学院学术氛围浓厚,科研工作深入扎实。在药理与毒理学、临床药学、药物新剂型设计与评价、药物代谢和药物动力学、创新药物的合成与筛选、中药与天然药物药效物质基础和质量标准等领域的研究工作不断深入。目前拥有国家中医药管理局批准的中药三级实验室1个,二级实验室3个;辽宁省科技厅批准的重点实验室1个;辽宁省教育厅批准的辽宁省高等学校创新团队1个。近三年,学院获国家级科研项目35项、省部级科研项目42项、国际合作与资助项目10项;学院获得国家科技成果奖2项,省、部级科技成果奖6项,获得日内瓦国际发明奖、教育部、中国高校、辽宁省、沈阳市等各级奖11项。主办国际、国家级学术会议5次,邀请院士来院做特约报告2次,并特聘丁健院士作为我院研究生指导教师。获得国家新药证书2项,国家发明专利15项;发表各类研究论文420篇,其中SCIE收录近150篇;药理毒理学科进入ESI全球排名1%。走产学研一体化道路是学院发展的重要方向,在科研工作中抓好应用基础研究,抓知识产权,出成果,出效益,出人材。以科研促产品,以产品养科研。立足国际前沿,充分发挥医学、药学学科齐全的优势,通过学科群建设,促进了学科的交叉、渗透,显著提高了科技攻关和科技创新能力。目前,我院在与沈阳泗水科技城共建“药学检测评价中心”、与广东合鑫药业股份有限公司共建“个体化治疗中心”等广泛合作基础上,已经被辽宁省教育厅批准为“第三批辽宁省高等学校对接产业集群协同创新基地”,旨在与西丰医药保健品产业集群合作,开展“鹿产品”等特色资源保健品研发与深加工。