第一，字数要求不同。本科毕业论文一般要求最少8000字，而研究生论文一般要求最少30000字，相对而言研究生毕业论文需要写的内容更多。第二，创新程度不同。本科论文创新有限，而研究生毕业论文确实在理论与实证方面确实有一定的创新，而不是简单地重复。本科论文更多的是对同一问题的研究，论文的质量不高，而研究生毕业论文对研究的创新要求要高一些，而且更有实际应用价值。第三，答辩要求不同。现在本科生毕业论文一般都是各自学院指定论文指导老师，然后毕业学生跟着老师的指导写作，论文写完了以后，论文指导老师检查一下有没有错误，基本上就可以进入论文答辩。但是研究生毕业论文不同，研究生毕业论文一般要求盲审，即把研究生的毕业论文打印两份分别送到学校外面的专家手中，如果两个专家都同意，那么就可以进入答辩，否则还需要继续送审。如果两个都没通过，则直接延期毕业一年。第四，论文查重要求不同。本科生毕业论文学校要求查重一般是30%，而研究生的毕业论文要求查重是15%，再结合研究生毕业论文的字数要求，可以推断出研究生的毕业论文难度更大，很多时候研究生毕业论文就难在了如何降低重复率这件事上。第五，论文规范要求不同。本科生的毕业论文不要求上知网，因而很多本科生的毕业论文写作不规范，论文的格式排版都不符合学校的要求，但是研究生的毕业论文则需要在知网上披露，因而研究生毕业论文需要严格按照学校的要求写作和排版。第六，毕业论文约束力不同。对于本科生而言，自己毕业以后本科论文即使有问题，也不会对自己造成什么影响，但是研究生毕业论文不同，教育部一般会在研究生毕业一年后，对研究生的毕业论文进行一次抽查，如果发现研究生毕业论文有问题，就会撤销研究生学历和学位。这对于已经毕业多年的研究生而言，影响是巨大的，很可能会将会失去工作，而且研究生导师也会受到处罚。
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