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财税〔2016〕36号文件附件1：第十条 销售服务、无形资产或者不动产，是指有偿提供服务、有偿转让无形资产或者不动产。第十一条有偿，是指取得货币、货物或者其他经济利益。也就是说，对将无形资产投资入股换取股权行为属于有偿转让无形资产或者不动产，按有偿销售不动产、无形资产行为征收增值税。按照服务业收，一般5%
专利使用费增值税税率为6%，应扣缴税额等于接受方支付的价款除以(1+税率)乘以税率。【法律依据】《中华人民共和国专利法》第二十六条申请发明或者实用新型专利的，应当提交请求书、说明书及其摘要和权利要求书等文件。请求书应当写明发明或者实用新型的名称，发明人的姓名，申请人姓名或者名称、地址，以及其他事项。说明书应当对发明或者实用新型作出清楚、完整的说明，以所属技术领域的技术人员能够实现为准；必要的时候，应当有附图。摘要应当简要说明发明或者实用新型的技术要点。权利要求书应当以说明书为依据，清楚、简要地限定要求专利保护的范围。依赖遗传资源完成的发明创造，申请人应当在专利申请文件中说明该遗传资源的直接来源和原始来源；申请人无法说明原始来源的，应当陈述理由。
开票内容一般会参照该公司营业执照上的经营范围，商标的就开商标代理费用，专利的就开专利代理费，税率主要看你开什么票，普通的是3个点；增值税的，看公司规模，一般的商标代理公司都是小规模的，只能开3个点的税票。
转让专利权交增值税，专利属于无形资产，转让人销售无形资产，是应税的销售行为，应纳税额为当期销项税额抵扣当期进项税额后的余额，销项税额是销售额×增值税税率。【法律依据】《中华人民共和国增值税暂行条例》第三条纳税人兼营不同税率的项目，应当分别核算不同税率项目的销售额；未分别核算销售额的，从高适用税率。第四条除本条例第十一条规定外，纳税人销售货物、劳务、服务、无形资产、不动产（以下统称应税销售行为），应纳税额为当期销项税额抵扣当期进项税额后的余额。应纳税额计算公式：应纳税额=当期销项税额－当期进项税额。当期销项税额小于当期进项税额不足抵扣时，其不足部分可以结转下期继续抵扣。第五条纳税人发生应税销售行为，按照销售额和本条例第二条规定的税率计算收取的增值税额，为销项税额。销项税额计算公式：销项税额=销售额×税率。
专利技术转让一般是要交增值税的。但满足以下条件的专利技术转让可以免缴增值税：1、技术内容与技术转让密切相关，是为技术转让而实施的售后服务；2、技术咨询或服务的价款与技术转让的价款是开在同一张发票上。【法律依据】《中华人民共和国增值税暂行条例》第一条在中华人民共和国境内销售货物或者加工、修理修配劳务（以下简称劳务），销售服务、无形资产、不动产以及进口货物的单位和个人，为增值税的纳税人，应当依照本条例缴纳增值税。第十八条中华人民共和国境外的单位或者个人在境内销售劳务，在境内未设有经营机构的，以其境内代理人为扣缴义务人；在境内没有代理人的，以购买方为扣缴义务人。
专利技术转让需要增值税。营改增后，企业转让专利技术，属于无形资产，缴纳的增值税税率是6%。但是也存在一些免缴增值税的情况，如果满足以下两个条件可以免缴增值税：一是技术内容与技术转让密切相关，是为技术转让而实施的售后服务，即技术转让合同中应该包括相关的技术服务与技术咨询的条款;二是形式上这部分技术咨询或服务的价款与技术转让的价款是开在同一张发票上。只有满足上述两个条件的技术咨询与服务才能享受免税政策。【法律依据】《中华人民共和国专利法》。
专利使用费增值税税率为6%，应扣缴税额等于接受方支付的价款除以(1+税率)乘以税率。【法律依据】《中华人民共和国专利法》第二十六条申请发明或者实用新型专利的，应当提交请求书、说明书及其摘要和权利要求书等文件。请求书应当写明发明或者实用新型的名称，发明人的姓名，申请人姓名或者名称、地址，以及其他事项。说明书应当对发明或者实用新型作出清楚、完整的说明，以所属技术领域的技术人员能够实现为准；必要的时候，应当有附图。摘要应当简要说明发明或者实用新型的技术要点。权利要求书应当以说明书为依据，清楚、简要地限定要求专利保护的范围。依赖遗传资源完成的发明创造，申请人应当在专利申请文件中说明该遗传资源的直接来源和原始来源；申请人无法说明原始来源的，应当陈述理由。