等媒体已经发表的关于政治、经济、宗教问题的时事性文章，但著作权人声明不许刊登、播放的除外；（5）报纸、期刊、广播电台、电视台等媒体刊登或者播放在公众集会上发表的讲话，但作者声明不许刊登、播放的除外；（6）为学校课堂教学或者科学研究，翻译、改编、汇编、播放或者少量复制已经发表的作品，供教学或者科研人员使用，但不得出版发行；（7）国家机关为执行公务在合理范围内使用已经发表的作品；（8）图书馆、档案馆、纪念馆、博物馆、美术馆、文化馆等为陈列或者保存版本的需要，复制本馆收藏的作品；（9）免费表演已经发表的作品，该表演未向公众收取费用，也未向表演者支付报酬，且不以营利为目的；（10）对设置或者陈列在公共场所的艺术作品进行临摹、绘画、摄影、录像；（11）将中国公民、法人或者非法人组织已经发表的以国家通用语言文字创作的作品翻译成少数民族语言文字作品在国内出版发行；（12）以阅读障碍者能够感知的无障碍方式向其提供已经发表的作品；（13）法律、行政法规规定的其他情形。三、除承担民事责任，行为严重的，还可能需要承担行政责任甚至刑事责任的侵权行为：1.未经著作权人许可，复制、发行、表演、放映、广播、汇编、通过信息网络向公众传播其作品的，本法另有规定的除外；2.出版他人享有专有出版权的图书的；3.未经表演者许可，复制、发行录有其表演的录音录像制品，或者通过信息网络向公众传播其表演的，本法另有规定的除外；4.未经录音录像制作者许可，复制、发行、通过信息网络向公众传播其制作的录音录像制品的，本法另有规定的除外；5.未经许可，播放、复制或者通过信息网络向公众传播广播、电视的，本法另有规定的除外；6.未经著作权人或者与著作权有关的权利人许可，故意避开或者破坏技术措施的，故意制造、进口或者向他人提供主要用于避开、破坏技术措施的装置或者部件的，或者故意为他人避开或者破坏技术措施提供技术服务的，法律、行政法规另有规定的除外；7.未经著作权人或者与著作权有关的权利人许可，故意删除或者改变作品、版式设计、表演、录音录像制品或者广播、电视上的权利管理信息的，知道或者应当知道作品、版式设计、表演、录音录像制品或者广播、电视上的权利管理信息未经许可被删除或者改变，仍然向公众提供的，法律、行政法规另有规定的除外；8.制作、出售假冒他人署名的作品的。法律依据：《中华人民共和国著作权法》第二条中国公民、法人或者其他组织的作品，不论是否发表，依照本法享有著作权。外国人、无国籍人的作品根据其作者所属国或者经常居住地国同中国签订的协议或者共同参加的国际条约享有的著作权，受本法保护。
属于第一作者的，后面的只是挂名，没有实际价值的。或许有些单位允许挂名的论文来评定级别，但是多数是没有用处的。望采纳。