论文查重的是整篇论文不止是论文的正文。论文审核不通过的原因有很多种，比如你的查重重复率太高，写的论文正文与标题关系不大等等
论文查重各学校要求不一样，有的是论文全部都查，有的不查封面、声明、授权、目录、注释、参考文献。论文审核不通过原因有很多，论文查重率高、文章写作上存在明显问题或错误（格式、结构、逻辑、语言有问题）、文章没创新、论文主题与投刊物不匹配等。
是正文，不通过的原因可能是因为查重率太高了，你可以进行修改，或者问一下导师。希望我的回答对你有帮助，欢迎采纳我的回答，谢谢
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