本科毕业论文抽检不合格的处理方式可能因学校和专业不同而有所不同，以下是一些可能的处理方式：
本科论文抽检一般在11月份左右。每届本科论文抽检时间每个学校都不一样，需要看学校安排。省级教育行政部门采取随机匹配方式组织同行专家对抽检论文进行评议，提出评议意见。每篇论文送3位同行专家，3位专家中有2位以上（含2位）专家评议意见为“不合格”的毕业论文，将认定为“存在问题毕业论文”。3位专家中有1位专家评议意见为“不合格”，将再送2位同行专家进行复评。2位复评专家中有1位以上（含1位）专家评议意见为“不合格”，将认定为“存在问题毕业论文”。
主要是博士，但是如果是以后的升职等重要人事变迁、学术方面的事，还是会对论文进行调查的，毕竟这些都是进入学术论文数据库的
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