研二发表SCI研三还是需要写毕业论文的。SCI论文是对某一个课题研究方向所做工作及成果的总结和展示，一般被称为“小论文”；而毕业论文是对整个研究生学习期间所做所有科研工作的总结和汇报，一般被称为“大论文”。所以需要写毕业论文。如果写了SCI论文的话，毕业论文的要求需要与SCI论文存在关联性的。
可以根据课题的进展情况进行确定，一般课题做得差不多要结束了就可着手写毕业论文了。当然，平时课题进行一段时间后也可以对试验结果进行整理，主要是一些数据，哪些需要做成图，哪些需要做成表，类似的工作可以先做了，这样以后写论文时要轻松点，当然这个工作越细致越好，别到时东西太多自己都搞不清什么是什么了就适得其反了
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