本科的毕业论文不会放在档案里的。一般本科毕业论文的最终审核和学位发放的相关表格会整理在学生的人事档案中，当时本身的论文不会进入人事档案，毕业院校会保留一份纸质版的毕业论文，同时将电子版上传至论文库进行保存和审核。
是没有的，本科毕业后的归档是每一个毕业生都要进行的行为，会有一个档案袋装材料，里面装的是学生的入学材料比如高中档案、高考档案这些和在校期间的材料比如资格证书认定表这些，以及毕业材料比如毕业成绩单这些。
知网。毕业论文，按一门课程计，是普通中等专业学校、高等专科学校、本科院校、高等教育自学考试本科及研究生学历专业教育学业的最后一个环节，为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前总结性独立作业、撰写的论文。
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