2006年至2015年，学校科研经费达38亿元，获得国家及部省级科技成果奖100余项，其中作为第一完成单位获得国家科技进步一等奖1项、二等奖7项、技术发明奖二等奖3项。学校凭借雄厚的科研实力，主动服务社会、服务“三农”，创造了巨大的经济社会效益，多次被评为国家科教兴农先进单位。 截至2014年9月，学校被ESI收录论文5242篇，被引用36011次。 2013年度主要科技成果获奖情况一览表 序号 成果名称 获奖类别及等级 授奖部门 第一完成人 1 冷却肉品质控制关键技术及装备创新与应用 国家科学技术进步奖二等奖 国务院 周光宏 2 梨高光效树形及花果管理技术研发与应用 高等学校科学研究优秀成果奖技术发明奖一等奖 教育部 张绍铃 3 有机肥作用机制和产业化关键技术研究与推广 高等学校科学研究优秀成果奖科学技术进步奖、一等奖 教育部 沈其荣 4 农田固碳减排研究及应用 高等学校科学研究优秀成果奖科学技术进步奖、二等奖 教育部 潘根兴 5 中国农田温室气体排放与减排增汇研究 江苏省科学技术奖一等奖 江苏省人民政府 黄耀 6 梅种质资源研究与创新利用 江苏省科学技术奖三等奖 江苏省人民政府 房经贵 7 棉纤维发育的基因组学与分子育种研究团队 中华农业科技奖优秀创新团队 农业部中国农学会 张天真 8 苏淮猪新品种培育与推广应用 中华农业科技奖科学研究成果二等奖 农业部中国农学会 王林云 9 小四轮拖拉机与农用运输车常见故障诊断排除图解 中华农业科技奖科普奖 农业部中国农学会 鲁植雄 10 克氏螯虾营养需求研究及人工配合饲料的研发与应用 江苏省海洋与渔业科技创新奖三等奖 江苏省海洋与渔业科技创新奖奖励工作办公室 刘文斌 11 长江下游农区多花黑麦草高产栽培及利用技术的基础研究 中国草业科技奖二等奖 中国草学会 沈益新 12 梨生殖生理与分子生物学研究团队 华耐园艺科技奖 中国园艺学会等 张绍铃 13 中国工业化、城镇化进程中的农村土地问题研究 第六届高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）一等奖 教育部 曲福田 图书馆藏 根据2015年3月图书馆网站显示，学校图书馆有藏书208万册，电子图书65万册，电子西文期刊12000种，电子中文期刊16200种。 学术期刊 《南京农业大学学报（社会科学版）》《南京农业大学学报（社会科学版）》于2001年创刊，是南京农业大学主办的学术性理论刊物，现为双月刊。该刊入选CSSCI来源期刊、全国中文核心期刊、国家社科基金资助期刊、教育部名栏工程入选期刊、人大复印资料重要转载来源期刊。 《南京农业大学学报》《南京农业大学学报》为全国中文核心期刊。该刊已被美国《化学文摘》（CA）、英国《国际农业与生物技术文摘》（CABI）、美国《剑桥科学文摘（自然科学）》（CSA）、英国《动物学记录》（ZR）、俄罗斯《文摘杂志》（AJ）、波兰《哥白尼索引》（IC）、日本科学技术振兴机构文献数据库（JST）收录；该刊还呗《中文核心期刊要目总览》(2013年版)、中国科学引文数据库（核心库）（CSCD）、中国科技论文统计源期刊（CJCR）（中国科技核心期刊）、中国科技期刊精品数据库、《中国学术期刊评价研究报告》（RCCSE）核心期刊、中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）、中国期刊全文数据库（CJFD）、中国科学引文索引（CSCI）、《中国学术期刊文摘》（英文版）、《中国生物学文摘》等收录。 《中国农业教育》《中国农业教育》杂志是教育部主管、南京农业大学主办的一份国内外公开发行的国家级综合性农业教育刊物，创刊于1992年。 该刊是《中国学术期刊（光盘版）》、《中国期刊网全文数据库》及《中文科技期刊数据库》来源期刊。 《畜牧与兽医》《畜牧与兽医》是由中国已故著名学者罗清生教授等老一辈科学家于1935年创刊，建国后王栋教授等于1950年复刊，是我国第一本国内外公开发行的畜牧、兽医类综合性科技期刊。现由教育部主管、南京农业大学主办。该刊设有“试验研究”、“畜牧生产”、 “兽医科技”、“疾病防治”、“专题论述”、“文献综述”、“畜牧兽医简报”等6个固定栏目，以及“动物保护”、“专家论坛”等几个不定期栏目。
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