最好是是要整篇进行查重了，查完之后对照着查重报告修改，就是要不断反复的修改再查重这么一个过程的
论文查重，是查全文的，不是只查正文。论文审核不通过的原因很多，查重只是最基本的。比如你的文章内容可能与刊物不符合，或者是文章质量达不到刊物要求。还有可能是文章内容不适合发表等。
论文查重各学校要求不一样，有的是论文全部都查，有的不查封面、声明、授权、目录、注释、参考文献。论文审核不通过原因有很多，论文查重率高、文章写作上存在明显问题或错误（格式、结构、逻辑、语言有问题）、文章没创新、论文主题与投刊物不匹配等。
是正文，不通过的原因可能是因为查重率太高了，你可以进行修改，或者问一下导师。希望我的回答对你有帮助，欢迎采纳我的回答，谢谢
具体看每个高校的论文查重要求与标准
论文查重的是整篇论文不止是论文的正文。论文审核不通过的原因有很多种，比如你的查重重复率太高，写的论文正文与标题关系不大等等
论文查重当然不仅仅是考虑正文部分，而是对论文的全部内容进行查重，不仅包括正文还包括摘要以及参考文献。
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