理论研究和应用研究毕业论文区别如下：
自然科学研究大致上可以分为理论研究和应用研究。. 理论研究又被称为基础研究，以认识现象、发现和开拓新的知识领域为目的，一般是没有特定的应用或使用目的，它的开发性质源于好奇心及兴趣。. 研究结果通常具有一般的或普遍的正确性，成果常表现为一般的原则、理论或规律并以论文的形式在科学期刊上发表或学术会议上交流。
应用研究是将基础研究所产生的知识，设法应用到解决人类实际的问题上。. 具有特定的实际目的或应用目标，研究结果一般只影响科学技术的有限范围。. 研究成果的表现则更加多样化，除了文章外，还有专利、产品等诸多形式。. 现在由于科研经费有限，投资者一般都愿意选择资助应用研究项目。
学术论文是某一学术课题在实验性、理论性或预测性上具有的新的科学研究成果或创新见解和知识的科学记录，或是某种已知原理应用于实际上取得新进展的科学总结，用以提供学术会议上宣读、交流、讨论或学术刊物上发表，或用作其他用途的书面文件。学术论文按写作目的，可将学术论文分为交流性论文和考核性论文。
学术论文是对某个科学领域中的学术问题进行研究后表述科学研究成果的理论文章。学术论文的写作是非常重要的，它是衡量一个人学术水平和科研能力的重要标志。在学术论文撰写中，选题与选材是头等重要的问题。一篇学术论文的价值关键并不只在写作的技巧，也要注意研究工作本身。
在于你选择了什么课题，并在这个特定主题下选择了什么典型材料来表述研究成果。科学研究的实践证明，只有选择了有意义的课题，才有可能收到较好的研究成果，写出较有价值的学术论文。所以学术论文的选题和选材，是研究工作开展前具有重大意义的一步，是必不可少的准备工作。
学术论文，就是用系统的、专门的知识来讨论或研究某种问题或研究成果的学理性文章。具有学术性、科学性、创造性、学理性。
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