食品配方专利一般按如下方式进行申请：1、具有申请资格的人向专利局提交请求书、说明书及其摘要等文件，请求书应当写明发明的名称，发明人的姓名，申请人姓名或者名称、地址，以及其他事项；2、专利局受理并逐步审查，实质审查后发现没有驳回理由的，就授予专利权，发给专利证书，并公告。申请专利和行使专利权应当遵循诚实信用原则。不得滥用专利权损害公共利益或者他人合法权益。在专利申请公布或者公告前，国务院专利行政部门的工作人员及有关人员对其内容负有保密责任。《中华人民共和国专利法》第二十九条申请人自发明或者实用新型在外国第一次提出专利申请之日起十二个月内，或者自外观设计在外国第一次提出专利申请之日起六个月内，又在中国就相同主题提出专利申请的，依照该外国同中国签订的协议或者共同参加的国际条约，或者依照相互承认优先权的原则，可以享有优先权。申请人自发明或者实用新型在中国第一次提出专利申请之日起十二个月内，或者自外观设计在中国第一次提出专利申请之日起六个月内，又向国务院专利行政部门就相同主题提出专利申请的，可以享有优先权。
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