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论文目录主要就是论文的主要内容，还有一些重点知识！
应涉及的。还有引言
论文目录主要就是论文的主要内容，还有一些重点知识！
知网、万方、维普、paperpp这类主流的查重系统都会检测摘要目录和致谢部分的，如果你们学校对检测内容没有做要求，建议还是放进去一起检测吧，这样得出来的重复率才是最准确的。
论文查重的内容主要包括了论文的正文原创说明，摘要，图标以及公式说明，参考文献附录实验研究成果以及各种表格等
毕业论文查重的基本流程是什么？论文查重是一项系统性很强的工作，涉及到各个管理环节，要顺利通过分析检验，就必须做好学生的准备，了解国内的具体应对策略和操作
如果学校没有明确规定论文检测部分，建议摘要也一起提交检测。因为从各大系统来看，摘要都是参与查重的，也可以检测到，参与重复率的计算中，如果少了摘要，结果会有差别。
顺序为：作者、文章名、出自哪个刊物、刊物的年、卷、期、页码。
1．参考文献著录项目（1）著作：[序号] 主要责任者．著作名[M]．其他责任者．版本项．出版地：出版者，出版年：引文页码． （2）连续出版物：[序号]主要责任者．题名[J]．年，卷（期）-年，卷（期）．出版地：出版者，出版年．（3）连续出版物中的析出文献：[序号] 析出文献主要责任者．析出文献题名[J]．连续出版物题名：其他题名信息，年，卷（期）：页码．（4）专著中的析出文献：[序号] 析出文献主要责任者．析出文献题名[C]．析出文献其他责任者//专著主要责任者．专著题名．版本项．出版地：出版者，出版年：析出文献的页码．（5）电子文献：[序号] 主要责任者．题名[文献类型标志/文献载体类型标志]．出版地：出版者，出版年（更新或修改日期）[引用日期]获取或访问路径．2．参考文献类型及其标志（1）以单字母方式标志以下各种参考文献类型：参考文献类型 普通图书 会议论文 报纸文章 期刊文章 学位论文 报告 标准 专利 汇编 档案 古籍 参考工具文献类型标志 M C N J D R S P G B O K（2）对于其他未说明的文献类型，建议采用单字母“Z”。（3）对于数据库（Database）、计算机程序（Computer Program）及电子公告（Electronic Bulletin Board）等电子文献类型的参考文献，建议以下列双字母作为标志：电子文献类型 数据库 计算机程序 电子公告电子文献类型标志 DB CP EB（4）电子文献的载体类型及其标志对于非纸张型载体的电子文献，当被引用为参考文献时需在参考文献类型标志中同时标明其载体类型。建议采用双字母表示电子文献载体类型：电子文献载体类型 磁带 磁盘 光盘 联机网络电子文献载体类型标志 MT DK CD OL载体类型标志含义 Magnetic Tape Disk CD-ROM Online并以下列格式表示包括了文献载体类型的参考文献类型标志：[文献类型标志/载体类型标志]如：[DB/OL] 联机网上数据库（Database Online）；[DB/MT] 磁带数据库（Database on Magnetic Tape）；[M/CD] 光盘图书（Monograph on CD-ROM）；[CP/DK] 磁盘软件（Computer Program on Disk）；[J/OL] 网上期刊（Serial Online）；[EB/OL] 网上电子公告（Electronic Bulletin Board Online）。以纸张为载体的传统文献在引作参考文献时不必注明其载体类型。
这个其实每个期刊要求是不一样的，你应该去看看你所投期刊的官方模板论文格式，里面参考文献各个类型的都有说明，不建议你到处去找所谓的标准格式，因为没有所谓的标准格式，虽然国家对学术论文参考文献格式做了规范，但是每个期刊其实也会自己增加一些规则，还是以你所投期刊为准，如果你期刊并没有提供参考文献格式，你也可以百度搜下：普刊学术中心，有很多参考文献格式模板，还有一些学习资料。
文内所列参考文献应限于作者直接阅读过的、最主要的、且为发表在正式出版物上的文章 私人通信和未发表 （含待发表） 的著作及论文，一般不宜作为参考文献 参考文献还应注重权威性和时效性 文内标注参考文献时应按文献出现的先后顺序用阿拉伯数字连续编码，并将序号置于方括号中 可根据具体情况分别按下述3种格式之一标注 （1） 文中已标明原始文献作者姓名时，序号标注于作者姓名右上角 例如：Vairaktaris等[7]研究表明，MMP-9-1562C/T基因多态性与口腔癌关系密切 （2） 正文未标明作者或非原始文献作者时，序号标注于引用内容的句末 例如：……在中枢神经系统中具有保护神经的作用，减少缺氧、缺血对动物脑神经元的损害[1] （3） 正文直接述及文献序号时则将之作为语句的组成部分时不用角码标注 例如：肱动脉超声检查的方法见文献[2] 文中多次引用同一参考文献，只在第一次出现时编排序号 （在参考文献表中也只出现一次） , 其他处使用同一序号；如果多次引用的是同一参考文献的不同页的内容，则应参考文献表中按引用顺序一一列出页码 若某一问题使用了多篇文献说明，这时将各文献的序号在一个方括号内全部列出，中间加逗号，若遇连续序号，则在起止序号中间加“-”表示 如：……组织型RAS激活也成为心肌肥厚、心肌纤维化、心腔扩大、心力衰竭的主要因素[1,3,9-10] （内容来源：学术堂）
1、论文内容主要包括：封面、声明、中英文摘要、目录、主要符号对照表、正文、致谢、参考文献、附录、原创性声明或者授权声明以及学习期间发表的学术论文等部分组成。其中正文部分，通常是由引文、摘要、各部分章节、总结等部分组成，正文部分是主要查重的部分，是最为重要的，然后论文致谢、关键词、附录和致谢部分一般也都需要查重。2、论文查重查的内容大致如上所示，而进行论文查重的直接目的就是为了检测出论文的重复率，从论文重复率是能够判定出论文中存在的学术不端行为严重程度的。论文重复率越高，就说明学术不端行为越严重，各个高校都会规定毕业生论文重复率的合格标准，学历越高，其合格标准越严格。3、论文查重还会查论文的字数、格式和参考文献等。毕业论文是有最低字数要求的，依各自学校具体规定为准，本科论文一般最低八千字数，硕士论文一般最低三万字数，博士论文普遍都要十几万字数。格式和参考文献也是论文查重检测的重要部分，格式和参考文献不规范的话就会对论文查重结果造成不良影响。
本文的摘要部分是主体部分之一，字数虽不多，但也十分重要，因此这部分内容将进行查重检测。而且概要部分是论文的主体部分，所以是要提交的，大家可以在提交之前删除掉。本文正文部分的查重检测非常重要，主要是因为论文正文部分是主体，在撰写论文的过程中要特别注意正文部分，而且导师也会帮助我们选择一些合适的论点和方向，所以正文部分只要不出现大段的重复，一般都不用担心这一点。很多人都不知道本科论文的查重是查哪一部分，以为参考文献就是不会查重的。但是大家要注意参考文献，如果有错误的地方也要去查重。本文中的查重软件对不同部分的查重方式有一定的选择，因此要保证论文格式的正确性，否则后续的论文查重工作将受到影响。每一份报告可能都有一个小的结论，即论文综述。这个词的字数并不多，但是如果你了解一下本科论文的查重部分是什么，你就会发现，论文的结语部分是要进行查重检测的，而且是很容易出现标红的。由于许多人在本部分中的内容将直接使用模板，因此，此类话很容易产生问题。要想更好地了解本科论文的查重情况，就需要对其查重内容进行调整。由于许多论文格式修改调整后，论文查重软件会直接跳过这部分不进行查重检测的内容，因此，更多还是要确定论文的具体情况，以及学校对论文格式的要求，这样才能避免论文查重重复率过高的情况。来源：papertime论文查重官网
提交查重的部分一般都会进行查重的，摘要，正文，结论，例如知网，在论文格式正确的情况下，会自动将声明、目录、参考文献自动剔除在外的。
感谢能够回答你的问题。论文查重的话主要查的是除了目录、参考文献和致谢以外，其他都查！