报道了白鱀豚的皮肤、骨骼、肌肉、消化、排泄、神经及感官等器官系统的结构,保留了此极危物种的极珍贵的科学资料,并对其他海豚进行了功能形态学研究:1)发现白鱀豚胃的结构在鲸类中独一无二;2)对3种齿鲸蜗神经纤维数量和大小的研究,报道了脊椎动物中已知直径最大的神经纤维;3)通过视神经纤维数量和大小的研究,首次指出脊椎动物的脑神经中仅海兽有大于15μm的纤维,白鱀豚视神经纤维数仅相当于海豚科的1/7;4)鉴定了15头白鱀豚的年龄,得到了两性的生长曲线,用协方差分析和判别分析研究了白鱀豚的性二型;5)首次报道了白鱀豚等的脊髓灰质细胞分层模式,在白鱀豚脊髓的腔隙中发现了触液神经元;6)首次报道鲸类鼻道肌的构筑;7)首次把肾结构指数测定应用到鲸类肾脏研究。在两栖爬行动物研究中,鉴定中国海域的丽龟,证实我国有5种海龟。描记了壁虎属新种和云南半叶趾虎新亚种,指出我国和日本的多疣壁虎实际包括2个不同的种——铅山壁虎和多疣壁虎。近年测定了壁虎类30个属长378 bp的核c-mos 基因片段的序列,根据系统发生分析的结果,提出了壁虎类高级阶元新分类系统的建议,把Kluge (1987)的鳞脚虎科改订为三个科,即鳞脚虎科(限四肢退化的种类)、絮趾虎科和刺尾虎科。测定了大壁虎(Gekkogecko)线粒体基因组全序列,全长16435 bp。这是壁虎类蜥蜴中首例测定的线粒体基因组全序列。再从GenBank下载20种爬行动物的线粒体基因组全序列,共21个序列用于系统发生关系分析。得到了蜥蜴亚目和其中的五大类群(壁虎类,蚓蜥类,石龙子类,鬣蜥类和蛇蜥类)都为单系;蛇亚目和蜥蜴亚目为姐妹群等结果。提出了蚓蜥类是壁虎类的姐妹群、蜥蜴亚目为单系、硬舌类为并系等新的蜥蜴亚目系统发生。发表论文327篇,其中发表在Journal of Molecular Evolution, Molecular Phylogenetics and Evolution, Biological Journal of the Linnean Society, Marine Mammal Science等国际刊物的56篇,出版了《中国动物志哺乳纲第九卷·鲸目、食肉目、海牛目》、《中国的海兽》、《江苏省志·生物志·动物篇》等专著、论文集14本,获国家发明专利3项。创建了南京师范大学遗传资源研究所。培养了博士26名和硕士22名。