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JCR 是基于SCIE的分析型数据库（其SS版本，对应SSCI数据库)，是年度的，一年出一次。所以，从这个意义上，JCR的期刊和SCIE的期刊就没法一一 对应。另，由于计算JCR的数据需要一种期刊的历史数据（这自然需要一定时间段)，所以新被收录的期刊一般没有影响因子。这个时间段多长呢？其实不是从收 录时间算的，是从收录的期刊的起始卷期开始算的。例子：A刊和B刊均2008年被收录，但是A刊收录文章从2007年的第1期，B刊收录文章是从2008 年的第1期，这样JCR2009（2010年6月19日发布)就有了A刊的影响因子，但是没有B刊的（因为计算B刊2009年影响因子需要其2007年的 数字)。由于相关数值时按照年度计算的，所以从收录时间看，有的会达3-4年才有影响因子。比如2008年4月开始收录C刊，从2008年第2期（假定是 季刊)开始收录，这样要到2012年6月公布影响因子2011时才会出现C刊的影响因子。这个时间是4年多了。这是SCIE期刊比JCR多的主要原因。还 有一个原因就是自引，前面有博文提到，此处不再介绍。通常，JCR的期刊均是SCIE收录的，但一类期刊例外，就是有些期刊被剔除了，但 JCR统计数据完整，所以依然可以看到。
Journal Citation ReportsJCR对包括SCI收录的3800种核心期刊(光盘版)在内的8000多种期刊(网络版)之间的引用和被引用数据进行统计、运算，并针对每种期刊定义了影响因子（Impact Factor）等指数加以报道。一种期刊的影响因子，指的是该刊前二年发表的文献在当前年的平均被引用次数。一种刊物的影响因子越高，也即其刊载的文献被引用率越高，一方面说明这些文献报道的研究成果影响力大，另一方面也反映该刊物的学术水平高。因此，JCR以其大量的期刊统计数据及计算的影响因子等指数，而成为一种期刊评价工具。图书馆可根据JCR提供的数据制定期刊引进政策；论文作者可根据期刊的影响因子排名决定投稿方向。
JCR 是基于SCIE的分析型数据库（其SS版本，对应SSCI数据库)，是年度的，一年出一次。所以，从这个意义上，JCR的期刊和SCIE的期刊就没法一一 对应。另，由于计算JCR的数据需要一种期刊的历史数据（这自然需要一定时间段)，所以新被收录的期刊一般没有影响因子。这个时间段多长呢？其实不是从收 录时间算的，是从收录的期刊的起始卷期开始算的。例子：A刊和B刊均2008年被收录，但是A刊收录文章从2007年的第1期，B刊收录文章是从2008 年的第1期，这样JCR2009（2010年6月19日发布)就有了A刊的影响因子，但是没有B刊的（因为计算B刊2009年影响因子需要其2007年的 数字)。由于相关数值时按照年度计算的，所以从收录时间看，有的会达3-4年才有影响因子。比如2008年4月开始收录C刊，从2008年第2期（假定是 季刊)开始收录，这样要到2012年6月公布影响因子2011时才会出现C刊的影响因子。这个时间是4年多了。这是SCIE期刊比JCR多的主要原因。还 有一个原因就是自引，前面有博文提到，此处不再介绍。通常，JCR的期刊均是SCIE收录的，但一类期刊例外，就是有些期刊被剔除了，但 JCR统计数据完整，所以依然可以看到。
JCR：ISI每年出版JCR(《期刊引用报告》，全称JournalCitationReports)。JCR对包括SCI收录的3800种核心期刊(光盘版)在内的8000多种期刊(网络版)之间的引用和被引用数据进行统计、运算，并针对每种期刊定义了影响因子(ImpactFactor)等指数加以报道。SCI：SCI是美国《科学引文索引》的英文简称，其全称为：ScienceCitatioSCInIndex,SCI涵盖很多分类，医学[2]，生物，自然科学，物理，化学，金融，艺术等等，相当于是人类文明的图书馆，具有非常重要的历史意义和科研价值。SCIE:在SCIE中的所谓的外围刊其实只是一个相对的概念，这些期刊也是ISI从全世界学术期刊中精选出来,这些期刊也是ISI从全世界学术期刊中精选出来。因SCI的WEB版1997年才推出，在此之前国内各文献单位所订购的多为SCI的印刷版或光盘版，所以自然形成了以这两种版本所收录的3000余种期刊为基础的学术统计和评价体系，当SCI的WEB版出现后也就自然出现了核心刊和外围刊的区分。
目前SCI核心库加上扩展库（网络版）有6000余种期刊，SCI库的期刊质量和影响力存在很大的差距，尤其是不同学科之间的SCI期刊，很难进行比较和评价。为了更科学地对学术期刊进行评价，对科研人员的工作业绩进行合理考核，中国科学院文献情报中心将JCR（《期刊引用报告》）公布的6000余种期刊分为13大类，在每一类期刊中根据期刊的影响因子及被引频率等指标分成四个区，期刊档次由高到低排列，其中第一区期刊加上第二区少量期刊，被界定为顶级刊物。
虽然是两个概念，但是还是有一定联系的，中科院的分区参考了JCR的分区标准(都是基于索引数据)，但是中科院的分区比JCR的分区更严格一些。以下可能对你有所帮助：汤森路透JCR分区法：1、各学科分类中影响因子前25%(含25%)期刊划分为1区2、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前25 -50% (含50%)为2区3、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前50-75% (含75% )为3区4、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的后75%为4区中国科学院SCI分区法：中国科学院文献情报中心根据每年的JCR数据，将学科分为14个大类和174个小类。每个学科分类按照期刊的影响因子高低，分为4四个区：1、各学科分类中影响因子前5%(含5%)期刊划分为1区2、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前5-20% (含20%)为2区3、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的前20-50% (含50% )为3区4、各学科分类中影响因子位于学科中总刊数的后50%为4区
不一样的：中科院是中国中科院制定的，JCR是英加合资跨国集团Thomson Reuters 公司制定的分区（汤森路透分区）；两个分区制作者都有点弱智，汤森路透它平均切成四块，每块25%；中科院自以为聪明，一区：前5%；二区：6%~20%；三区：21%~50%；四区：51%~100%。其实这俩都不太科学。你们上学评优，有没有遇到过25%得优，或者5%得优；还有中科院居然把一半归为四区差不多下等了，大家想想就知道这两个都不合理对不对？比较正常的，10%优等一区；20%上等二区；30%中等三区；剩余40%四区可归到不太上手的那部分；其实中等在现实中占大多数，所以还可以在30%基础上再加一点而四区的40%可以减少一点都没问题。其他信息网上都有，我就不废话了，大家觉得我的建议合理的话左下角支持一下，谢谢！
中科院sci分区和JCR分区区别为：依据不同、划分不同、归类不同。一、依据不同1、sci分区：sci分区是按期刊的三年版的平均影响因子来划分的。2、JCR分区：JCR分区是把某一个学科的所有期刊的上一年的影百响因子按降序排列，然后进行等分。二、划分不同1、sci分区：sci分区分为四个区度，每个区所占的比例是不相等的，一区：前5%；二区：6%~20%；三区：21%~50%；四区：51%~100%。2、JCR分区：JCR分区分为四个区度，每个区所占的比例是相等的，前25%(含25%)划分为1区，前25 -50% (含50%)为2区，前50-75% (含75% )为3区，75%~100%为4区。三、归类不同1、sci分区：sci分区基于JCR分区，将176个小类专业合并为了医学、生物学等14个学科。2、JCR分区：JCR分区按照小类的专业将学科归类174个小类。
都说我们专业的一区就两个期刊，如果按JCR分区来计算，那我们专业就8个期刊被SCI检索，可是JCR显示我们这个方向有50多个，所以影响因子位于前四分之一的期刊应该有10多个，各种不解。JCR分区应该是JCR数据库按影响因子自然划分的四个区；SCI分区应该是中科院搞的吧