中医学理论体系的指导思想是整体观念。
一、人体是一个有机整体。
1、生理上的整体性：五脏一体观；形神一体观。
2、病理上的整体性局部病变——整体性病理反应。
3、诊治上的整体性：诊察疾病时，可通过观察分析形体、官窍、色脉等外在的病理表现，推测内在脏腑的病理变化，从而作出正确诊断，为治疗提供可靠依据。
二、人与自然环境的统一性。
1、自然环境对人体生理的影响：天地阴阳二气。
2、自然环境对人体病理的影响：适应自然环境的能力有限。
3、自然环境与疾病防治的关系：在养生防病中顺应自然规律，在治疗过程中遵循因时因地制宜的原则。
三、人与社会环境的统一性。
1、社会环境对人体生理的影响：社会的变迁。
2、社会环境对人体病理的影响：社会环境剧烈、骤然变化。
3、社会环境与疾病防治的关系：预防和治疗疾病时，尽量避免不利的社会因素对人的精神刺激，创造有利的社会环境，提高人体对社会环境的适应能力，预防疾病的发生，并促进疾病向好的方面转化。
中医学理论体系介绍：
中医学理论体系初步形成于战国至两汉时期，《黄帝内经》、《伤寒杂病论》、《神农本草经》等医学专著的成书，标志着中医学理论体系的初步形成。汉代以后的医学理论与实践的发展，又逐渐充实和完善了这一理论体系。
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