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因为JCR是Q4均分法，也就是按照25%一栏的分区方式。而中科院分区不一样，他采用的是大类套小类的分区方式，先分大区，然后再看小区，突出一个顶端优势。每个大类前5%的期刊设定为一区期刊，同时为了增加TOP期刊的容量，一区期刊都是TOP。而二区期刊不仅仅要看影响因子，还要看引用频次，在小区内的影响力，所以即便影响因子高，也未必是TOP（引用频较高的前10%的期刊，会被列为TOP）。附上中科院期刊分类说明：_shtml
无论是哪一类分区，sci期刊都是划分为四个区，都是按照影响因子高低进行的划分，影响因子由一区至四区递减，一区最高，四区最低，所以，sci期刊中一区期刊学术价值和影响力是最大的，四区期刊在sci期刊中就是综合实力最弱的期刊。 对于作者来说，期刊分区越高，期刊的发表难度越大，一区期刊必然比四区期刊难以发表，一般普通作者很难发表一区期刊，能发表二区期刊对于国内作者来说就已经实属不易了，三区四区相对容易一些，但也只是相对于一区二区期刊，即便是四区期刊，也比国内核心期刊的发表难度高出不少。
无论是哪一类分区，sci期刊都是划分为四个区，都是按照影响因子高低进行的划分，影响因子由一区至四区递减，一区最高，四区最低，所以，sci期刊中一区期刊学术价值和影响力是最大的，四区期刊在sci期刊中就是综合实力最弱的期刊。 对于作者来说，期刊分区越高，期刊的发表难度越大，一区期刊必然比四区期刊难以发表，一般普通作者很难发表一区期刊，能发表二区期刊对于国内作者来说就已经实属不易了，三区四区相对容易一些，但也只是相对于一区二区期刊，即便是四区期刊，也比国内核心期刊的发表难度高出不少。
一区二区三区指的是地区，分别如下：一区包括北京、天津、河北、山西、辽宁、吉林、黑龙江、上海、江苏、浙江、安徽、福建、江西、山东、河南、湖北、湖南、广东、重庆、四川、陕西等21省（市）。二区包括内蒙古、广西、海南、贵州、云南、西藏、甘肃、青海、宁夏、新疆等10省（区）。分区是将全国各省、直辖市根据地理位置、交通便利程度等划分的几个区域，一区最便利，资费相应最低；三区最边远，资费相应最高；二区介于中间。sci期刊的分区：一区二区三区四区是sci期刊的分区，sci期刊的分区有两种，一种是jcr的分区，另一个是中科院的分区，这两类分区很类似，都是分为四个区，分区的标准也都是期刊的影响因子，至于不同区的期刊的区别，很显然的区别就是这四个区是按照影响因子由高到低排序的。一区期刊是影响因子最高，学术价值最高，影响力最大的期刊，四区期刊就是四个区中影响因子最低的一类刊物。
中科院一区和JCR一区的最显著区别就是分区标准不同。SCI分区的主要标准是期刊的影响因子，两种分区的标准都是主要依据刊物的影响因子来划分的，不同之处在于分区的标准不同，JCR一区为影响因子前25%的期刊，中科院分区则是前5%为一区，从这个标准来看，中科院分区对期刊的划分标准更高一些。除了影响因子标准范围的不同，中科院分区是基于各专业期刊三年平均IF排名，而JCR分区是基于各个专业刊物当年的IF排名，再就是中科院是将刊物按照梯度划分，JCR分区则是平均划分，这是同一分区按照两类划分标准，所划分出的刊物有很大差别的主要原因，假设有100本期刊，按JCR分区法有25本是一区，按中科院分区法只有5本是一区。
请查看《 JCR 期刊影响因子及分区情况》，由中国科学院文献情报中心提供。按照该期刊的影响因子，投稿难度和影响力，分为1～4区：一区一般是各领域的top期刊，二区是高水平期刊，三区次之，四区则更普通～～
无论是哪一类分区，sci期刊都是划分为四个区，都是按照影响因子高低进行的划分，影响因子由一区至四区递减，一区最高，四区最低，所以，sci期刊中一区期刊学术价值和影响力是最大的，四区期刊在sci期刊中就是综合实力最弱的期刊。 对于作者来说，期刊分区越高，期刊的发表难度越大，一区期刊必然比四区期刊难以发表，一般普通作者很难发表一区期刊，能发表二区期刊对于国内作者来说就已经实属不易了，三区四区相对容易一些，但也只是相对于一区二区期刊，即便是四区期刊，也比国内核心期刊的发表难度高出不少。