SCI收录期刊的影响因子是不能完全客观的说明其文献质量的。用引用次数除以发行量完全有意义的前提就是它们要严格成正比,但事实上这是不可能的。著名的杂志一般凭借其文献的质量和声誉拥有很高的引用次数。对于这些杂志,在互联网普及的今天,引用次数与发行量并没有很明显的关系。然而著名杂志一般有很高的发行量,这无疑会使其影响因子大幅下降,甚至比某些质量不是非常高但发行量小的杂志还低。其次,评论性和综述性的文献引用次数一般明显高于原创性的文献。含综述较多的杂志影响因子也较高,但这并不能真实反映其原创性成果的价值。此外,水平相近的各学科杂志影响因子差别很大。这固然能反映各学科的热门程度。但对于涉及交叉学科的杂志,影响因子往往介于多学科同等水平杂志之间,无法客观反映其文献的质量。