深度不同。本科毕业论文可以提出新的理论观点，可以从自己的角度去解释已有的理论，甚至可以只是一份对于某观点的调查报告；而研究生毕业论文必须有新的内容，例如提出新理论，针对已有理论提出新观点、新解释、新论据等等，论点可大可小，但论据要充分、论证要严密、例证要确凿、计算要准确、图表要严谨，全文必须有新意，绝不可抄袭、雷同、人云亦云，一定要跳出窠臼，有所创新。
研究生期末论文可以用别人本科毕业论文会入库。本科论文和研究生论文在知网里面属于两个独立的库，本科论文查重会查研究生的库，研究生论文查重是不查本科论文库的，也就是大学生论文对比库在研究生查重系统里面是没有的，直接在程序上允许了研究生论文直接引用本科毕业论文情况的存在。
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