另一个可能是罪魁祸首导致HIV enteropathy局部活化的GI的免疫系统。CB8浸润的细胞毒T细胞,举个例子,已经被观察到的结果绒毛萎缩在个体腹腔疾病患者。表达的t细胞刺激也足以引发enterocyte体外组织异常体培养。此外,免疫炎性因子如肿瘤坏死因子(TNF),干扰素(IL)- 12,IL-8参与的炎症性肠病。特别是,高水平的TNF被认为导致细胞凋亡与anti-TNF enterocytes和治疗具有重要的临床受益抗体对个人与节段性回肠炎。关于HIV enteropathy局部免疫活化,可能扮演一个造型的角色,其实,高水平的促炎症介质,例如,IL-10 IL-6测试版的趋势因子,并使用干扰素方面则主要分布在固有层的结肠的HIV感染者。作者称,羟基氯喹的这种炎症消化道内与病毒的复制。虽然全身免疫激活是一个标志性的HIV-infection,其病因仍然不是很清楚。然而,它已经被合理假设,当地的细菌入侵上皮屏障受损紧在可能允许施用生物菌肥可刺激免疫系统,通过受体局部,大概是Toll-like受体等。因为艾滋病病毒感染激活喜欢CD4 T细胞,这是一个关键的后果诱导局部炎症以任何手段,也涉及到CD4 T细胞活化并可以提供额外的目标,从而扩大它的病毒的复制