论文查重各学校要求不一样，有的是论文全部都查，有的不查封面、声明、授权、目录、注释、参考文献。论文审核不通过原因有很多，论文查重率高、文章写作上存在明显问题或错误（格式、结构、逻辑、语言有问题）、文章没创新、论文主题与投刊物不匹配等。
硕士论文会分为内审和外审，相比较来说内审的要求会相对低一些。每个学院都会抽取一定的比例进行外审，剩下的就是内审。所谓内审就是进行内部审查，论文的评阅是本学院的但不是本实验组的老师进行评阅，会有三个老师进行评阅打分，分当然是越高越好，只要有一个低于80分，还会进行第二次审查。评阅后会有意见，你需要按照意见来进行修改，修改之后才会让你进行答辩。内审一般只要工作量够，只要你好好写论文修改论文就能让你过，即使你第一次没有过。
是正文，不通过的原因可能是因为查重率太高了，你可以进行修改，或者问一下导师。希望我的回答对你有帮助，欢迎采纳我的回答，谢谢
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