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很正常的事啊，退修再审，你就修改或完善你的论文，然后在投稿就是了。
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我的经验是，遇到这种情况，果断换杂志。
区别太大了，增刊在学校的话一般都按降低原刊一级处理，所以原来是核心增刊就不是核心了，不过计算机应用研究是CSCD收录的，有的学校认定增刊也属于CSCD（不过貌似很少）。说实话不是很喜欢这个期刊，虽然不要审稿费，不过太看重基金和名气了，没基金的话要创新度很高或研究很好，不然一般增刊（这个期刊不拒稿，拒的基本增刊，所以增刊的质量）
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计算机应用研究吧
《计算机应用研究》 目前是北大核心期刊+中国科学引文索引数据库（CSCD核心）-E，审稿非常严格。投稿时需要带上基金项目，至少是省级的科技类基金项目，国家自然科学基金更好，例如，国家自然科学基金（N610XXXXX），江苏省自然科学基金项目（N2015ABXXX），江苏省教育厅基础研究计划项目（N201609XX），江苏省科技厅科技攻关计划项目（NBA4XXXXX），否则很难录用正刊，增刊倒是挺容易的。正常情况下，审稿周期是2~3个月，如果运气好，恰好遇到个审稿速度快的外审专家，1个多月也能返回结果（通常外审专家都是到最后期限才返回，摆架子，显得自己很牛掰），如果遇到多次返回修改，则需要3~6个月不等，顺利录用还好，如果不录用，只能白白耽误3~6个月的宝贵时间，版面费一般在2500~4000之间，杂志社会提供发票和纸质用稿通知书，录用后需要1年多见刊。这个期刊主编主要收大学单位作者的文章，如果是二本或者高职院校投稿录用难度很大。建议您不要投这个期刊，可以试试《计算机仿真》、《计算机工程与设计》等期刊。以上讲的都是硬投稿情况，如果是走内部渠道操作就不一样了，像《计算机应用》《计算机工程》《计算机工程与应用》《计算机应用与软件》《计算机测量与控制》《计算机学报》《自动化学报》《机器人》《模式识别与人工智能》《控制工程》《重庆邮电大学学报自然科学版》《河北大学学报自然科学版》《电子器件》《东南大学学报自然科学版》《仪表技术与传感器》《传感技术学报》《电工技术学报》《电力电子技术》学海湾都有主编一手内部渠道，100%录用，快的话投稿后1周就能在投稿系统里查到录用，3个月左右见刊，可以节省您大量的时间。 希望能对楼主有帮助，您也可以去张老师的博客看一下。（）里面有更详细的介绍。我也是从他那里了解到的这些信息。
增刊就不要考虑了，正刊才是正规发布的，也是评职称可以参评的论文。我上半年就发表了一篇论文在上面，找键盘计算机论文网帮我操作的，2个月就录用了，但是需要保证你的文章有足够的创新点，键盘论文的老师帮我改了一大半，额，如果没时间就找高手帮忙吧，呵呵
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正刊和增刊都不怎么样。而且态度很不好，邮寄发票等都没有任何通知的~~~