西北师范大学博士学位论文卟啉分子结构与性质的理论研究姓名:孟繁夫申请学位级别:博士专业:分析化学指导教师:卢小泉2008-06卟啉及其金属配合物是一类具有刚性大环共轭体系的分子,生命体内存在的卟啉分子,其核心结构是卟啉的金属配合物。
我认为这篇论文提到的模型,可以对计算机分子设计模拟进行一个补足,好像人们只关注下游,而这篇文章给出了一个上游话题——在研究性质与结构方面,能否效率更高?哪些特征的分子才有共同的某类感官特征呢?什么样的结构具有焦烤香?
在目前来说,定义分子相似性的算法仍然比较困难,通常需要根据不同的研究目的和分子特点,选择不同的分子相似性指标和算法。本课题中,我们使用根据Tanimoto(也称Jaccard)系数计算法[45]改写的程序来进行分子相似性的计算。
同样,计算分子3与分子1的作用为取计算系统的分液晶分子5cb的分子动力学模拟盒中的分子1。14图2.1二维周期性粒子的移动Fig.2.1planarperiodicparticles因为在计算中利用最近镜像的观念,因此需采用截断半径的方法计算远程的作用力,否则会因重复计算粒子所受的力而导致不正确的结果。
利用人工智能技术进行小分子设计以及新药研发是制药领域的热点研究问题之一。人工智能技术有望缩短药物研发时间,减少药物研发成本。近日,国际计算化学领域著名期刊WIREs系列刊物《WIREsComputationalMolecul…
3.5工作过程(分子模拟计算项目管理力学)在解决实际问题的时候应用蒙特·卡罗方法主要有两部分工作:1.用蒙特·卡罗方法模拟某一过程时,需要产生某一概率分布的随机变量。2.用统计方法把模型的数字特征估计出来,从而得到实际问题的数值解。
在进入二十一世纪以来,计算机技术的发展速度更加突飞猛进。当下计算机技术的发展主要有四个特点,分别是多极化、智能化、网络化和多媒体化。下面是学习啦小编给大家推荐的计算机技术的发展研究论文,希望大家喜欢!计算机技术的发展研究论文篇一《新形势下计算机技术的发展趋势研究...
其计算可以简单的分为三个步骤(1)首先确定药物分子的活性构象,再按一定的规则(一般为骨架叠加或场叠加)进行药物分子的叠合;(2)然后,在叠合好的分子周围定义一定的步长均匀划分产生格点,在每个格点上用一个探针离子来评价格点上的分子场
分子指纹就是一种分子的抽象表征,它将分子转化(编码)为一系列比特串(即比特向量,bitvector,见Figure1.),然后可以很容易地在分子之间进行比较。典型的流程是将提取分子的结构特征、然后哈希(Hashing)生成比特向量。
目前药物分子表征形式主要表现为基于序列的一维表示、基于分子指纹以及分子图的二维表示,然而,这些方法忽略了分子的三维结构信息,从而限制了模型准确学习和提取相关特征的能力。本文提出了基于spatial-t…
西北师范大学博士学位论文卟啉分子结构与性质的理论研究姓名:孟繁夫申请学位级别:博士专业:分析化学指导教师:卢小泉2008-06卟啉及其金属配合物是一类具有刚性大环共轭体系的分子,生命体内存在的卟啉分子,其核心结构是卟啉的金属配合物。
我认为这篇论文提到的模型,可以对计算机分子设计模拟进行一个补足,好像人们只关注下游,而这篇文章给出了一个上游话题——在研究性质与结构方面,能否效率更高?哪些特征的分子才有共同的某类感官特征呢?什么样的结构具有焦烤香?
在目前来说,定义分子相似性的算法仍然比较困难,通常需要根据不同的研究目的和分子特点,选择不同的分子相似性指标和算法。本课题中,我们使用根据Tanimoto(也称Jaccard)系数计算法[45]改写的程序来进行分子相似性的计算。
同样,计算分子3与分子1的作用为取计算系统的分液晶分子5cb的分子动力学模拟盒中的分子1。14图2.1二维周期性粒子的移动Fig.2.1planarperiodicparticles因为在计算中利用最近镜像的观念,因此需采用截断半径的方法计算远程的作用力,否则会因重复计算粒子所受的力而导致不正确的结果。
利用人工智能技术进行小分子设计以及新药研发是制药领域的热点研究问题之一。人工智能技术有望缩短药物研发时间,减少药物研发成本。近日,国际计算化学领域著名期刊WIREs系列刊物《WIREsComputationalMolecul…
3.5工作过程(分子模拟计算项目管理力学)在解决实际问题的时候应用蒙特·卡罗方法主要有两部分工作:1.用蒙特·卡罗方法模拟某一过程时,需要产生某一概率分布的随机变量。2.用统计方法把模型的数字特征估计出来,从而得到实际问题的数值解。
在进入二十一世纪以来,计算机技术的发展速度更加突飞猛进。当下计算机技术的发展主要有四个特点,分别是多极化、智能化、网络化和多媒体化。下面是学习啦小编给大家推荐的计算机技术的发展研究论文,希望大家喜欢!计算机技术的发展研究论文篇一《新形势下计算机技术的发展趋势研究...
其计算可以简单的分为三个步骤(1)首先确定药物分子的活性构象,再按一定的规则(一般为骨架叠加或场叠加)进行药物分子的叠合;(2)然后,在叠合好的分子周围定义一定的步长均匀划分产生格点,在每个格点上用一个探针离子来评价格点上的分子场
分子指纹就是一种分子的抽象表征,它将分子转化(编码)为一系列比特串(即比特向量,bitvector,见Figure1.),然后可以很容易地在分子之间进行比较。典型的流程是将提取分子的结构特征、然后哈希(Hashing)生成比特向量。
目前药物分子表征形式主要表现为基于序列的一维表示、基于分子指纹以及分子图的二维表示,然而,这些方法忽略了分子的三维结构信息,从而限制了模型准确学习和提取相关特征的能力。本文提出了基于spatial-t…