VISUALIZINGDATAUSINGT-SNE2.StochasticNeighborEmbeddingStochasticNeighborEmbedding(SNE)startsbyconvertingthehigh-dimensionalEuclideandis-tancesbetweendatapointsintoconditionalprobabilitiesthatrepresentsimilarities.1Thesimilarityofdatapointxjtodatapointxiistheconditionalprobability,pjji,thatxiwouldpickxjasitsneighbor
言归正传,为了顺利毕业,还是需要往大论文里添加一些必要得东西滴,例如TSNE,具体代码如下(声明:此代码忘了是从那个大佬帖子里黏贴来的,经过我的修改可以运用到我的数据了)#-*-coding:utf-8-*-"""CreatedonSunJul407:53:272021@author:1...
本次教程为大家带来是,是如何根据表达谱数据,通过运用tSNE分析的方法,显示样本与样本之间的差异性。.1.R包加载和数据入读.首先我们加载需要用到的R包,ggpubr和ggthemes包用于作图,Rtsne包用于计算tSNE。.读入表达谱数据并显示文件前6行,每一列为一个...
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