这里面包括几方面问题: 1、合作是以什么方式? a 许可你公司使用;b 专利作价出资与你公司成立新公司;c转让给你公司 2、不管何种方式,也不管是否到专利局作了备案,签订的合作协议是受合同法保护的, 3、专利许可或者专利转让是需要全体专利权人同意后才能在专利局办理相关手续。以房产为例,夫妻二人为房产共同所有人,女方与第三人签订买卖合同,并收取了房款,这时结果可能两种,一伪造过户手续,二男方一直不知情。 这种情形下,男方都可以要求终止合同,但第三方可以要求继续履行,虽然手续不合法或者一方不知情,影响的是过户手续问题,但是买卖合同是受保护的。换到你提的问题,若是合作中手续未办理或者不合法,你们支付出的费用有无法收回的可能。