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摘要转录组测序（RNA-Seq）作为一种新的高效、快捷的转录组研究手段正在改变着人们对转录组的认识。RNA-Seq利用高通量测序技术对组织或细胞中所有RNA反转录而成cDNA文库进行测序，通过统计相关读段(reads)数计算…
在RNA-seq项目中，常见的结果包括：火山图、韦恩图、聚类热图、log2(ratios)折线图、有向无环图、散点图、代谢通路图、蛋白互作图等。今天我们先来一起学习火山图、韦恩图、聚类热图和折线图的解读。1、火山图RNA-seq中，火山图（VolcanoPlot）显示了两个重要的指标：foldchange和校正后的pvalue...
转录组入门（2）：读文章拿到测序数据本系列课程学习的文章是：AKAP95regulatessplicingthroughscaffoldingRNAsandRNAprocessingfactors.NatCommun2016Nov8;7:13347.
通过链特异性RNA-Seq建库，对下机rawdata进行过滤后，75.20–86.60%cleanreads能够比对上山羊参考基因组（CHIR_1.0,NCBI）。再通过生信流程分析鉴定到3515个intergeniclncRNAs（88.29%）和466个anti-senselncRNAs（11.71%）转录本，对应2739个lncRNAgenes。
单细胞测序技术这么热门，我们肯定不能错过，特此总结了8篇文献让童鞋们更好了解研究它：.1、NatRevNephrol杂志上今年5月22号发表的综述，主题是单细胞RNA测序在发育、生理和疾病研究中的应用，主要介绍了单细胞测序技术的流程、不同单细胞捕获方法...
在本研究中，研究人员联合使用了单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNAscope多重荧光检测技术、类器官培养、细菌感染模型、寄生虫感染模型和其他技术，揭示了ISCs与Th细胞的相互作用以及对于肠上皮细胞维持的影响。.发现了一类表达MHCII的ISCs具有向辅助性T...
该论文利用大规模mRNA原位杂交和RNAseq技术，首次构建了小鼠海马基因表达精细图谱（HippocampusGeneExpressionAtlas,HGEA），发现了小鼠海马体四个区域不同亚区域的分子异质性，进一步完善了海马体的经典轮廓，为进一步治疗包括阿尔茨海默症
相关专题随着ncbi数据库各种资源的涌现，NCBI已经成为科研工作者必不可少的资料查找，数据分析的工具。那么NCBI数据如何使用，新手入门一步一步教你认识和使用NCBI数据库。一综合数据库NCBI数据库集美国国立生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation)，即我们...
RNAseq文库准备的成功依赖于每个阶段的精心控制，本文介绍创建RNAseq文库的前两个阶段(步骤1-3)。.1)RNA分离.2)RN段化.3)反转录.4)cDNA高通量(下一代)测序.5)insilico序列比对.起始物的准备.与任何大规模、多阶段的实验一样，起始材料的质量至关重要...
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