人FRAT1(frequently rearranged in advanced T cell lymphomas-1)基因最初被认为是T细胞淋巴瘤的原癌基因,是FRAT(frequetly rearranged in advanced T cell lymphomas)家族中的一员载体。每孔细胞转染所需双链shRNA和Lipofectamine 2000分别是1 μl,0.8 μg。按Lipofectamine 2000使用说明进行细胞转染。转染24 h后每孔细胞分成3孔,分别加入G418(600 μg/ml);以后每3天更换培养基和G418。等未转染对照孔细胞都被杀死后,终止G418筛选,用含10%FBS培养基培养具有G418抗性细胞,增殖到一定数量后,将其转到培养瓶中培养,定期用G418清除遗失抗性的细胞。另外同时筛选转染表达无功能shRNA质粒和转染pSINsi-hu6载体的HT29细胞作为阴性对照。 1.2.4 HT29细胞总RNA 抽提及RT-PCR 总RNA抽提按Trizol产品说明书进行。操作步骤如下:用PBS清洗两遍收集的细胞,RNA Trizol裂解,氯仿抽提,异丙醇、75%乙醇沉淀、洗涤后,溶解于DEPC水中,测定RNA浓度。利用提取的RNA进行RT-PCR,获得cDNA。RT-PCR按宝生物工程公司的试剂盒说明操作。RT条件为:42℃ 90 min,85℃ 5 min,4℃ 5 min。 1.2.5 PCR 取cDNA作为模板扩增FRAT1和GAPDH,其中扩增FRAT1特异性引物为:sense primer:5′-GCCCTGTCTAAAGTGTATTTTCAG-3′,antisense primer:5′-CTCTGCAGTCCTACTCAAGCG-3′。扩增片段长325 bp。扩增GAPDH作为内参对照,引物序列分别是sense primer:5′-TCACCATCTTCCA GGAGCGAG-3′,antisense primer:5′-TGCTCAGTGTAGCCCAGGAT-3′。扩增产物长615 bp。PCR条件为:94℃ 3 min,94℃ 30 s,58℃ 30 s,72℃ 25 s,72℃ 7 min,4℃ 5 min,30个循环。相关产物在琼脂糖凝胶上电泳鉴定。 1.2.6 转染细胞总蛋白的提取及Western blot鉴定 收集细胞后用预冷PBS清洗两遍,加入含PMSF的裂解液(1 ml含1 μl PMSF)200 μl,于冰上裂15 min,12 000 r/min离心10 min,收集上清。蛋白浓度用BCA法测定,取上清12 μl,与3 μl 5×loading buffer混匀,100℃煮沸5 min,所得样品经SDS-PAGE电泳120 V 25 mA 150 min分离后,冰上电转至PVDF膜50 min,5%脱脂奶粉封闭1 h,按顺序加入兔抗人FRAT1基因抗体(4℃过夜,次日TBS-T Buffer洗6次,5 min/次),H暗室曝光,显影,定影。底片在UVP凝胶成像系统下成像、保存。 1.3 数据分析 将PCR及蛋白印迹操作最后得到的胶片进行拍照扫描,用凝胶图像处理系统(Gel-Pro Analyzer)进行分析。分别计算FRAT1各条带与内参GAPDH条带的相对光密度比值。重复3次实验。HT29细胞中FRAT1基因的含量设为1,转 染pSINsi-hu6-FRAT1表达载体的细胞FRAT1基因下降率求.EMBO J,1997,16(3):441-450. [2 ] Jonkers J,Weening JJ,van der Valk M.Over expression of Frat1 in transgenic mice leads to glomerulosclerosis and nephritic syndrome,and provides direct evidence for the involvement of Frat1 in lymphoma-progression.Cancer Res,2004,64(18):6603-6609.