本科期间的毕业论文是保存在学校的，正常情况下是会一直保留下去的。可以自己咨询一下自己学校的具体规定。
建议询问学校。一般来说，本科毕业论文将会保存5至6年。教育局相关部门还会在3至5年里进行复查，以抽查的形式，毕业论文都会有电子版，学校会帮你一直保存。以广东财经大学为例，毕业论文(设计)存档期为五年，即学生离校五年后毕业论文由教务处统一处理，不再保留。
不会的。研究生九月会有秋查的，但是已经毕业工作的不会的，学校不会那么闲的，而且查重是要掏钱的。但是你毕业那会儿还是会有抽查的，学校毕业当季会有，都毕业了就不会的啦！！！查重这个事情，没什么关系的，在校期间内你没有毕业之前，查重率高了，学校也只会给你退回来重新修改，也不影响学分，我们学校有人改了六七次，没什么大碍的，只要毕业的时候，毕业论文，毕业答辩过了，学位证书取得以后就没关系的
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