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外套array 2x2[] & = \phi[] \\ & +[]
写在$$$$中间，也就是$$公式$$会自动居中 公式后面有标点符号的话，标点符号也写在那中间。
使用宏包multicol。具体使用方法参考宏包说明：Shift+Ctrl+F1。（如果使用的是WinEdt)
一般都是在=号附近对齐的，如果公式太长，就把公式中间断开换行
可以使用 align* 环境：在每一行开始都用对齐符 "&" 保证左对齐。为了实现自定义编号，先用星号环境取消自动编号，然后再用 amsmath 宏包中的 \tag 命令设置自动编号。 \usepackage{amsmath}%导言区 \begin{align*} &a_1 x + b_1 y + c_1 z = d_1\tag{$11$}\\ &a_2 x + b_2 y + c_2 z = d_2\tag{$12$}\\ &a_3 x + b_3 y + c_3 z = d_3\tag{$13$} \end{align*} 效果：
你最好是找一个全的美赛的latex模板，就不用你自己再重写控制页和摘要的代码了。这个模板本站就有，你可以自己下载。
你对公式要求还真高，indesign 公式插件不是可以改字体么～复杂的符号就不要动了，字符改一下，谁说想要修改就要重新做？点公式右键不是有“修改公式”(Edit Equation)的选项么，点开就打开了 mathmagic 修改过后点“更新”就行了。再有高要求就用专业的 LaTeX，这个可不容易。
公式桥 for indesign,淘宝上有，搜搜吧，建议去买个，比较便宜，而且功能强大。