很多科研人员做完代谢组学拿到结果之后经常有一个困惑:下一步应该怎么办?(文末有福利)其实这个问题不是做完之后才来想的,而是在做之前就需要考虑到。整体的实验设计肯定是走在所有步骤之前。而代谢物因种类繁…
代谢组学数据分析可分几个步骤:对检测得到的原始数据进行数据预处理、数据质控、代谢物定性定量、通过生信分析挖掘数据。|数据预处理通过软件解析色谱和质谱得到的图谱转变为可计算的数据文件,即得到原始数据后,为了消除存在的外在或人为的干扰因素,需要预处理增加数据的稳定性。
氨基酸、短链脂肪酸、胆汁酸和广筛到底应该检测什么?代谢组学和微生物组学怎么「联合分析」测了两个组学就一定要联合分析吗,如果不联合分析还需要做代谢组吗?代谢组学和微生物组学的「联用」和「联合分析」区别是什么?
本人有一篇关于代谢组学的文章,是针对正常人组和某种心血管疾病组的临床血样的代谢组学研究,分析了biomarkers和相关通路,数据没有太多,不涉及给药组,也没有创新性。先后投了BiomedicalChromatography...
代谢组学是目前关注度颇高的组学方向:其一,大家普遍认可代谢物是反映生物表型、状态的最有效分子;其二,代谢物被认为是功能分子、信号分子,其慢慢与功能组相挂钩;其三,肠道微生物等新兴研究热点的带动。在…
第9页的第一段我写的就是关于代谢组学中正常组和模型组建立PLS-DA模型得分图,载荷图和S-plot的过程,图3和图4分别为在正离子和负离子模式下,正常组和模型组之间的得分图,载荷图和S-plot。我就不明白这个reviewer说的“statisticallydifferent"是什么意思
多组学结合的研究方式,现在越来越受到科研人员的青睐,也可以说是发高分文章的一条快速路。今天给大家分享如何用蝴蝶图展示不同类型代谢物的差异情况。以下文章来源于红皇后学术,作者红…
组学大讲堂关注赞赏支持转录组文章怎么写能发2区文章?随着测序成本的下降,转录组测序已经逐步成为分子生物学实验的标配,每年有大量的数据产出,这也导致了转录组测序分析的文章越来…
生物信息学早已不再局限于基因组学领域了,后基因组学越来越受到关注,并且这几年“多组学”的也研究越来越多。其中,代谢组学是相对比较年轻的一门学科,“代谢组”(metabolome)的概念于1998第一次被提出。基因组学和转录组学是生物信息的上游,更多的体现的是生物活动的内在本质因素...
MetaboAnalyst是做代谢的R包,功能十分强大。也开发了web版本,代谢组学的分析这里不介绍,主要讲讲它开发的多组学分析的相关内容。既然是做代谢的工具,即使是增加了多组学内容,肯定也是以代谢为核心。以代谢组为中心的多组学分析想想无...
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代谢组学数据分析可分几个步骤:对检测得到的原始数据进行数据预处理、数据质控、代谢物定性定量、通过生信分析挖掘数据。|数据预处理通过软件解析色谱和质谱得到的图谱转变为可计算的数据文件,即得到原始数据后,为了消除存在的外在或人为的干扰因素,需要预处理增加数据的稳定性。
氨基酸、短链脂肪酸、胆汁酸和广筛到底应该检测什么?代谢组学和微生物组学怎么「联合分析」测了两个组学就一定要联合分析吗,如果不联合分析还需要做代谢组吗?代谢组学和微生物组学的「联用」和「联合分析」区别是什么?
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