（1）原虫病
1）焦虫病 牛焦虫病是由蜱为媒介而传播的一种虫媒传染病。焦虫病寄生于红细胞内，主要临床症状是高热、贫血和黄疸，反刍停止，泌乳停止，食欲减退，消瘦严重者则造成死亡。此病以散发性或地方性流行，多发生于夏秋季节，以7～9月份为发病高峰期。
2）球虫病 牛球虫病是由艾美尔属的几种球虫寄生于牛肠道引起的以急性肠炎、血痢等为特征的寄生虫病。牛球虫病多发生于犊牛。本病分布广泛，尤其在潮湿地区往往呈地方性流行及大批死亡。
（2）蠕虫病
1）肝片吸虫病 又称肝蛭，由吸虫纲片形科肝片吸虫寄生在肝脏胆管内，引起急性或慢性肝炎或胆囊炎，伴发全身性中毒和营养障碍，造成大批死亡。牦牛肝片吸虫病，分布普遍，感染率为20%～50%。人偶或感染。
牧民们知道沼泽低湿地带放牧牛、羊，容易感染肝片吸虫病。因此他们对利用沼泽地有丰富的经验，春季一般是半天利用沼泽地、半天利用干燥地放牧，暴雨后不利用沼泽地；每年冬季轮换烧沼泽地，以消灭肝片吸虫的中间宿主—锥实螺。
2）棘球蚴病 是由某些绦虫的中绦期囊体—棘球蚴寄生于人和哺乳动物的脏器引起的一种人畜共患寄生虫病，对人畜的危害都严重。在我国牧区分布广泛。在四川省阿坝州牧区解剖的牦牛、犏牛，几乎每头都有棘球蚴感染，感染强度从数个至十余个不等。
3）肺丝虫病 牦牛的肺丝虫病主要由圆形亚目网尾科网尾属的胎生网尾线虫寄生在气管和支气管引起，主要危害犊牦牛。
4）消化道线虫病 是指在反刍兽消化道中的毛圆科、毛线科、钩口科和圆形科的多种线虫所引起的寄生虫病。这些虫体寄生在反刍兽的第四胃、小肠和大肠中，在一般情况下多呈混合感染。
5）犊牛新蛔虫病 是由异尖科新蛔虫属犊新蛔虫寄生于初生犊牛的小肠内，引起犊牛肠炎、下痢、腹部膨胀和腹痛等症状的一种寄生虫病。该病分布极广，初生牛犊感染轻则影响生长发育，重则引起死亡。被感染犊牛～3月龄期间症状最严重，主要表现为消化不良、食欲下降和腹泻。有时泻粪中含有血液及特殊恶臭味。有时泻粪中有新蛔虫成虫虫体。有时腹部膨胀，有疝痛症状。体温、心跳、呼吸一般正常。畜体虚弱消瘦，精神萎靡迟钝，后肢无力站立不稳。
（3）蜘蛛昆虫病
1）牛皮蝇蛆病 是由寄生于牛的背部皮下组织内牛皮蝇和纹皮蝇的幼虫所引起的一种慢性寄生虫病。皮蝇幼虫的寄生可使患牛消瘦，皮革质量降低，犊牛发育受阻。牛皮蝇蛆病是危害较严重的一种蝇蛆病，在牦牛、犏牛中流行极为普遍。
2）外寄生虫 牦牛的外寄生虫，主要有腭虱、毛虱、蠕形蚤、蜱等。主要寄生在体表被毛稀少的部位，如胸背部、肩胛部，一般全身都可见到。
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