软件动物发育演化研究论文

一切生命形态发生、发展的演变过程。“进化”一词来源于拉丁文evolution，原义为“展开”，一般用以指事物的逐渐变化、发展，由一种状态过渡到另一种状态。1762年，瑞士学者邦尼特最先将此词应用于生物学中。进化思想的发展 古代人们在栽培植物和驯养动物的生产实践中，积累了关于生物的形态、构造和生活习性的知识，注意到生物机体的变化以及生物与环境的关系，逐步形成了朴素的生物进化思想。古希腊的亚里士多德通过对他那个时代有关动物的知识的系统整理，把540种动物按性状的异同分为有血的和无血的两大群,每群之下又分为若干类。他进一步提出生物等级即生物阶梯的观念,认为自然界所有生物形成一个连续的系列,即从植物一直到人逐渐变得完善起来的直线系列。中国战国时期汇集的《尔雅》一书记载了生物类型的变化；汉初的《淮南子》一书，不仅对动植物作了初步分类，而且提出各类生物是由其原始类型发展而来的。近代科学诞生以前，进化思想发展缓慢，当时广为流行的是神创论和物种不变论。这种观点直到18世纪仍在生物学中占统治地位，其代表人物是瑞典植物学家 林耐（1707～1778）。他所提出的分类系统虽然有助于揭示生物物种之间的历史联系，但他却把物种看作是上帝创造的不可改变的产物。随着生产和科学的发展，积累了许多新的与物种不变相矛盾的事实。在大量事实的影响下，甚至像林耐这样坚定的神创论者，在晚年也不得不承认由于杂交的结果能产生新种。和林耐的观点相反，法国学者.布丰(1707～1788)相信物种是变化的，现代的动物是少数原始类型的后代。他把有机体与居住环境联系起来，认为气候、食物和人的驯养等因素可引起动物性状的变异。1809年,另一位法国学者拉马克(1744～1829)在其《动物学哲学》中，用环境作用的影响、器官的用进废退和获得性的遗传等原理解释生物进化过程，创立了第一个比较严整的进化理论。1859年.达尔文发表《物种起源》一书，论证了地球上现存的生物都由共同祖先发展而来，它们之间有亲缘关系，并提出自然选择学说以说明进化的原因，从而创立了科学的进化理论，揭示了生物发展的历史规律。19世纪80年代以来，以A.魏斯曼(1834～1914)为代表的新达尔文主义,把种质论和自然选择学说相结合,丰富了达尔文的进化理论。20世纪30年代以来，以T.杜布尚斯基(1906～1975)等人为代表的综合进化论综合了细胞遗传学、群体遗传学以及古生物学等学科的成就，进一步发展了以自然选择为核心的进化理论。60年代末，日本学者木村资生等人提出中性学说，又在分子水平上揭示了进化的某些特征，补充、丰富了进化论。进化的进步性 地球上的生命，从最原始的无细胞结构生物进化为有细胞结构的原核生物，从原核生物进化为真核单细胞生物，然后按照不同方向发展，出现了真菌界、植物界和动物界。植物界从藻类到裸蕨植物再到蕨类植物、裸子植物，最后出现了被子植物。动物界从原始鞭毛虫到多细胞动物，从原始多细胞动物到出现脊索动物，进而演化出高等脊索动物──脊椎动物。脊椎动物中的鱼类又演化到两栖类再到爬行类，从中分化出哺乳类和鸟类，哺乳类中的一支进一步发展为高等智慧生物，这就是人。生物界的历史发展表明，生物进化是从水生到陆生、从简单到复杂、从低等到高等的过程，从中呈现出一种进步性发展的趋势。一般说来，进化过程的进步具有如下特征：①在生物界的前进运动中，可以看到不同层次的形态结构的逐步复杂化和完善化；与此相应，生理功能也愈益专门化，效能亦逐步增高。②从总体上看，遗传信息量随着生物的进化而逐步增加。③内环境调控的不断完善及对环境分析能力和反应方式的发展，加强了机体对外界环境的自主性，扩大了活动范围。生物进化的道路是曲折的，表现出种种特殊的复杂情况。除进步性发展外，生物界中还存在特化和退化现象。特化不同于全面的生物学的完善化，它是生物对某种环境条件的特异适应。这种进化方向有利于一个方面的发展却减少了其他方面的适应性，如马由多趾演变为适于奔跑的单蹄。当环境条件变化时，高度特化的生物类型往往由于不能适应而灭绝，如爱尔兰鹿，由于过分发达的角对生存弊多利少，以至终于灭绝。对寄生或固着生活方式的适应，也可使机体某些器官和生理功能趋向退化。如有一种深海寄生鱼，雄体寄生在雌体上，雄体消化器官退化，唯有精巢特别膨大，以保证种族繁衍。有些研究者对进化的进步性表示怀疑，认为进步性不是进化的基本特征，也不是进化的本质。科学研究证明，进化不全都引起进步，进化过程中也有退化，但从有机界总的进化过程看，进步性发展是进化的主流和本质。进化的方式 生物界各个物种和类群的进化，是通过不同方式进行的。物种形成（小进化）主要有两种方式：一种是渐进式形成，即由一个种逐渐演变为另一个或多个新种；另一种是爆发式形成,即多倍化种形成,这种方式在有性生殖的动物中很少发生，但在植物的进化中却相当普遍，世界上约有一半左右的植物种是通过染色体数目的突然改变而产生的多倍体。物类形成（大进化）常常表现为爆发式的进化过程，从而使旧的类型和类群被迅速发展起来的新生的类型和类群所替代。渐进进化是达尔文进化论的一个基本概念。达尔文认为，在生存斗争中，由适应的变异逐渐积累就会发展为显著的变异而导致新种的形成。因为“自然选择只能通过累积轻微的、连续的、有益的变异而发生作用，所以不能产生巨大的或突然的变化，它只能通过短且慢的步骤发生作用”。与达尔文的主张相反，早期遗传学家如荷兰的弗里斯等相信，新种可由大的不连续变异即突变直接产生，并把这种方式看作是进化变化的主要源泉，认为自然选择对生物的进化不起积极作用。现代进化论坚持达尔文的渐变论思想和自然选择的创造性作用,强调进化是群体在长时期的遗传上的变化,认为通过突变（基因突变和染色体畸变）或遗传重组、选择、漂变、迁移和隔离等因素的作用，整个群体的基因组成就会发生变化，造成生殖隔离，演变为不同物种。20世纪70年代以来，一些古生物学者根据化石记录中显示出的进化间隙,提出间断平衡学说,代替传统的渐进观点。他们认为物种长期处于变化很小的静态平衡状态，由于某种原因，这种平衡会突然被打断，在较短时间内迅速成为新种。生物的进化既包含有缓慢的渐进，也包含有急剧的跃进；既是连续的，又是间断的。整个进化过程表现为渐进与跃进、连续与间断的辩证统一。

人为万物之灵，有智慧，有特别发达的大脑，能劳动，能制造工具等。但归根结蒂，人是从动物进化而来的，从生物学的观点来看，人仍旧是动物。在林奈的分类系统中，人、猿、猩猩等都属灵长目，人属灵长目的人种人类是由古猿进化来的，是从猿的系统中分化出来的独立的一支，其出现及发展是一个漫长的历史过程。古人类学的研究表明， 在距今2 000—3 000万年前，森林古猿在茂密的森林里过着树栖生活。在距今约1500万年前后，地球上的热带森林地区出现了多种森林古猿，如槲猿、拉玛古猿、非洲南猿等等。人类是由哪一种古猿演变而来的呢？说法不一。目前，较为普遍的看法是：森林古猿属中的几个种，如槲猿，是现代猿类的祖先；非洲南猿可能是进化中绝灭的旁支，也可能其中一支是人类的直接祖先；拉玛古猿是人类的早期祖先。拉玛古猿演化成200万年前的南方古猿，进一步发展成为现代人类。从古猿到人有一个漫长的演变过程。一种观点认为，古猿在森林里过树栖生活，以果实为食。它们的体质结构与现代的黑猩猩、猩猩很相似，全身被毛，颌部发达，犬齿大而尖锐。后来，它们所栖息的地方发生了变化。喜马拉雅山地带上升，山北地区得不到海洋暖湿气流，气候变冷，森林逐渐减少，食物缺乏。一部分古猿被迫南迁，找到森林后，仍过树栖生活，身体结构变化不大，逐渐发展为现代类人猿；另一部分古猿仍留在原地，不得不由树栖转到地面上觅食。新的生活方式，终于引起了直立行走、前后肢分工、脑容量增加等一系列变化。经过千百万年，逐渐发展成为现代人类。在从古猿转变到人的过程中，劳动无疑起了很重要的作用。传统的观点认为，劳动创造了人本身。对于下到地面上生活的古猿来说，由于劳动，促使其上下肢分工越来越明显，上肢逐渐解放出来，以至最后达到身体直立。直立姿势的产生，使手脚进一步分工，并使躯体进一步变化，终于形成了人所特有的体态。另外，在劳动中，人与人之间必然发生联系，促使了语言的形成。劳动和语言，又促进了脑的发展。而手、脑、语言的发展又提高了劳动效率，增进劳动的成果，加速了从古猿到人的转变。近年来，有另一种观点认为，在从古猿到人的进化过程中，凡是身体直立、前肢能灵活地使用和制造“工具”的古猿，也就是说凡是能够劳动的古猿，就能获取更多的食物，或更能有效地抵御敌害，获取更大的生存机会，在自然选择的过程中，得以更好地存活下来，繁殖后代并继续进化。反之，就被自然选择淘汰。所以，在从古猿到人的转变过程中，劳动是一种选择因素而不是创造因素。人类的进化可以分为以下四个阶段：1．早期猿人阶段：生活在距今约180万年的“能人”，便属于这个阶段，其外貌像猿，脑容量达680毫升，身体矮小，大约～米。这个时期的人类已具有人的基本特点，仍有许多原始性，他们能直立行走，能制造简单的工具。2.晚期猿人阶段：包括猿人和直立人的一切类型，大约生存于距今200或150万年到20～30万年前。这个时期的猿人化石，以我国北京市西南周口店的北京猿人遗址的材料最为丰富。北京猿人生活于50～60万年前，高约米，眉嵴粗壮，嘴部突出，类似于猿。他们过着群居生活，以采集植物性食物为主，以狩猎为辅。这个时期的人类，已经能制造较为进步的旧石器，并且已经开始用火。3．早期智人（古人）阶段：这个时期的人类已逐步脱离了猿的性质，与现代人很接近，生存于距今约10～20万年到5万年前。这个时期的人类化石，最早是在德国的尼安德特河谷发现的，称为尼安德特人（简称尼人）：其脑量已和现代人差不多，能制造石器，还能人工取火。4．晚期智人（新人）阶段：这个时期的人类，出现于4～5万年前，直到现代的人类。山顶洞人化石，是1993年在北京周口店龙骨山山顶洞发现的，生活于距今18 000年前。他们已能加工石器、骨器，生产力也进一步提高，会用大兽皮修建简单的房屋，原始宗教已经产生。这个时期已进入母系氏族社会，有雕刻和绘画艺术。在晚期智人阶段，现代人种已经开始分化和形成，并分布到世界各地。人类进化的最近一个阶段，是包括现代人在内的智人阶段。可分为早期智人和晚期智人。早期智人生活在距今约25万～4万年前，是旧石器时代中期的古人类。晚期智人在解剖结构上属于现代人，大约是在距今四五万年前开始出现的。在晚期智人阶段，人类的分布范围扩大了，从旧大陆到达了澳洲和美洲。这样，由现有发现的化石来追溯人类进化的各个阶段 ，已可以循着由近及远的序列，从晚期智人—早期智人—直立人—能人，一直追溯到南方古猿。比南方古猿更早、形态更原始的人类的早期代表，则还在探索之中

您好， 以下我们以细菌类为例做论文讨论（例文）：用基因组学方法追溯细菌的进化史细菌是一类“杂乱无章”的生物。虽然大多数生物都倾向于将基因传递给自己物种的下一代，但细菌常常与毫无亲缘关系的物种进行遗传物质交换，这个过程叫做基因横向转移。 这就是为什么怀疑论者质疑研究人员是否有重建细菌进化史的一线希望。但现在，由于近源细菌物种的基因组测序的完成以及新分析方法的问世，亚利桑那大学的研究人员证明构建细菌进化树是完全可能的。Nancy Moran、Emmanuelle Lerat和Vincent Daubin提出了追溯细菌进化史的一个新方法：在细菌基因组中寻找一组可作为可靠的细菌进化指示器的基因。这种方法对于研究生物进化史的生物学家具有重要意义，因为它为勾画横向基因转移等塑造基因组结构和实质的进化事件奠定了基础。细菌有望为科学家揭示丰富的基因组学进化信息，因为已有许多细菌物种的基因组测序完毕，这就使得广泛比较分析各个物种的基因组成为可能，而且细菌的基因组很小且结构紧凑。在这项研究中，研究人员选择了古生菌群:gamma变形杆菌（ Proteobacteria），这是一个在生态上具有丰富多样性的细菌类群（包括大肠杆菌和沙门氏菌等），记载的大多数基因横向转移都发生在这个类群，这个类群的中细菌物种基因组完成测序的也最多。这个研究结果证明了这种方法重建影响基因组的重要进化事件的能力，不仅有望用于查明细菌基因组的进化，而且还能揭示细菌物种的多样化。相关文章：脉孢菌独特的基因组进化方式 比较基因组学方法对进化生物学的新贡献 中国SARS研究获重大突破 成功解析病毒进化规律 进化相关数据库及资源 血吸虫与人类可能协同进化 PNAS：细菌在实验室中“重演”进化史报道：美国密歇根州大学科学家近日在《美国国家科学院院刊》上发表论文，通过对大肠杆菌的研究发现这种细菌在实验室进化出新的特点，并可通过传代“重演”进化史。20年前，美国密歇根州大学进化生物学家理查德·伦斯基取单个大肠杆菌繁殖，让其后代繁衍了12支实验室细菌种群。如今当伦斯基观察它们发生了什么情况时，发现这12支细菌种群还在成长壮大，并逐渐积累了变异，繁殖出了万多代细菌。在每一个独立的种群中，伦斯基看到大多数细菌的模样是相似的。比如，所有12支细菌种群都进化出了更大的细胞、更快的生长速度和较低的高峰种群密度。 然而有一些特点与众不同，大约是万代细菌出现了戏剧性的变化，突然获得了代谢柠檬酸盐的能力，而柠檬酸盐是其培养基中的第二种营养物质，大肠杆菌通常利用不了它们。事实上，无能力利用柠檬酸盐是细菌学家区分大肠杆菌和其它细菌的特征之一。而这种利用柠檬酸盐的变异种群增加了大肠杆菌的种群数量和多样性。伦斯基说：“这是我们做实验时看到的最深刻的变化。显然有些细菌完全与众不同，甚至不能考虑为正常的大肠杆菌，这使它特别有趣味。” 到现在，伦斯基统计过足够的细菌细胞，发现其中所有样本的突变都是几次积累后实现的。这意味着利用柠檬酸盐的能力很特别，可能是一种罕见的不可能的变异种类，或一种罕见的染色体倒置或是几次基因排序突变的累积效果。为发现是种什么样的变异，伦斯基转向冰柜中保存的每种种群每500代的样本，让它们再现他所需要的进化历史。其办法是让细菌苏醒，再让它们重演一次进化历程。 同一种群会再次进化出能利用柠檬酸盐的能力吗？他想总会有一种群会出现这种累积效果的。结果果然不出所料。这种重演表明原有种群在2万代或以上时开始出现了这种进化重演。他总结在大约2万代时一定突然发生了一些事情，从而使细菌进化出这种利用柠檬酸盐的能力。 伦斯基及其同事正在识别一些细菌的较早变化，以了解这种变异如何在1万代之后的细菌中产生的。与此同时，实验表明进化并不总是朝着最好的结果出现。相反一些变化事件有时会开放一种种群的进化之门，有时则会关闭其它种群的进化之门。这对反对进化论的人给了反驳一击。（生物谷）相关新闻Nature：探索地球最初细胞与环境的相互作用格陵兰冰层下发现存活12万年细菌Nature：细菌为什么会与人共存？美科学家创造出有望成为绿色新能源的新菌株Science：肠道微生物与宿主共同进化恐怖家鼠称霸大西洋小岛 体形进化变大三倍Science：古老蛋白质助细菌清除垃圾基因PNAS：发现巨型细菌Genome Biology：一种超级细菌的基因组测序完成Science：细菌也有智慧？伤寒菌的进化史 伤寒菌的进化史 一个国际项目研究了100多株引起伤寒的细菌的遗传多样性，揭示了该细菌的进化史，并提出一株抗药细菌可能在从亚洲传到非洲。PhilippeRoumagnac和同事报告说，伤寒肠沙门菌现在主要影响南半球的贫困人口，但是它在少数人群中没有症状地潜伏了几千年了。这种微生物长期不受自然选择的影响，以一个名为“中性进化”的过程极为缓慢地变化，但是偶然能引起急性流行病，那时会在自然选择的影响下快速进化。氟喹诺酮类 生 物 谷 网 站 一个国际项目研究了100多株引起伤寒的细菌的遗传多样性，揭示了该细菌的进化史，并提出一株抗药细菌可能在从亚洲传到非洲。Philippe Roumagnac和同事报告说，伤寒肠沙门菌现在主要影响南半球的贫困人口，但是它在少数人群中没有症状地潜伏了几千年了。这种微生物长期不受自然选择的影响，以一个名为“中性进化”的过程极为缓慢地变化，但是偶然能引起急性流行病，那时会在自然选择的影响下快速进化。氟喹诺酮类抗生素的使用导致了抗药株的形成，但是它们还没有完全取代对药物敏感的菌株。文章作者报告说，亚洲的一种抵抗多种抗生素的特殊菌株最近开始在非洲出现 生物谷网站 相关新闻美科学家开发出一种生物友好型纳米级光源印尼宣布计划使用人禽流感疫苗报道称刚果（金）东部地区发现疑似禽流感疫情印度科技崛起的原因美国生化与分子生物学会在广州生物医药与健康研究院设科学发展生物能源的若干问题探讨日科学家首次拍子宫内双胞胎分裂形成过程肝癌治疗性疫苗获新突破 进入二期临床研究重组RNA的表达——tRNA支架的巧妙运用专家解读“人兽”之惑不是很准确，希望对您有帮助吧。