大学毕业时候的毕业论文由学校收回，之后是被存档处理的，一般情况下都要存很长一段时间
学校图书馆归档。专科毕业设计最后会被学校放入图书馆备档，方便以后需要时查看。毕业设计学校学生毕业前夕总结性的独立作业。是实践性教学最后一个环节。旨在检验学生综合运用所学理论、知识和技能解决实际问题的能力。在教师指导下，学生就选定的课题进行工程设计和研究，包括设计、计算、绘图、工艺技术、经济论证以及合理化建议等，最后提交一份报告。应尽量选与生产、科学研究任务结合的现实题目，亦可做假拟的题目。
由学校院系保存。以上海交通大学为例，毕业论文最后由学校院系保存。按照《上海交通大学关于本科生毕业设计(论文)工作的若干规定》的相关规定，学生在答辩与评分以后，毕业论文都需要采用资料保存归档。
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