脚注中标记的是你引用过的文献，参考文献中写的是你在写论文时看过那些著作、期刊杂志或者报纸、论文，这些著作论文等你可以不引用。也就是说，脚注中内容必须出现在参考文献里，参考文献要包含脚注。脚注一般在文章第一页，在正文部分的左下侧，是写作者的个人信息，例如作者，哪里人等信息或通讯作者的信息，这篇发表的这篇文章是哪个项目或者基金的组成部分。写了脚注还要写参考文献吗既然是论文，就一定是要发表的，不是自己记录的文献阅读报告或者实验报告亦或是数据处理报告。论文总体可分为两种类型，期刊论文和非期刊论文（学位论文、会议论文等）。不同的发表平台，具体的论文都有参考文献和其他引用格式要求。一般而言，对于公开发表的引用都用参考文献的形式进行引用，对于一些极少数的特殊情况需要用脚注来说明，但不论如何脚注和参考文献都不应该重复。
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