1.《用责任取代权利——公共行政的逻辑》,《南京农业大学学报》(社科版)2003年第1期,独著 注:人大复印资料《公共行政》2003年第5期,全文转载2.《论权责统一:公共行政的理论逻辑》,《江南大学学报(社科版)》,2003年第3期,独著3.《论公共行政责任的实现》,《理论月刊》,2003年第4期,独著4.《务实:公共行政基本的行为取向》,《学术论坛》,2003年第4期,独著5.《民谣:公共行政作风的社会评价》,《汕头大学学报(社科版)》,2003年第4期,独著注:人大复印资料《公共行政》2003年第6期,全文转载6.《行政价值观乃公共行政之“魂”》,《南京市委党校南京行政学院学报》2003年第6期,独著。7.《“德才兼备”与当前干部素质问题》,《党政干部论坛》2003年第10期,独著。8.《论公共行政责任存在的逻辑前提》,《南京农业大学学报》(社科版),2004年第1期,独著 注:人大复印资料《公共行政》2004年第7期,全文转载9.《加快人事制度改革 提高人力资源效率》,《学术论坛》,2004年第2期,独著10.《论影响政府效率的行政文化形态》,《深圳大学学报(社科版)》,2004年第2期,独著注:人大复印资料《公共行政》2004年第8期,全文转载11.《“服务型政府”价值实现的制度支持》,《江海学刊》,2004年第3期,独著12.《行政作风建设由伦理走向法治》,《社会科学家》,2004年第3期,独著13.《论群众对公共行政活动的评价》,《三峡大学学报(社科版)》,2004年第4期,独著14.《作风与素质:外显与内化的逻辑》,《安徽教育学院学报》,2004年第4期,独著15.《制度化:行政作风建设的现实选择》,《党政干部论坛》,2004年第7期,独著16.《历史与逻辑视野中的“服务型政府”》,《南京社会科学》,2004年第9期,独著注:人大复印资料《公共行政》2004年第12期,全文转载17.《“高效”行政源于行政体制与机制创新》,《理论月刊》,2004年第9期,独著18.《论行政权力的双重规定性:权利与义务》,《汕头大学学报(社科版)》,2004年第5期,独著19.《廉洁:一道公共行政的道德底线》,《湖南社会科学》,2004年第6期,独著20.《从我国行政改革看提高行政效率的逻辑》,《南农业大学学报(社科版)》,2004年第4期,第2作者 注:人大复印资料《公共行政》2005年第3期,全文转载21.《行政伦理何以可能:研究进路与反思》,《江海学刊》,2005年第1期,独著注:人大复印资料《公共行政》2005年第5期,全文转载22.《“责任政府”及其实现途径》,《江苏社会科学》,2005年第1期,独著注:文章观点被《新华文摘》2005年第7期“论点摘编”栏目收录23.《论控制公共权力的四条途径》,《理论探讨》,2005年第2期,独著24.《论我国公共行政价值的三大问题》,《长白学刊》,2005年第2期,独著25.《论我国政府形象的三大转变》,《社会科学家》,2005年第2期,第1作者26.《行政价值观建设的两个着力点》,《南京农业大学学报(社会科学版)》,2005年第1期,独著27.《剖析社会治理研究中的一个分析框架》,《教学与研究》,2005年第4期,独著注:人大复印资料《公共行政》2005年第11期,全文转载28.《政府与自然关系的伦理建构》,《社会科学研究》2005年第3期,独著注:人大复印资料《公共行政》2005年第10期,全文转载《论“服务型政府”的根据、内涵与宗旨》,《江汉论坛》2005年第9期,独著《政府与学府:权威博弈、伙伴关系与责任指向》,《高等教育研究》2005年第11期,独著《和谐社会与政府德性-----以政府与社会伦理关系为视角》,《中国行政管理》2005年第12期,独著。《第三部门的缘起、现状及其发展:东西方比较的视角》,《美中公共管理》2005年第11期,(第2作者)《当代中国公共行政之反思》,《南京农业大学学报(社会科学版)》,2006年第1期,独著《政治文明与服务型政府:两种话语链接》,《深圳大学学报(社科版)》,2006年第2期,独著 注:本文被《高等学校文科学术文摘》2006年第3期,“学术卡片”栏摘发35.《政府与市场的关系:双重博弈与伙伴相依》,《江海学刊》2006年第2期,独著 注:人大复印资料《国民经济管理》2006年第7期,全文转载《“权力行政”向“责任行政”的范式转化》,《学术论坛》2006年第3期,独著注:人大复印资料《公共行政》2006年第7期,全文转载《政治文明与服务型政府的“范式”链接》,《理论探讨》2006年第3期,独著38.《节约型政府:境遇、用度与路径的剖析》,《社会科学研究》2006年第4期,独著注:人大复印资料《公共行政》2006年第11期,全文转载39.《社会主义政治文明:一种“话语”解读》,《江汉论坛》2006年第7期,独著注:人大复印资料《社会主义论丛》2006年第10期,全文转载40.《论“十大行政伦理关系”》,《社会科学》2006年第9期,独著注:人大复印资料《公共行政》2006年第12期,全文转载41.《政府与企业:利益博弈与道德博弈》,《江苏社会科学》2006年第5期,独著42.《关系、伦理关系与行政伦理关系》,《湖南社会科学》2006年第6期,独著《新世纪政府能力研究:反思与超越》,《南京工业大学学报(社会科学版)》2006年第2期,(第2作者)44.《“委托代理”视角下的行政成本分析》,《江苏省社会主义学院学报》2006年第6期,(第2作者)45.《政治领域的道德风险辨析—“委托代理理论”的视角》,《中共南京市委党校南京市行政学院学报》2006年第6期,(第2作者)46.《区域行政与长三角一体化》,《南京工业大学学报(社会科学版)》2006年第4期,(第2作者)47.《政府间关系:合作博弈与府际治理》,《学海》2007年第1期;独著48.《论政府的价值与政府人的角色》,《南京政治学院学报》2007年第1期,(第2作者)《论公共行政客观责任的类型与作用》,《南京社会科学》2007年第3期,(第2作者)《由“碎片化”走向“组织化”——中国新农村建设的战略构想》,《社会科学》2007年第6期,刘祖云,曲福田《有限政府:研究综述与反思》,《甘肃行政学院学报》2007年第3期,刘祖云、武照娇注:人大复印资料《公共行政》2008年第1期,全文转载52、《任务型组织:提出、传播及其价值》,《南京农业大学学报(社科版)》2007年第3期,刘祖云、李燕、高振杨《提高政府效率:理论、困境与出路》,《南京工业大学学报(社科版)》2007年第3期,独著。《高等农业院校“文化素质选读课”结构探析》,《中国农业教育》2007年第4期,独著《透明政府:一种政府研究模式的反思》,《中共南京市委党校南京市行政学院学报》2007年第5期,(第2作者)《透明政府:研究现状与发展初探》,《四川行政学院学报》2007年第5期,(第2作者) 《行政权力:双重特性与两个倾向》,《长春市委党校学报》2007年第6期,独著注:人大复印资料《公共行政》2008年第4期,全文转载《政府与公民关系:契约与责任之张力》, 《南京工业大学学报(社会科学版)》,2008年第1期,独著《公共政府:综述、比较与反思》, 《安徽大学学报(哲学社会科学版)》,2008年第1期,第一作者《非政府组织:兴起背景与功能解读》,《湖南社会科学》,2008年第1期,独著《政府与官员的关系:道德冲突与伦理救治》,《学海》2008年第1期,独著《 政府与非政府组织关系:博弈、冲突及其治理》,《江海学刊》2008年第1期,独著《责任政府:行政问责从学术、立法到机制的逻辑》,《学术界》2008年第5期,第一作者 注:《中国社会科学文摘》2009年第2期收录《生态型政府:形式与内容的三重统合》,《江苏行政学院学报》2008年第5期,独著《政府官员上下级关系:“位差”调适与化解》,《社会科学》2008年第8期,独著《法治政府:“德性”内涵的三重解析》,《江苏社会科学》2008第4期,独著《有限政府:质、量、度的三重解析》,《学习论坛》2008年第7期,第一作者《生态型政府:现实性、学术性与价值性》,《社会科学研究》2008年第3期,第一作者《政府的“三种能力”:情境认知、组织调适与社会治理》, 《上海行政学院学报》,2009年第1期,第一作者《 技能、制度与道德:政府学习的三重境界》,《甘肃行政学院学报》,2009年第2期,第一作者《行政文明:一个马克思主义的理念与范畴》,《南京工业大学学报(社会科学版)》,2009年第1期,第一作者《服务型政府:“主体间”互动的分析视角》,《南京农业大学学报(社会科学版)》,2009年第1期,独著《公共政府:“二源”基础、异化及其回归》,《学海》2009年第1期,独著《透明政府:一个政府模式变革的历史与逻辑》,《四川大学学报(哲学社会科学版)》,2009年第1期,第一作者《中国传统行政伦理思想发展的历史与逻辑》,《深圳大学学报(人文社会科学版)》,2009年第3期,第二作者《有限政府:实现行政权控制的三个理路》,《学习论坛》,2009年第5期,独著