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如果学校查重用的是知网系统，那么在知网论文查重系统中，如果格式正确的话，知网能够正确识别，就会排除论文末尾的参考文献，不参与检测，以灰色显示。如果格式错误，知网无法正确识别，就可能会被标红，从而影响重复率。参考文献格式样例：
以学校判定为准。毕业论文的格式是要按照学校的规定来写的，最后论文是交给学校来进行查重检测的。学校规定什么格式，论文就要以什么格式来完成。能否顺利的毕业，能否顺利的拿到毕业证书，这些都是由学校决定的，学校是以毕业论文来做判断的。国内权威论文检测机构主要有三家:Gocheck维普、知网CNKI、万方。论文查重也被称为论文检测，主要是指查询论文内容的重复率，目的在于应对学位论文学术不端和学术论文抄袭复制。论文检测查重率，即论文查重字数占总字数的百分比。如果参考文献格式不正确，知网查重检测系统就无法正确的识别出参考文献来，那么这个时候参考文献就会当做论文的正文部分来参与对比查重，此时参考文献大部分都会被标红。因为参考文献是在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴，征引过的文献在注释中已注明，不再出现于文后参考文献中。按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。
正规毕业论文查重是不包括参考文献的，参考文献并不在毕业论文查重范畴内。可是毕业论文查重并不能够识别全部的参考文献，只有符合格式的参考文献才会被毕业论文查重识别出来，这也就意味着只有参考文献的格式规范且正确的时候，毕业论文查重才会将该部分参考文献排除出查。
参考文献不会算在重复率里面的
不同的系统所收录的文件和资料内容是不一样的所以比对的结果也可能不一样这很正常就是说标准不一样，结论不一样
检测算法不一致除开某些数据库之外，检测算法也是直接影响到检测结果的至关重要原因，而有的论文查重系统只要检测到几个字存在着重复的话，便会被视作抄袭，不管这检测的论文与相似来源的文章之间会存在着哪些联系，是不是处在同一句话中。检测范围不一致多数检测系统是开展的全文检测，在其中含有的文章标题，论文摘要，及正文，要知道不同的提交检测方式，会在无形之中拉高你论文的重复率。每一个检测系统检测能力水平会存在着细微的不同，就会导致检测结果不一致，检测结果的精准度是必须做好更进一步了解的。比如说同个论文在不同论文查重软件中做好检测的话，检测到的结果也是基本不一致的。在其中以一些检测软件会存在着虚报现象，归属于一类错判，能基本不用理会。
参考文献不会算在重复率里面的
参考文献并不会影响我们的论文查询，只要我们引用了参考文献，那么在查重的过程肯定是不会会将这部分内容排除出去的，你需要组织自己的需要表述问题。
何必有论文查重时，包括参考文献相似，比你这个问题说的很笼统，应该具体一点，说清楚之后我才能给你解答
知网论文检测系统是可以识别到格式标准的参考文献的，格式正确系统会自动剔除不算重复率。如果格式有误，那么参考文献会被当成正文来检测将会标红算重复率。知网检测系统识别参考文献的标准： 有明显的“参考文献”标记，参考文献4个字独占一行，下面是各个参考文献条目； 每个参考文献有明显的标号，标号可以是以下任意一种：【Num】、[Num]、(Num)； 标号可以是Word自动生成也可以手工书写； 标号内不要添加标点符号，例如：不要[N]或(Num、)等； 每个参考文献中最好有时间休息或者URL或《》书目信息； 一条参考文献内及在此条参考文献没有结束时不要有手动换行或者回车符（即顺其自然，满行后会自动换行，请勿人为！）
只要参考文献的格式正确，高校查重系统可以识别出来参考文献，自动剔除不参与正文检测，也就不会算重复，也就是不影响查重结果。参考文献标准格式： 有明显的“参考文献”标记，参考文献4个字独占一行，下面是各个参考文献条目； 每个参考文献有明显的标号，标号可以是以下任意一种：【Num】、[Num]、(Num)； 标号可以是Word自动生成也可以手工书写； 标号内不要添加标点符号，例如：不要[N]或(Num、)等； 每个参考文献中最好有时间信息或者URL或《》书目信息； 一条参考文献内及在此条参考文献没有结束时不要有手动换行或者回车符（即顺其自然，满行后会自动换行！）
以学校判定为准。毕业论文的格式是要按照学校的规定来写的，最后论文是交给学校来进行查重检测的。学校规定什么格式，论文就要以什么格式来完成。能否顺利的毕业，能否顺利的拿到毕业证书，这些都是由学校决定的，学校是以毕业论文来做判断的。国内权威论文检测机构主要有三家:Gocheck维普、知网CNKI、万方。论文查重也被称为论文检测，主要是指查询论文内容的重复率，目的在于应对学位论文学术不端和学术论文抄袭复制。论文检测查重率，即论文查重字数占总字数的百分比。如果参考文献格式不正确，知网查重检测系统就无法正确的识别出参考文献来，那么这个时候参考文献就会当做论文的正文部分来参与对比查重，此时参考文献大部分都会被标红。因为参考文献是在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴，征引过的文献在注释中已注明，不再出现于文后参考文献中。按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。
有些系统不区分引用，标不标注没差。据我所知，gocheck论文检测专家会区分引用率和复写率，如果标注的不规范就有可能被判为相似