若学校要求学生查重使用知网查重系统，则学生必须将硕士论文上传至知网中进行检测；若学校要求学生使用其他类型查重系统，学生可以不用将硕士论文上传至查重系统中，但必须按照规定，将硕士论文上传至对应的查重系统。因此学生在查重前，需要自己查看学校公布的查重规则，若不符合查重要求，可能会出现学校查重不合格的情况。如果是查重后的论文，是否要上传到知网上面，就要看该论文是否优秀，不过即使是优秀的论文也要按照学生自己的意愿。学生不同意上传到知网，学校也是不能强求的。
不仅仅是硕士的毕业论文，包括本科的毕业论文，只要经过学校进行存档之后，所有的都会加密，然后上传到知网上，也就是说所有的论文都可以在知网上查询得到。
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