中国是食用菌物种多样性高度丰富的国家，包括部分木质化的灵芝，总数统计可达1000多种。人工培养成功并形成子实体的有80多种，如果包括应用菌丝体发酵培养的达200多种。如香菇、豹皮香菇、大杯香菇、虎皮香菇、裂褶菌、侧耳（糙皮侧耳）、金顶侧耳、鲍鱼侧耳、黄白侧耳、泡囊侧耳、佛罗里达侧耳、肺型侧耳、粉褶侧耳、桃红侧耳、菌核侧耳、（虎奶菇）、刺芹侧耳、白灵侧耳（白灵菇）、贝型圆孢侧耳、亚侧耳、白侧耳、宽褶奥德蘑、长根奥德蘑、金针菇、香杏丽蘑、蒙古口蘑、杨树口蘑、荷叶离褶伞、榆生离褶伞、斑玉蕈、花脸香菇、大白桩菇、蜜环菌、假蜜环菌（安络小皮伞）、网盖红褶伞、银丝草菇、草菇、美味草菇、高大环柄菇、柱状田头菇、（杨树蘑）、光盖黄伞（滑菇、滑子蘑）、黄伞（柳蘑）、绉环球盖菇（大球盖菇）、双孢蘑菇、巴氏蘑菇、褐鳞蘑菇、大肥蘑菇、美味蘑菇、毛头鬼伞（鸡腿蘑）、小孢毛鬼伞、黑木耳、毛木耳、大木耳、黄褐木耳、银耳、金耳、榆耳、牛舌菌、猴头菌、小刺猴头菌、珊瑚猴头菌、灰树花、猪苓、茯苓、槐栓菌、圆孢刺孢多孔菌、云芝、灵芝、紫灵芝、密纹灵芝、松杉灵芝、硬孔灵芝、树舌灵芝、竹荪、长裙竹荪、短裙竹荪、棘托竹荪、羊肚菌、蛹虫草、冬虫夏草（无性阶段）、日本虫花、大虫花、黑柄炭角菌（乌灵参）等80种左右。如此多的人工培养子实体和菌丝体发酵种，提供了多风味、多营养、多功能的食用菌和多种药效的药用真菌以及可加工成多功能的保健品。
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