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这里面包括几方面问题： 1、合作是以什么方式？ a 许可你公司使用；b 专利作价出资与你公司成立新公司；c转让给你公司 2、不管何种方式，也不管是否到专利局作了备案，签订的合作协议是受合同法保护的， 3、专利许可或者专利转让是需要全体专利权人同意后才能在专利局办理相关手续。以房产为例，夫妻二人为房产共同所有人，女方与第三人签订买卖合同，并收取了房款，这时结果可能两种，一伪造过户手续，二男方一直不知情。 这种情形下，男方都可以要求终止合同，但第三方可以要求继续履行，虽然手续不合法或者一方不知情，影响的是过户手续问题，但是买卖合同是受保护的。换到你提的问题，若是合作中手续未办理或者不合法，你们支付出的费用有无法收回的可能。
以前有人也问过类似问题，当时的回答请参考下面，希望对你有用，可能需要在上面改一改了：
专利许可合同的类型有： 1、普遍许可合同，又称非独占许可合同。 2、排他许可合同，又称独家许可合同。 3、独占许可合同，又称完全许可合同。 4、分售许可合同。 5、交叉许可合同，又称互惠许可合同。 【法律依据】 根据《合同法》第三百四十六条，专利实施许可合同的受让人应当按照约定实施专利，不得许可约定以外的第三人实施该专利；并按照约定支付使用费。
专利实施许可合同是指专利权人或其授权的人作为让与人，许可受让人在约定的范围内实施专利，受让人支付约定的使用费所订立的合同。受让人在合同成立后，可以在约定的地区、期限内和按约定的方式实施专利技术。按照让与人出让专利使用权和受让人取得专利使用权的程度和范围，专利实施许可合同可分为如下形式：①独占专利实施许可合同。独占专利实施许可合同，是指受让人在规定的范围内享有对合同规定的专利技术的使用权，让与人或任何第三方都不得同时在该范围内具有对该项专利技术的使用权。②排他专利实施许可合同。排他专利实施许可合同，是指受让人在规定的范围内享有对合同规定的专利技术的使用权，让与人仍保留在该范围内的使用权，但排除任何第三方在该范围内对同一专利技术的使用权。③普通专利实施许可合同。普通专利实施许可合同，是指受让人在规定范围内享有对专利技术的使用权，同时让与人不仅保留着在该范围内对该项专利技术的使用权，而且还保留着在该范围内将该项专利技术的使用权出让给任何第三方的权利。许可形式可以包含给予受让人再转让许可。再转让许可应当是普通实施许可。专利许可合同范本
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专利技术转让合同范本合同编号：__________________ 项目名称：__________________ 受让方(甲方)：________________ 签订时间：______年___月___日 让与方(乙方)：________________ 签订地点：__________________ 有效期限：_______年____月____日至_______年____月____日 填写说明： 一、本合同为中华人民共和国科学技术部印制的技术转让(专利权)合同示范文本，各技术合同认定登记机构可推介技术合同当事人参照使用。二、本合同书适用于一方当事人(让与方、原专利权人)将其发明创造专利权转让受让方，受让方支付约定价款而订立的合同。三、签约一方为多个当事人的，可按各自在合同关系中的作用等，在“委托方”、“受托方”项下(增页)分别排列为共同受让人或共同让与人。四、本合同书未尽事项，可由当事人附页另行约定，并作为本合同的组成部分。太多了，你还是进这个网址下载吧_S5vql_kGmEqapzzjE30vOrkea2aEOf8pLEDdfnD-RYJQ4pA2mrki8oVjp06fZfzQWzYNNgSLYQQREJuVCTn7
外观专利文件，申请书还有就是营业执照或者是个人身份证