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两者的内容不同:学术论文期刊是在某一学术课题具有的新的科学研究成果或创新见解和知识的科学记录,毕业论文(graduation study)是专科及以上学历教育为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前撰写的论文。两者的主体不同,毕业论文是学生写的,期刊论文是科学研究人员,包括学生写的。两者的时间不同,毕业论文的时间安排在修业的最后一学年(学期)进行,但是学术期刊论文没有限制时间。毕业论文目的在于培养学生的科学研究能力;加强综合运用所学知识、理论和技能解决实际问题的训练
您这个问题比较笼统，不同硕士或者不同期刊论文，其创新、分量和含金量有天壤之别硕士得看什么学校、什么学科的硕士；如果该专业有国家一级重点学科，这种学校的硕士论文一般还是不错的；期刊也得看什么样的期刊，分省级、国家级、还有像SCI、CELL等这类国际顶级期刊最好把您的问题具体化，这样大家才能比较准备的回答您的提问
正刊： 这个就是文章被正式评审录用，然后排队发表的。根正苗红，当然没有问题。 专刊： 用英文来说就是Special 许多国际上著名的杂志（如IEEE Trans）都搞这个。不能说专刊就比正刊差了。专刊的目的是针对目前某一个热点研究话题来一次华山论剑，以便引起重视。在专刊上发表论文的，一般都是这个领域做的比较好的。专刊与正刊的不同是论文发的周期要短一些，主要围绕某一个专题。由于占出版空间，所以也算是根正苗红。 增刊：会议利用期刊名誉来吸引投稿。然后期刊又怕这样的会议文章影响杂志的声誉，所以取了名叫增刊。『有些增刊上的文章也很牛，如果会议很牛的话』，外文增刊用“ONS”表示。
正刊是指期刊正常出版的期刊，比如月刊，每月出一本，连续的，就是正刊。一般封面上都注明1期、2期、3期…… 总第xx期等等。增刊和专刊，都是临时性出的，是在正刊之外的。不属于正常连续出版的期数里面，一般增刊或专刊都会在封面上注明“增刊”“专刊”字样，也有的注明“Z1”“Z2”，没有注明是第几期。正常情况下，增刊的内容是不被期刊网收录的。不过最近几年，学术刊物的增刊和专刊不算分了，有些编辑部出增刊和专刊的时候，就故意在封面上写上第xx期，不注明或者在极其不容易发现的地方注明“增刊”“专刊”字样，以迷惑作者和读者，甚至还有的增刊内容也上了期刊网，这样的更具有迷惑性，所以作者在发表文章前，一定要弄清楚是不是增刊。
正刊应该就是正常周期计划出版的刊物，增刊是用于纪念特殊的节日、事件、或者做特殊专题而增加发行的刊物，增刊大多是搭配在原来的正刊上发行的。也并不是因为容易发行才叫增刊的。
正规的期刊都是在新闻出版总署查询的到得，而增刊和专刊你要做好准备，评职称的话可能不认可。
级别指的是刊物级别，核心期刊里又有双核心、核心；有的地方也分为核心a、b、c，a类层次最高；期刊级别一般有分为省级内部资料、公开发行的有国家统一刊号的普通刊物、省级期刊、核心期刊等类
个人感觉还是期刊论文更有价值，当然是总的而言。
您这个问题比较笼统，不同硕士或者不同期刊论文，其创新、分量和含金量有天壤之别硕士得看什么学校、什么学科的硕士；如果该专业有国家一级重点学科，这种学校的硕士论文一般还是不错的；期刊也得看什么样的期刊，分省级、国家级、还有像SCI、CELL等这类国际顶级期刊最好把您的问题具体化，这样大家才能比较准备的回答您的提问
发表论文最好的期刊就是核心期刊c刊，然后这些刊物是比较有代表性，而且有权威性的
IEEE会议属于EI检索。除了计算机的顶级会议，会议和杂志有天壤之别，一般期刊EI就比大部分IEEE会议论文级别高。当然，一个的目的是交流，另一个是发表，
补充一句，国外会议检索，也算是一类的。
两个的用处都是不相同的，还有作用都是不相同的
I是科学引文索引，主要收录的是国际上理科方向的文章。EI也是偏向于理科方向，但它收录的是会议论文。国际上还有一个SSCI，这个是偏向于文科的检索系统，之后被引入到中国就成了CSSCI，即南大核心期刊。关于难度：都比较难，因为SCI、EI和CSSCI 的收录方向不同，所以比较难度不具有科学性。反正，都很难。关于认可度：SCI、EI是国际期刊，CSSCI是国内期刊，自然SCI和EI的认可度比较高，如果一篇文章能够被SCI和EI 双检索的话，就更好了。关于加分：很多人发文章是为了加分评职，根据我多年的经验来看，SCI加分最多，有的单位EI和SCI是平级加分，有的单位EI加分稍低，CSSCI的加分都低于国际期刊。
国外影响力比较大的期刊主要包括：SCI、EI和ISTP，俗称国际三大检索。国内方面：CSCD、中文核心期刊目录、CSSCI。
SCI(科学引文索引)Science Citation Index, SCI是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库，其覆盖生命科学、临床医学、物理化学、农业、生物、兽医学、工程技术等方面的综合性检索刊物，尤其能反映自然科学研究的学术水平，是目前国际上三大检索系统中最著名的一种，收录范围是当年国际上的重要期刊,尤其是它的引文索引表现出独特的科学参考价值，在学术界占有重要地位。许多国家和地区均以被SCI收录及引证的论文情况来作为评价学术水平的一个重要指标。EI(工程索引)The Engineering Index，简称EI创刊于1884年，是美国工程信息公司(Engineering information I)出版的著名工程技术类综合性检索工具。EI每月出版1期，文摘3万至4万条；每期附有主题索引与作者索引；每年还另外出版年卷本和年度索引，年度索引还增加了作者单位索引。出版形式有印刷版（期刊形式）、电子版（磁带）及缩微胶片。EI选用世界上工程技术类几十个国家和地区15个语种的3500余种期刊和1000余种会议录、科技报告、标准、图书等出版物。年报道文献量16万余条。收录文献几乎涉及工程技术各个领域。具有综合性强、资料来源广、地理覆盖面广、报道量大、报道质量高、权威性强等特点。ISTP(科技会议录索引)Index to Scientific & Technical Proceedings，简称ISTP。创刊于1978年。该索引收录生命科学、物理与化学科学、农业、生物和环境科学、工程技术和应用科学等学科的会议文献，包括一般性会议、座谈会、研究会、讨论会、发表会等。其中工程技术与应用科学类文献约占35%，其他涉及学科基本与SCI相同。ISR（科学评论索引）Index to Scientific Reviews 简称ISR。创刊于1974年，收录世界各国2700余种科技期刊及300余种专著丛刊中有价值的评述论文。高质量的评述文章能够提供本学科或某个领域的研究发展概况、研究热点、主攻方向等重要信息，是极为珍贵的参考资料。CSSCI(中文社会科学引文索引)Chinese Social Science Citation Information英文名称首字母缩写，是由南京大学研制成功的、我国人文社会科学评价领域的标志性工程。科学引文索引是从文献之间相互引证的关系上，揭示科学文献之间的内在联系。通过科学引文索引数据库的检索与查询，可以揭示已知理论和知识的应用、提高、发展和修正的过程，从一个重要侧面揭示学科研究与发展的基本走向；通过科学引文索引数据库的统计与分析，可以从定量的视角评价地区、机构、学科以及学者的科学研究水平，为人文社会科学事业发展与研究提供第一手资料。CSSCI俗称“南大版核心期刊”。中文核心期刊要目总览由北京大学图书馆与北京高校图书馆期刊工作研究会联合编辑出版的《中文核心期刊要目总览》（以下简称《要目总览》）。《要目总览》不定期出版， 1996 年出版了第二版， 2000 年出了 2000 版，2008年又推出了最新的版本。《要目总览》收编包括社会科学和自然科学等各种学科类别的中文期刊。其中对核心期刊的认定通过五项指标综合评估。中文核心期刊要目总览，就是通常所说的中文核心期刊，俗称“北大版核心期刊”。CSCI（中国科学文献数据库）是国家科学数字图书馆资助的项目，建设目标是建立中文科技期刊的基于web的科技文献文摘、引文、联合目录馆藏的科技知识服务体系，面向广大机构和个人用户提供中文科技期刊文献资源的有效发现和评价服务。结合对全文数据库的开放链接，建立基于核心科技期刊的知识发现、评价和推介服务体系。ASPT (中国科学文献计量评价数据库)ASPT是中国科学院文献情报中心（A）、中国社会科学院文献信息中心（S）、北京大学图书馆（P），中国学术（光盘版）电子杂志社（T）共同建设的《中国科学文献计量评价数据库》。CJFD（中国期刊全文数据库）(Chinese Journal Full—text Database)的英文缩写属教育部主管，清华大学主办，中国学术期刊(光盘版)电子杂志社创办的我国第一个学术期刊全文检索与评价数据库，是我国知识信息生产、传播、应用和期刊评价、管理的现代化运作平台，以光盘和网络等形式向国内外读者提供动态知识服务，并为中国科学文献计量评价研究中心进行期刊评价提供基础数据，为新闻出版总署等有关期刊管理部门提供期刊管理数据。如刊物被这些数据库收录，在一定程度上说明这些期刊的权威性。CJCR（中国科技期刊引证报告）CJCR是按照美国JCR的模式，结合中国的具体情况，以中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）为基础，选择数学、物理学、力学、化学、医药卫生、工业技术、电子与通信、计算技术、交通运输、航空航天、环境科学等学科的1000多种中国出版的中英文科技期刊作为来源期刊，根据来源期刊的引文数据，进行规范化处理，计算了总被引频次、影响因子、即年指标、被引半衰期、论文地区分布数、基金论文数和自引总引比等十余项科技期刊评价指标，并按照期刊的所属学科、影响因子、总被引频次和期刊字顺分别进行排序。CMCC（中文生物医学期刊文献数据库）是解放军医学图书馆创建的中文医学期刊文献的数据库，是面向医院、院校、科研、图书情报、医药卫生和医药出版等单位的文献摘要数据库。它收录文献量大，专业性强，信息新，查询途径广，更新及时，系统功能比较完备，用户界面友好，使用方便，是检索最新医学文献的重要工具，几乎收录了国内生物医学领域的全部核心期刊、重要刊物以及与生物医学相关的一些自然科学期刊，内容涵盖了生物医学的各个领域及其边缘学科的相关领域。CMCC 是目前我国同类产品中提供信息量最多、传递速度最快的中文医学文献数据库。CASS(中国人文社会科学核心期刊要览)是中国社会科学院文献信息中心在多年的期刊研究基础上完成的一项科研成果。它采用我国目前年度收文量最大的引文数据库和其他大型文献数据库作为统计数据源，运用文献计量学的理论和方法进行综合统计分析，邀请各学科权威专家进行评审，力求客观地反映期刊的“学术影响力”。该书评出哲学、政治、法律、经济、文学、历史等重要学科领域中的344种核心期刊，涵盖了目前我国人2社会科学期刊中使用率和学术水平均居前列的权威期刊和优秀期刊。CASS也有人称之为“社科院版核心期刊”。中国科技期刊引证报告（统计源期刊）是按照美国科学情报研究所（ISI）《期刊引证报告》的模式，结合中国期刊发展的实际情况，确定了在中国出版（不含港、澳、台）的1576种（2004年版）科技期刊列为《中国科技论文统计源期刊》，学科范畴主要为自然科学领域，是目前国内比较公认的科技统计源期刊目录。因其受科技部委托，带有官方色彩，具有很高的学术权威性，人们习惯称其为“统计源期刊”，又称为“中国科技核心期刊”。CSTPCD（中国科技论文与引文数据库）中国科技信息研究所（ISTIC）是受国家科技部委托，从1987年开始对我国科技人员在国内外表论文数量和被引用情况进行统计分析，并利用统计数据建立了中国科技论文与引文数据库（CSTPCD），受到社会各界的普遍重视和广泛好评。中国科技论文统计源期刊是CSTPCD的数据来源。通过中国科技期刊综合指标评价体系对期刊学术质量的考核，CSTPCD每年对收录期刊的范围进行调整。CSCD（中国科学引文数据库）收入我国数学、物理、化学、生物学、医药卫生、工程技术、环境科学和管理科学等领域出版的中英文科技核心期刊和优秀期刊近千种，其中核心库来源期刊670种，扩展库期刊为 378 种核心库的来源期刊经过严格的评选,是各学科领域中具有权威性和代表性的核心期刊。扩展库的来源期刊也经过大范围的遴选，是我国各学科领域较优秀的期刊。具有建库历史最为悠久、专业性强、数据准确规范等特点，被誉为“中国的SCI ”。CAJCED（中国学术期刊综合评价数据库）是国家级火炬计划项目，是以《中国学术期刊（光盘版）》和中国期刊网专题全文数据库的评价数据为基础而建立起来的大型数据库。是《中国核心期刊要目总览》数据源统计的分析工具、《中国科学引文数据库》和《中国人文社科引文数据库》来源期刊的重要依据。该数据库为各期刊管理部门进行期刊管理、评比及期刊的其它定量分析研究提供依据和统计分析结果。在《中国学术期刊综合评价数据库》来源期刊及其统计分析的基础上结合《中文核心期刊要目总览》，由评价中心《中国人文社会科学引文数据库》专家遴选900多种社科类优秀期刊作为来源期刊。 中国期刊方阵“双高”“双奖”“双百”“双效”期刊 “中国期刊方阵”的基本框架分为4个层面，形成宝塔形结构。第一个层面为“双效”期刊。以全国现有近万种期刊为基数选取社会效益、经济效益好的1000余种期刊，作为“中国期刊方阵”的基础。第二个层面为“双百”期刊。即通过每两年一届评比产生的百种重点社科期刊、百种重点科技期刊。每届进入全国“双百”重点期刊数量控制在200种左右。 第三个层面为“双奖”期刊。是全国“双百”重点期刊基础上评选出的国家期刊奖、国家期刊奖提名奖的期刊。此类期刊约100种左右。即高知名度、高学术水平的期刊。此类期刊约50种左右。“双奖”和“双百”期刊通过评选产生，“双高”期刊由新闻出版总署、科技部确定。国家级期刊“国家级” 期刊 ，即由党中央、国务院及所属各部门，或中国科学院、中国社会科学院、各民主党派和全国性人民团体主办的期刊及国家一级专业学会主办的会刊。另外，刊物上明确标有“全国性期刊”、“核心期刊 ”字样的刊物也可视为国家级刊物。省级期刊由各省、自治区、直辖市及其所属部、委办、厅、局主办的期刊为省级期刊，由各本、专科院校主办的学报（刊）也被视为省级期刊。增刊根据新闻出版总署规定，每本合法期刊，一年可以出版两期增刊。增刊的主管单位、主办单位和刊号都是与正常周期出版的刊物完全一致的，不能称之为非法或违规出版物。大众期刊的增刊一般用来出版专辑、合集或纪念特刊。学术期刊通常把一些具有相当水准，但又无法在正常周期的刊物上发表的文稿安排在增刊上，因此增刊的学术影响力较正常周期出版的刊物为弱。在评定中级以下职称时，省级期刊的增刊大多不被承认。但国家级期刊或核心期刊的增刊往往会被降级使用，相当于省级期刊或普通学术期刊。
眼下，随着我国学术的发展，以及个人职业晋升要求的不断提高，发表国际学术论文的要求越来越常见，但发表国际学术论文对国内很多普通作者来说似乎有些难，很多人对国际学术论文的类别都不是很清楚，有作者问到SCI 、SSCI、CSCD、CSSCI、EI、ISTP分别是什么?可以说这几类都是目前认可度很高的学术检索工具，有国内的，也有国外的，SCI 、SSCI、EI、ISTP是国际通用的检索工具，CSCD、CSSCI属于国内核心期刊中的两大类，也是国内非常权威的学术检索工具。SCI科学引文索引，是由美国科学资讯研究所于1960年上线投入使用的一部期刊文献检索工具，也是最著名的检索性刊物之一，所收录期刊的内容主要涉及数、理、化、农、林、医、生物等基础科学研究领域，选用刊物来源于40多个国家。SSCI社会科学引文索引，SCI的姊妹篇，最大的不同之处在于SCI偏理科，SSCI则偏文科，侧重人文社科领域。CSCD中国科学引文数据库，在科研单位和高校的课题研究、人才选拔中有广泛应用与认可度，CSCD主要是理工科方向的，适合理工科的专业人员发表。CSSCI南大核心期刊，以北大核心期刊并驾齐驱，可以说是国内核心期刊体系中学术价值最高的核心期刊，发表难度在国内核心期刊中也是最大的，很多对作者的学历职务都有较高的要求。EI工程索引，由美国工程师学会联合会研发，主要检索的类型有工程类期刊、会议论文和技术报告，EI是很多国内作者发表会议论文的首选，专业侧重工程技术领域。ISTP国内很多作者对ISTP还是比较陌生的，ISTP是科技会议录索引，由美国科学情报研究所研发，主要检索的就是学术会议和会议文献，包括一般性会议、座谈会、研究会、讨论会、发表会等，近些年ISTP在国内的应用逐渐广泛，认可度也随之升高。以上就是对这几种检索工具的简单介绍，这几类检索工具无论是在个人晋升还是在毕业升学中认可度都是非常高的，当然，发表难度也都是比较大的，毕竟不是核心期刊就是国际学术期刊或者国际学术会议，具体哪一种适合自己发表，作者需要做个认真的考量，重点关注单位和学校的具体要求。