代谢物组经过一系列专业检测后,应该会得到一个类似于基因表达的矩阵,接着就这矩阵数据进行分析。根据检测方法不同,前期数据的处理方法可能略有不同,本文选用absoluteIDQp180kit(massspectrometry质谱原…
代谢组学数据分析可分几个步骤:对检测得到的原始数据进行数据预处理、数据质控、代谢物定性定量、通过生信分析挖掘数据。|数据预处理通过软件解析色谱和质谱得到的图谱转变为可计算的数据文件,即得到原始数据后,为了消除存在的外在或人为的干扰因素,需要预处理增加数据的稳定性。
代谢组学研究的典型数据库包含数十或数百个谱,其中每个谱由数千个数据点组成。在代谢组学研究中,将数据以表格的形式呈现是很方便的,其中每一行对应于分析实验,每一列对应于该实验中的单个测量量,通常是单个谱峰强度。
一、样本量不大且只做代谢组学并直接发文章.根据实验设计的具体不同以及选用的代谢组学方法的差异,可以发2-5分(也有少数情况大于5分的),案例如下:.1、IdentificationandQuantitationofUniqueFattyAcidOxidationProductsinHuman…
代谢组学常见问题(五):数据处理和分析相关基础篇.Q:非靶向代谢组学发现没有差异,该怎么办?.A:首选需要确定这是这是否是合理的结果,即需要逐步自查:第一步确认样本处理、收集、储存和运输是否出现异常情况。.第二步检查待测样本的前处理...
代谢组学是目前关注度颇高的组学方向:其一,大家普遍认可代谢物是反映生物表型、状态的最有效分子;其二,代谢物被认为是功能分子、信号分子,其慢慢与功能组相挂钩;其三,肠道微生物等新兴研究热点的带动。在…
这里我们从非靶向代谢组学下机数据开始讲起,如下图所示:.Fig2非靶向代谢组学实验及数据分析的一般流程.质谱技术运用到的主要是液相色谱质谱联用和气相色谱质谱联用技术,根据分析的性质不同而定。.那么非靶向代谢组学的测定平台主…
基因组学告诉你可能发生什么,转录组学和蛋白组学告诉你即将发生什么,而代谢组学告诉你正在发生什么!不同的组学之间除了有巨大差别,也有共通点,既相互又互有联系,这也是近两年多组合分析比较火的原因之一。
生物信息学早已不再局限于基因组学领域了,后基因组学越来越受到关注,并且这几年“多组学”的也研究越来越多。其中,代谢组学是相对比较年轻的一门学科,“代谢组”(metabolome)的概念于1998第一次被提出。基因组学和转录组学是生物信息的上游,更多的体现的是生物活动的内在本质因素...
3分钟带你看懂代谢组学研究中常用的“套路”代谢组学来源:生物谷2017-08-2415:12上一周谷君给大家介绍了“未来5年生命科学热门研究领域...
代谢物组经过一系列专业检测后,应该会得到一个类似于基因表达的矩阵,接着就这矩阵数据进行分析。根据检测方法不同,前期数据的处理方法可能略有不同,本文选用absoluteIDQp180kit(massspectrometry质谱原…
代谢组学数据分析可分几个步骤:对检测得到的原始数据进行数据预处理、数据质控、代谢物定性定量、通过生信分析挖掘数据。|数据预处理通过软件解析色谱和质谱得到的图谱转变为可计算的数据文件,即得到原始数据后,为了消除存在的外在或人为的干扰因素,需要预处理增加数据的稳定性。
代谢组学研究的典型数据库包含数十或数百个谱,其中每个谱由数千个数据点组成。在代谢组学研究中,将数据以表格的形式呈现是很方便的,其中每一行对应于分析实验,每一列对应于该实验中的单个测量量,通常是单个谱峰强度。
一、样本量不大且只做代谢组学并直接发文章.根据实验设计的具体不同以及选用的代谢组学方法的差异,可以发2-5分(也有少数情况大于5分的),案例如下:.1、IdentificationandQuantitationofUniqueFattyAcidOxidationProductsinHuman…
代谢组学常见问题(五):数据处理和分析相关基础篇.Q:非靶向代谢组学发现没有差异,该怎么办?.A:首选需要确定这是这是否是合理的结果,即需要逐步自查:第一步确认样本处理、收集、储存和运输是否出现异常情况。.第二步检查待测样本的前处理...
代谢组学是目前关注度颇高的组学方向:其一,大家普遍认可代谢物是反映生物表型、状态的最有效分子;其二,代谢物被认为是功能分子、信号分子,其慢慢与功能组相挂钩;其三,肠道微生物等新兴研究热点的带动。在…
这里我们从非靶向代谢组学下机数据开始讲起,如下图所示:.Fig2非靶向代谢组学实验及数据分析的一般流程.质谱技术运用到的主要是液相色谱质谱联用和气相色谱质谱联用技术,根据分析的性质不同而定。.那么非靶向代谢组学的测定平台主…
基因组学告诉你可能发生什么,转录组学和蛋白组学告诉你即将发生什么,而代谢组学告诉你正在发生什么!不同的组学之间除了有巨大差别,也有共通点,既相互又互有联系,这也是近两年多组合分析比较火的原因之一。
生物信息学早已不再局限于基因组学领域了,后基因组学越来越受到关注,并且这几年“多组学”的也研究越来越多。其中,代谢组学是相对比较年轻的一门学科,“代谢组”(metabolome)的概念于1998第一次被提出。基因组学和转录组学是生物信息的上游,更多的体现的是生物活动的内在本质因素...
3分钟带你看懂代谢组学研究中常用的“套路”代谢组学来源:生物谷2017-08-2415:12上一周谷君给大家介绍了“未来5年生命科学热门研究领域...