会的。2011年以后基金会开始使用查重系统。没中的话原则上可以重复，但前提是相同申请人；但如果查到和中过的本子重复内容过多，会被初审砍掉，不会进入评审阶段。注意事项：只要是没中的项目，不会查重，只查跟已经资助和同年其他人申请的项目。
国家自然基金近几年开始查重，将本年度的申请书与已批准立项的所有申请书数据库以及同年的申请书进行对比，往年申请书未批准立项者不纳入数据库。希望对你有帮助！
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