深度覆盖的蛋白质组定性定量分析新方法.张玉奎.【摘要】:正对生命活动的功能执行体——蛋白质进行深入系统的研究不仅可以全景式地揭示生命活动的本质,而且发现的关键蛋白质对于揭示疾病的发生发展机理,以及建立相应的诊疗方法具有重要意义。.然而...
所谓定量蛋白质组学(quantitativeproteomics),即对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂的混合物体系中所有蛋白质进行精确的定量和鉴定学科的诞生,标志蛋白质组研究已从静态的定性分析过渡到动态变化的定量研究上来。
针对以上问题,本论文建立了面向复杂蛋白质组的非标记定量分析方法,并在定量分析的基础上有效的结合复杂蛋白质组的功能分析。.具体工作如下:·以NSAF算法为基础,建立结合共享肽的优化算法,能够克服对低丰度蛋白质的错误估计;·建立检出谱图与总离子数...
蛋白质样品提、胶内酶解、溶液内酶解、肽段脱盐、分离等样品前处理方法。贾书召,华中农业大学硕士,助理工程师,主要负责蛋白质样本前处理、质谱上机、数据分析等,在鉴定蛋白质学、定量蛋白质学、蛋白质的翻译后修饰及其定量等研究领域积累
1、凯氏定氮及分光光度法蛋白质定量分析利用蛋白质含氮量进行检测的经典方法,定量精准,但操作繁琐,仅用于标定蛋白质标准品和校正其他测定方法。凯氏定氮法有半微量法、微量法及全量法。样品与H2SO4一同加热消化…
蛋白质组学数据分析笔记说明前言之前本来打算根据自己对蛋白质组学数据分析的经验和理解写一系列相关教程出来供复习参考,没想到在网上查到别人已经做过了,而且笔记相当全面,从样本处理到质谱仪原理再到数据分析等等都有提及,虽然是2016-2017年的课程,但内容并未过时,对我自己也...
4.蛋白质组学数据分析基础(1)4.蛋白质组学数据分析基础(2)4.蛋白质组学数据分析基础(3)课程介绍1.授课教师库鑫博士,2007年毕业于华中科技大学同济医学院,获学士学位。同年9月被保送至中科院上海药物研究所并于2010年取得硕士学位。
DEP为蛋白质组数据分析提供了一个可靠的分析流程,它需要由原始质谱数据的定量分析软件(如MaxQuant或IsobarQuant)生成的结果文件作为输入(例如txt文件),包含了数据预处理、数据过滤、缺失值计算、差异分析等功能。同时提供可视化工具来探索...
乳与乳制品中主要乳清蛋白组分的定量分析检测方法研究.【摘要】:乳清蛋白作为蛋白质源和他特有的生物学功能,被广泛应用于乳制品和食品中,在这些食品过程中一般会使用不同程度的热处理。.而这些热处理过程不可避免地会导致乳清蛋白主要功能...
在蛋白质组学研究中,如果使用高通量方法会得到大量蛋白质数据,这就需要采用生物信息学的方法进行处理.这里介绍一篇文章,希望能起到抛砖引玉的作用,让大家讨论一下还可以用那些方法进行生物信息学处理.在这篇论文中,应用了合并2种检索,非标记定量...
深度覆盖的蛋白质组定性定量分析新方法.张玉奎.【摘要】:正对生命活动的功能执行体——蛋白质进行深入系统的研究不仅可以全景式地揭示生命活动的本质,而且发现的关键蛋白质对于揭示疾病的发生发展机理,以及建立相应的诊疗方法具有重要意义。.然而...
所谓定量蛋白质组学(quantitativeproteomics),即对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂的混合物体系中所有蛋白质进行精确的定量和鉴定学科的诞生,标志蛋白质组研究已从静态的定性分析过渡到动态变化的定量研究上来。
针对以上问题,本论文建立了面向复杂蛋白质组的非标记定量分析方法,并在定量分析的基础上有效的结合复杂蛋白质组的功能分析。.具体工作如下:·以NSAF算法为基础,建立结合共享肽的优化算法,能够克服对低丰度蛋白质的错误估计;·建立检出谱图与总离子数...
蛋白质样品提、胶内酶解、溶液内酶解、肽段脱盐、分离等样品前处理方法。贾书召,华中农业大学硕士,助理工程师,主要负责蛋白质样本前处理、质谱上机、数据分析等,在鉴定蛋白质学、定量蛋白质学、蛋白质的翻译后修饰及其定量等研究领域积累
1、凯氏定氮及分光光度法蛋白质定量分析利用蛋白质含氮量进行检测的经典方法,定量精准,但操作繁琐,仅用于标定蛋白质标准品和校正其他测定方法。凯氏定氮法有半微量法、微量法及全量法。样品与H2SO4一同加热消化…
蛋白质组学数据分析笔记说明前言之前本来打算根据自己对蛋白质组学数据分析的经验和理解写一系列相关教程出来供复习参考,没想到在网上查到别人已经做过了,而且笔记相当全面,从样本处理到质谱仪原理再到数据分析等等都有提及,虽然是2016-2017年的课程,但内容并未过时,对我自己也...
4.蛋白质组学数据分析基础(1)4.蛋白质组学数据分析基础(2)4.蛋白质组学数据分析基础(3)课程介绍1.授课教师库鑫博士,2007年毕业于华中科技大学同济医学院,获学士学位。同年9月被保送至中科院上海药物研究所并于2010年取得硕士学位。
DEP为蛋白质组数据分析提供了一个可靠的分析流程,它需要由原始质谱数据的定量分析软件(如MaxQuant或IsobarQuant)生成的结果文件作为输入(例如txt文件),包含了数据预处理、数据过滤、缺失值计算、差异分析等功能。同时提供可视化工具来探索...
乳与乳制品中主要乳清蛋白组分的定量分析检测方法研究.【摘要】:乳清蛋白作为蛋白质源和他特有的生物学功能,被广泛应用于乳制品和食品中,在这些食品过程中一般会使用不同程度的热处理。.而这些热处理过程不可避免地会导致乳清蛋白主要功能...
在蛋白质组学研究中,如果使用高通量方法会得到大量蛋白质数据,这就需要采用生物信息学的方法进行处理.这里介绍一篇文章,希望能起到抛砖引玉的作用,让大家讨论一下还可以用那些方法进行生物信息学处理.在这篇论文中,应用了合并2种检索,非标记定量...