YangShanghaiJiaoTongUnive嚣ity/Bi伊XInstitutesExpertDr.WeidongLiPmfessOrShanghaiJiaoTongUniversityAssociateSchool本文围绕高通量基因组数据处理、分析方法等展开了一系列研究,并取得了以下研究结果。
论文首先建立了基于流式分选-测序(FACS-seq)高通量分析的完整实验操作流程和数据分析框架,在该框架下对包含1450个成员的tnaC突变文库在多个色氨酸浓度下的响应特性进行了测量。
新一代高通量RNA测序数据的处理与分析综述与专论Reviewsand.pdf,ReviewsandMonographs综述与专论生物化学与生物物理进展ProgressinBiochemistryandBiophysics2010,37(8):834~846新一代高通量RNA测序数据的处理与分析*1)1)1,2)1...
塔斯马尼亚语用于分析来自DNA样本的高通量测序数据中参考错配的工具。与其他工具不同,它能够评估与指定区域重叠的读取部分(例如重复)目标主要目标是识别可能混淆SNP或其他应该或不应该与生物学结果相关的变异的系统错配。由于我…
案例2:高通量测序与结直肠癌ErikaVacchelli,etal.Chemotherapy-inducedantitumorimmunityrequiresformylpeptidereceptor1,Science,aad0779.该文通过对KRAS正常的结直肠癌病人的样本进行了高通量测序分析,检测单抗治疗(包括帕尼单抗和西妥昔单
现在的确又不少研究单位和公司开办关于生物信息学、二代测序数据分析等等之类的培训班,说实在这个培训班的效果有多大,确实不好说。但我个人认为,多数这类培训班都是针对生物信息刚入门的学员。因为现在高通量测序确实很普遍,很多传统做湿实验(做生物信息数据分析的实验常被称为干...
高通量测序中,由于测序数据量巨大,就需要对数据进行全方位各个层面的质控。下面我们先说下测序深度相关的内容。测序深度指测序数据与参考基因组比对后,设计的目标区域上某一碱基一共被测序了多少次,通常称为…
目前二代高通量技术的研究非常火热,农学、医学、生态等行业许多研究者已经用或即将用靶基因测序或者宏基因组测序技术检测项目的样本。由于二代高通量技术是一项多学科交叉的领域,许多老师对该原理及过程不是很了解。之前看过浙江大学医学院李昂老师,写的《高通量测序数据分析微生态...
本论文做了如下几件工作:调研了高通量测序数据集的存储格式,以及现有的压缩算法。分析了测序数据的生物特性,同时通过分析表明,对质量分数的有损压缩,在提高压缩性能的同时,在下游分析中还能保持较好(有时甚至更优)的性能。
长链非编码RNA(LncRNA)是指长度大于200个核苷酸的非编码RNA。.LncRNA的研究近年来很火,大概是从2010年开始以迅猛之势增长,今年LncRNA相关的研究可能突破1000篇。.从国自然申请中不难看出,LncRNA是一个热门的申请领域。.从2011年开始,国自然申请中与LncRNA相关...
YangShanghaiJiaoTongUnive嚣ity/Bi伊XInstitutesExpertDr.WeidongLiPmfessOrShanghaiJiaoTongUniversityAssociateSchool本文围绕高通量基因组数据处理、分析方法等展开了一系列研究,并取得了以下研究结果。
论文首先建立了基于流式分选-测序(FACS-seq)高通量分析的完整实验操作流程和数据分析框架,在该框架下对包含1450个成员的tnaC突变文库在多个色氨酸浓度下的响应特性进行了测量。
新一代高通量RNA测序数据的处理与分析综述与专论Reviewsand.pdf,ReviewsandMonographs综述与专论生物化学与生物物理进展ProgressinBiochemistryandBiophysics2010,37(8):834~846新一代高通量RNA测序数据的处理与分析*1)1)1,2)1...
塔斯马尼亚语用于分析来自DNA样本的高通量测序数据中参考错配的工具。与其他工具不同,它能够评估与指定区域重叠的读取部分(例如重复)目标主要目标是识别可能混淆SNP或其他应该或不应该与生物学结果相关的变异的系统错配。由于我…
案例2:高通量测序与结直肠癌ErikaVacchelli,etal.Chemotherapy-inducedantitumorimmunityrequiresformylpeptidereceptor1,Science,aad0779.该文通过对KRAS正常的结直肠癌病人的样本进行了高通量测序分析,检测单抗治疗(包括帕尼单抗和西妥昔单
现在的确又不少研究单位和公司开办关于生物信息学、二代测序数据分析等等之类的培训班,说实在这个培训班的效果有多大,确实不好说。但我个人认为,多数这类培训班都是针对生物信息刚入门的学员。因为现在高通量测序确实很普遍,很多传统做湿实验(做生物信息数据分析的实验常被称为干...
高通量测序中,由于测序数据量巨大,就需要对数据进行全方位各个层面的质控。下面我们先说下测序深度相关的内容。测序深度指测序数据与参考基因组比对后,设计的目标区域上某一碱基一共被测序了多少次,通常称为…
目前二代高通量技术的研究非常火热,农学、医学、生态等行业许多研究者已经用或即将用靶基因测序或者宏基因组测序技术检测项目的样本。由于二代高通量技术是一项多学科交叉的领域,许多老师对该原理及过程不是很了解。之前看过浙江大学医学院李昂老师,写的《高通量测序数据分析微生态...
本论文做了如下几件工作:调研了高通量测序数据集的存储格式,以及现有的压缩算法。分析了测序数据的生物特性,同时通过分析表明,对质量分数的有损压缩,在提高压缩性能的同时,在下游分析中还能保持较好(有时甚至更优)的性能。
长链非编码RNA(LncRNA)是指长度大于200个核苷酸的非编码RNA。.LncRNA的研究近年来很火,大概是从2010年开始以迅猛之势增长,今年LncRNA相关的研究可能突破1000篇。.从国自然申请中不难看出,LncRNA是一个热门的申请领域。.从2011年开始,国自然申请中与LncRNA相关...