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寻找致癌基因:基因表达数据的双聚类.基于基因表达数据寻找致癌基因,尝试癌症的早期诊断和基因治疗是系统生物学领域的一个经典问题.实际上,许多基因仅仅是在某些类型的中异常表达(高表达或者低表达),而在其它类型的疾病中不异常表达,因此...
背景描述.DSML来自论文"DeepSubspaceMutualLearningForCancerSubtypesPrediction"，其采用深度神经网络同时学习单个组学数据和整体多组学数据中的子空间结构，从而通过对多级、单级和部分级组学数据进行聚类来预测癌症亚型。.过去，癌症被认为是单一类型的疾病...
该数据集来自南斯拉夫卢布尔雅那大学医疗中心研究所，由M.Zwitter与M.Soklic二者提供，感谢。该数据集可在UCI数据库中找到。该数据库是加州大学欧文分校提出的用于机器学习的数据库，是一个常用的标准测试数据集。该数据集有2大类，9个属性，共286个实例。
提出了一种基于改进的遗传算法的癌症特征基因选择方法,对基本遗传算法的交叉和变异操作加以改进,利用改进后的遗传算法对基因微阵列数据进行特征选择。使用支持向量机对基因子集进行留一交叉验证。实验结果表明,改进后的遗传算法比基本遗传算法在选择特征基因时具有明显的优势。
数据来源：UCI数据库是加州大学欧文分校(UniversityofCaliforniaIrvine)提出的用于机器学习的数据库，这个数据库目前共有335个数据集，其数目还在不断增加。这里用到的是威斯康星州临床科学中心的关于乳腺癌肿…
基于基因表达数据寻找致癌基因,尝试癌症的早期诊断和基因治疗是系统生物学领域的一个经典问题.实际上,许多基因仅仅是在某些类型的中异常表达(高表达或者低表达),而在其它类型的疾病中不异常表达,因此探测基因-的高度相关结构对于癌症病理学的研究有重要意义.
我们先来介绍一下癌症基因组里的clonal和subclonal的概念。.癌症里的clonal演化概念由Nowell1976年在Science里提出来的（Science.1976Oct1;194(4260):23-8.），他假设人体的某个体细胞发生突变后经历了数个clonal扩增（演化）过程，最终这个含突变的体细胞集群就演化成了...
本篇博客主要是关于用attractorlandscape对疾病分析及其逆向应用——药物研发的一个总结，主要基于5篇论文，3篇KAIST的2015-2017的分析结直肠癌的论文，一篇Regan的应用型论文及一篇有关attractorlandscape用于药物发现的2019年的综述。
博客首页-文章-博客-正文文献解读丨纯生信分析没搞头了？多组学分析告诉你怎么发22分...此外，miR-486-5p和miR-451a在miRNA聚类3中丰富，而cluster-4中miR-142、miR-150、miR-21、miR-29b、miR-146b和miR-155表达较高。而在亚型1中，定位...
这是100篇重要的自然语言处理（NLP）论文的列表，认真研究该领域的学生和研究人员可能应该了解和阅读。此列表由MasatoHagiwara编制。
寻找致癌基因:基因表达数据的双聚类.基于基因表达数据寻找致癌基因,尝试癌症的早期诊断和基因治疗是系统生物学领域的一个经典问题.实际上,许多基因仅仅是在某些类型的中异常表达(高表达或者低表达),而在其它类型的疾病中不异常表达,因此...
背景描述.DSML来自论文"DeepSubspaceMutualLearningForCancerSubtypesPrediction"，其采用深度神经网络同时学习单个组学数据和整体多组学数据中的子空间结构，从而通过对多级、单级和部分级组学数据进行聚类来预测癌症亚型。.过去，癌症被认为是单一类型的疾病...
该数据集来自南斯拉夫卢布尔雅那大学医疗中心研究所，由M.Zwitter与M.Soklic二者提供，感谢。该数据集可在UCI数据库中找到。该数据库是加州大学欧文分校提出的用于机器学习的数据库，是一个常用的标准测试数据集。该数据集有2大类，9个属性，共286个实例。
提出了一种基于改进的遗传算法的癌症特征基因选择方法,对基本遗传算法的交叉和变异操作加以改进,利用改进后的遗传算法对基因微阵列数据进行特征选择。使用支持向量机对基因子集进行留一交叉验证。实验结果表明,改进后的遗传算法比基本遗传算法在选择特征基因时具有明显的优势。
数据来源：UCI数据库是加州大学欧文分校(UniversityofCaliforniaIrvine)提出的用于机器学习的数据库，这个数据库目前共有335个数据集，其数目还在不断增加。这里用到的是威斯康星州临床科学中心的关于乳腺癌肿…
基于基因表达数据寻找致癌基因,尝试癌症的早期诊断和基因治疗是系统生物学领域的一个经典问题.实际上,许多基因仅仅是在某些类型的中异常表达(高表达或者低表达),而在其它类型的疾病中不异常表达,因此探测基因-的高度相关结构对于癌症病理学的研究有重要意义.
我们先来介绍一下癌症基因组里的clonal和subclonal的概念。.癌症里的clonal演化概念由Nowell1976年在Science里提出来的（Science.1976Oct1;194(4260):23-8.），他假设人体的某个体细胞发生突变后经历了数个clonal扩增（演化）过程，最终这个含突变的体细胞集群就演化成了...
本篇博客主要是关于用attractorlandscape对疾病分析及其逆向应用——药物研发的一个总结，主要基于5篇论文，3篇KAIST的2015-2017的分析结直肠癌的论文，一篇Regan的应用型论文及一篇有关attractorlandscape用于药物发现的2019年的综述。
博客首页-文章-博客-正文文献解读丨纯生信分析没搞头了？多组学分析告诉你怎么发22分...此外，miR-486-5p和miR-451a在miRNA聚类3中丰富，而cluster-4中miR-142、miR-150、miR-21、miR-29b、miR-146b和miR-155表达较高。而在亚型1中，定位...
这是100篇重要的自然语言处理（NLP）论文的列表，认真研究该领域的学生和研究人员可能应该了解和阅读。此列表由MasatoHagiwara编制。
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