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我的解决方法是，把word和endnote都用管理员身份运行，然后就可以了。希望能帮助到你。
右键选择以管理员运行即可
这是不正确操作引起的。正确操作：在Word中的EndNote选项卡下，最左侧有个"Edit & Manage Citation"按钮，点击弹出引文管理对话框。在这个对话框中，选择对某个引文单独排序，或者删除操作，这样才不至于发生错误。编辑一篇文章的参考文献真是一项体力活，所以还是规范操作，尽量避免遇到问题，避免返工的好。
解决办法1： 打开WORD,选择菜单栏“工具”，再选择“自定义”，打开后在“endnote”选项前打钩。然后就可以看到了。 解决办法2： 在endnote安装目录里找到 EN Cdot或者EN CWordXPwll，copy到C:\Documents and Settings\你的用户名 \Application Data\Microsoft\Word\STARTUP，重启一下word，这样endnote插件就在word中出现了。 根据word版本不同， endnote 文件名不尽同 EndNote word Files 8 2000 EN8CWYWdot EN8Cwll 8 XP/2003 EN8CWYWdot EN8CWordXPwll 9 2000 EN9CWYWdot EN9Cwll 9 XP/2003 EN9CWYWdot EN9CWordXPwll 红色为版本，其他版本可类推。 解决办法3： （建议丫丫不要用） 1，开始→运行→cmd→确定，CD "C:\Program Files\EndNote X1\Product-Support\CWYW"（这里的路径视个人安装的实际路径来定的，当然符号“”是没有的） 2，输入：regsvr32 "EndNote Cdll", enter（“”是有的）。 解决办法4：把Endnote安装路径EndNoteX2\Product-Support\CWYW文件夹下的两个文件EndNote Cwyw 和 EndNote Cwyw,拷贝到C:\programdata\microsoft\windows\startmenu\programs\startup下面。注意了，要把显示隐藏文件打开，才能看到完整路径， （C:\ProgramFiles\EndNote X3\Product-Support\CWYW 的两个文件 Endnote Cdll 和Endnote Cdot）kevin 这是X3版本的。 解决办法5：Office按钮-word选项——加载项——管理【com加载项】选边上的“转到”-添加——选择Endnote安装路径EndNoteX2\Product-Support\CWYW文件夹下的文件EndNote Cdll。注意要以管理员身份进行，因为这些写入了注册表。
如何自动生成参考文献
如何自动生成参考文献
采用合适的编辑方法会方便地做到整齐,规范,自动排序和交叉引用。以尾注的方式插入第一个参考文献。将光标定位于word文档中将要插入参考文献的位置，按"插入/引用/脚注和尾注"。出现一菜单，选择"尾注"，"文档结尾"，编号格式为"1,2,3"。按"插入"按钮。按要求的格式输入参考文献内容。这时你会发现文本中的序号"1"字是上标格式的，这是你所希望的。但尾注中的"1"也是上标格式的，这不是你希望的。其余的格式也不合你愿，别急。用鼠标在最左侧处选中尾注中的序号"1"，按快捷键"ctrl+shift+="就可以使序号不再是上标，或用鼠标右击，出现一菜单，选择"字体"，在第二张菜单中去掉"效果"栏中"上标"前面的"√"。说明：序号周围有似隐似现的框，这表示所插入手稿的尾注是一种"域"，不必理会它。插入第二个尾注的方法是同样的。Word会根据所在位置的前后自动排序。在第一个参考文献的前面有一条横线，你会发现无法删除。它叫"尾注分隔符"。 去除"尾注分隔符"我们一般的编辑界面叫"页面视图" ，选择"视图/普通"进入普通视图。按"视图/脚注"，此时编辑界面分为两个部分，下面的编辑框是尾注编辑框。选择尾注编辑框中的"尾注"下拉框，选择"尾注分隔符"，出现一条横线，选择该横线，删除它，再选择"尾注延续分隔符"，也会出现一条横线(这是尾注分页时会出现的很长的横线)，选择该横线，删除它。关闭后，再按"视图/页面"切换回来。 交叉引用当你在文档中第N(N>=2)次引用前面文档曾经引用过的文献时，这时宜采用"交叉引用"。方法：按"插入/引用/交叉引用"，出现一菜单，在引用类型中选择"尾注"，引用内容为"尾注编号"，这时在菜单中会出现你曾经编写过的所有尾注，选择你需要的，按"插入"按钮即完成交叉引用了。(注：若你后来又在前面的文档中插入新的尾注，这时后继的尾注会自动更新编号，但交叉引用不会自动更新。怎么办？按"ctrl+A"选择所有内容后，按"F9"键就可以完成手动更新。)
采用合适的编辑方法会方便地做到整齐,规范,自动排序和交叉引用。以尾注的方式插入第一个参考文献。将光标定位于word文档中将要插入参考文献的位置，按"插入/引用/脚注和尾注"。出现一菜单，选择"尾注"，"文档结尾"，编号格式为"1,2,3"。按"插入"按钮。按要求的格式输入参考文献内容。这时你会发现文本中的序号"1"字是上标格式的，这是你所希望的。但尾注中的"1"也是上标格式的，这不是你希望的。其余的格式也不合你愿，别急。用鼠标在最左侧处选中尾注中的序号"1"，按快捷键"ctrl+shift+="就可以使序号不再是上标，或用鼠标右击，出现一菜单，选择"字体"，在第二张菜单中去掉"效果"栏中"上标"前面的"√"。说明：序号周围有似隐似现的框，这表示所插入手稿的尾注是一种"域"，不必理会它。插入第二个尾注的方法是同样的。Word会根据所在位置的前后自动排序。在第一个参考文献的前面有一条横线，你会发现无法删除。它叫"尾注分隔符"。 去除"尾注分隔符"我们一般的编辑界面叫"页面视图" ，选择"视图/普通"进入普通视图。按"视图/脚注"，此时编辑界面分为两个部分，下面的编辑框是尾注编辑框。选择尾注编辑框中的"尾注"下拉框，选择"尾注分隔符"，出现一条横线，选择该横线，删除它，再选择"尾注延续分隔符"，也会出现一条横线(这是尾注分页时会出现的很长的横线)，选择该横线，删除它。关闭后，再按"视图/页面"切换回来。 交叉引用当你在文档中第N(N>=2)次引用前面文档曾经引用过的文献时，这时宜采用"交叉引用"。方法：按"插入/引用/交叉引用"，出现一菜单，在引用类型中选择"尾注"，引用内容为"尾注编号"，这时在菜单中会出现你曾经编写过的所有尾注，选择你需要的，按"插入"按钮即完成交叉引用了。(注：若你后来又在前面的文档中插入新的尾注，这时后继的尾注会自动更新编号，但交叉引用不会自动更新。怎么办？按"ctrl+A"选择所有内容后，按"F9"键就可以完成手动更新。)
1、先偷懒吧，到EndNote的主站搜索，看是否有你要的Journal格式；如果没有只有自己学啦。2、打开一个EndNote数据库／Edit／OutputStyles/Edit………意思是将你默认的参考文献格式进行修改，因为重新编写有些语法可能不太会。技巧，先从找一个参考文献和自己要求相似的格式。如没有经验，SCI格式是缩略格式，NeuroReport是完整格式（在中国比较流行的相似格式）。3修改正文格式4修改参考文献模板改好参考文献的模板后，最难的就是作者排名和作者显示风格5下面更改作者显示风格6更改作者缩写格式7参考文献罗列时的风格，是用［1］…表示还是用1…表示8其他格式可以点点看看，思路相近9当您全部弄好了后就可以保存了，保存时一定要保存在EndNote\Styles的文件夹下面，否则无法调用。
从Word的工具栏里进入“EndN0”子菜单选择点击“Remove Field Codes”，出现一个提示框告诉你“该操作将创建一个新的去掉了所有域代码的Word文档，原文件仍然打开且无改动”，点击“确定”将新文件存到指定地点。新文件内容和原文件完全相同，只是无域代码，因此不能再对引文进行格式化。
Endnote在书写英文论文手稿的过程中，可以自动的添加加参考文献以减少工作量。当按照一个期刊的格式书写完手稿后，需要换个英文期刊格式时，对应的就要将所有用Endnote插入的参考考文献的格式重现修改Endnote格式修改：1、打开需要修改参考文献格式的Word文档，在菜单栏中的Endnote X7中可以看到现在参考文献的格式为numbered2、点击Word菜单栏中的Endnote X7下的styles右边的下拉箭头，选择select another style3、在弹出的的对话框中找到所要修改期刊的名称Nature，然后选择确定（OK）4、此时，可以看到Word中参考文献格式便会变成Nature所要求的格式了。不管是正文中的小角标，还是最后面的参考文献的显示内容都发生了变化。5、如果不通过此方法，直接手动修改文中或者后面参考文献的格式是不行的，下次使用endnote会自动将格式变为原来的样子温馨提示：在没有定稿之前，一定不能格式化Endnote与word的关联，这样可以方便随时修改参考文献的格式
Edit → Output Styles → Open Styles Manager…→ 找到一种较接近的参考文献目录格式，进行修改（Edit 按扭）。注意：1、在Citations → Templates 点击后，Bibliography Number要加左右方括号，注意是上标，还是不是上标。2、关键的是Bibliography → Templates 点击后, 有“Journal Article”、“Book”、“Book Section”、“Generic”等一系列值。要小心地反复调整。下面这些是比较好修改成常见的中文参考文献格式的：[1] 郭慧芳, 谢艳飞, 谢艳飞, 杜正文 不同稻螟发生区螟卵寄生蜂的自然寄生作用 中国生物防治, 2002, 18(1): 13-如 : J Adolescent Health Copy (Category属于Medicine)J Human Hypertension Copy (Category属于Medicine)J Human Lactation Copy (Category属于Medicine)J Inteferon Cytokine Res Copy (Category属于Biology)J Laparoendo Adv Surg Tech Copy (Category属于Biology)修改好后，在File → Save As 另存为一个格式， 如：“中文常用格式”。OK！在WORD 中插入文献中前 / 时 / 后，均可点击“Format Bibliography”，在“With Output”中选择我们刚才自定义的“中文常用格式”， “Temprorary citation delimiters”的“Left”方框中输入左方框号，在“Right”方框中输入右方框号。“确定”，即可！